ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings
Paper
Title

GADP_align: A hybrid method for structural alignment of proteins using genetic algorithm and dynamic programming techniques

Page: 10 | View: 184 | Review: 0
Year: 1398
COI: CSCG03_244
Language: Englishglish
(This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download)

Download guide

اگر در مجموعه سیویلیکا عضو نیستید، به راحتی می توانید از طریق فرم روبرو اصل این Paper را خریداری نمایید.

برای عضویت در سیویلیکا به صفحه ثبت نام مراجعه نمایید.در صورتی که دارای نام کاربری در مجموعه سیویلیکا هستید، ابتدا از قسمت بالای صفحه با نام کاربری خود وارد شده و سپس به این صفحه مراجعه نمایید.

لطفا قبل از اقدام به خرید اینترنتی این Paper، ابتدا تعداد صفحات Paper را در بالای این صفحه کنترل نمایید.

برای راهنمایی کاملتر راهنمای سایت را مطالعه کنید.

Buy and Download

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این Paper را که دارای 10 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.

قیمت این Paper : 0 تومان

آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

Authors

S Mirzaei - Department of Computer Science, University of Tabriz, Tabriz, Iran
J. Razmara - Department of Computer Science, University of Tabriz, Tabriz, Iran
S Lotfi - Department of Computer Science, University of Tabriz, Tabriz, Iran

Abstract:

Structural comparison and alignment of proteins is one of the fundamental techniques in protein structure analysis. The major step in structural alignment is a search to find the optimal set of correspondence between two structures and optimize the scoring function. One of the most commonly used approaches is an initial guess of the rigid-body transformation followed by an iterative dynamic programming algorithm. These methods use dynamic programming over several initial pairwise alignments, and then, choose the alignment with the best score as the final output. Dynamic programming is an example of the optimization methods that can be successfully combined with metaheuristics such as genetic algorithm. In this paper, we have proposed a hybrid algorithm, namely GADP-align, for pairwise protein structure alignment by combining a genetic algorithm with an iterative dynamic programming. The experimental study shows that the proposed hybrid method produces highly accurate alignments in comparison with the methods using exactly the dynamic programming technique. Further, it is shown that the proposed method prevents the local optimal traps caused by the bad initial guess of the residue equivalences.

Keywords:

Protein structure alignment, genetic algorithm, dynamic programming, bioinformatics

Paper COI Code

برای لینک دهی به این Paper می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت Paper در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/1006183/

How To Citation:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این Paper ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Mirzaei, S و Razmara, J. و Lotfi, S,1398,GADP_align: A hybrid method for structural alignment of proteins using genetic algorithm and dynamic programming techniques,سومین کنفرانس بین المللی محاسبات نرم,رودسر,,,https://civilica.com/doc/1006183

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این Paper اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1398, Mirzaei, S؛ J. Razmara و S Lotfi)
برای بار دوم به بعد: (1398, Mirzaei؛ Razmara و Lotfi)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

Research Info Management

Certificate | Report | من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

اطلاعات استنادی این Paper را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی Paper

مشخصات مرکز تولید کننده این Paper به صورت زیر است:
نوع مرکز: دانشگاه دولتی
تعداد مقالات: 17,570
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مقالات پیشنهادی مرتبط

New Papers

Share this page

More information about COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

Support