بررسی بیوانفورماتیکی توالی آمینواسیدی HMW- گلوتنین در گندم نان رقم آذر 2

گندم اولین غله و مهمترین گیاه زراعی دنیاست. کیفیت گندم نان تحت تاثیر محتوای پروتئین و نشاسته دانه است که خواص آرد و خمیر را در فرایند پخت نان تعیین می کنند. ترکیب کلیدی آندوسپرم شامل پروتئین های گلوتن است. گلوتن ترکیبی از دو گلیکوپروتئین گلیادین gliadin و گلوتلین glutelin می باشد که متصل با نشاسته در آندوسپرم (بافت تغذیه ای اطراف جوانه) بسیاری از غلات علوفه ای حضور دارند. گلیادین از پروتئین های پرولامینی prolamins می باشد و گلوتلین حدود 80 درصد محتوای پروتئینی دانه گندم را تشکیل میدهند. بیشتر دسته بندی های عمومی توالی آمینواسیدی HMW- گلوتنین به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می آید. روش های بیو انفورماتیکی روش های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می باشند. در این تحقیق جهت مطالعه توالی آمینواسیدی HMW- گلوتنین از گونه گندم رقم آذر 2 استفاده شد. برای شناسایی اعضاء این خانواده ژنی در گندم، جستجوی چندگانه در پایگاه های اطلاعاتی NCBI و BlasN و BlastX بررسی شد. براساس نتایج به دست آمده، 92 عضو از خانواده ی ژنی HMW- گلوتنین در گندم یافت شد. برای 67 عضو پیدا شده ساختار حفظ شده خانواده HMW- گلوتنین به طور کامل وجود داشت و برای دیگر اعضاء توالی کامل پروتئین پیدا نشد.

Keywords:

بیوانفورماتیک , پروتئین , HMW- گلوتنین , گندم