Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings
عنوان
Paper

GADP_align: A hybrid method for structural alignment of proteins using genetic algorithm and dynamic programming techniques

تعداد صفحات: 10 | تعداد نمایش خلاصه: 169 | نظرات: 0
سال انتشار: 1398
کد COI Paper: CSCG03_244
زبان Paper: Englishglish
(فایل این Paper در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد)

راهنمای دانلود فایل کامل این Paper

اگر در مجموعه سیویلیکا عضو نیستید، به راحتی می توانید از طریق فرم روبرو اصل این Paper را خریداری نمایید.

با عضویت در سیویلیکا می توانید اصل مقالات را با حداقل ۳۳ درصد تخفیف (دو سوم قیمت خرید تک Paper) دریافت نمایید. برای عضویت در سیویلیکا به صفحه ثبت نام مراجعه نمایید.در صورتی که دارای نام کاربری در مجموعه سیویلیکا هستید، ابتدا از قسمت بالای صفحه با نام کاربری خود وارد شده و سپس به این صفحه مراجعه نمایید.

لطفا قبل از اقدام به خرید اینترنتی این Paper، ابتدا تعداد صفحات Paper را در بالای این صفحه کنترل نمایید.

برای راهنمایی کاملتر راهنمای سایت را مطالعه کنید.

خرید و دانلود فایل Paper

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای 10 صفحه است در اختیار داشته باشید.

قیمت این مقاله : 7,000 تومان

آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان Paper GADP_align: A hybrid method for structural alignment of proteins using genetic algorithm and dynamic programming techniques

S Mirzaei - Department of Computer Science, University of Tabriz, Tabriz, Iran
J. Razmara - Department of Computer Science, University of Tabriz, Tabriz, Iran
S Lotfi - Department of Computer Science, University of Tabriz, Tabriz, Iran

چکیده Paper:

Structural comparison and alignment of proteins is one of the fundamental techniques in protein structure analysis. The major step in structural alignment is a search to find the optimal set of correspondence between two structures and optimize the scoring function. One of the most commonly used approaches is an initial guess of the rigid-body transformation followed by an iterative dynamic programming algorithm. These methods use dynamic programming over several initial pairwise alignments, and then, choose the alignment with the best score as the final output. Dynamic programming is an example of the optimization methods that can be successfully combined with metaheuristics such as genetic algorithm. In this paper, we have proposed a hybrid algorithm, namely GADP-align, for pairwise protein structure alignment by combining a genetic algorithm with an iterative dynamic programming. The experimental study shows that the proposed hybrid method produces highly accurate alignments in comparison with the methods using exactly the dynamic programming technique. Further, it is shown that the proposed method prevents the local optimal traps caused by the bad initial guess of the residue equivalences.

کلیدواژه ها:

Protein structure alignment, genetic algorithm, dynamic programming, bioinformatics

کد Paper/لینک ثابت به این Paper

برای لینک دهی به این Paper می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت Paper در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/1006183/

کد COI Paper: CSCG03_244

نحوه استناد به Paper:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این Paper ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
undefined, undefined و undefined, undefined و undefined, undefined,1398,GADP_align: A hybrid method for structural alignment of proteins using genetic algorithm and dynamic programming techniques,سومین کنفرانس بین المللی محاسبات نرم,Rudsar,,,https://civilica.com/doc/1006183

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این Paper اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1398, Mirzaei, S؛ J. Razmara و S Lotfi)
برای بار دوم به بعد: (1398, Mirzaei؛ Razmara و Lotfi)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

Research Info Management

Certificate | Report Paper
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

Export Citation info of this Paper to research management softwares

علم سنجی و رتبه بندی Paper

مشخصات مرکز تولید کننده این Paper به صورت زیر است:
نوع مرکز: state university
تعداد مقالات: 17,570
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

New Suggested Papers

New RelatedPapers

Share this paper

WHAT IS COI?

COI is a national code dedicated to all Iranian Conference and Journal Papers. the COI of each paper can be verified online.

Support