ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

شناسایی ژن های موثر بر میزان چربی محوطه بطنی جوجه های گوشتی با استفاده از داده های ریزآرایه و توالی یابی RNA

Publish place: IRANIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE، Vol: 50، Issue: 4
Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 639

This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:
https://civilica.com/doc/1015668

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-50-4_001

تاریخ نمایه سازی: 6 خرداد 1399

Abstract:

امروزه انتخاب ژنتیکی برای افزایش رشد و تولید پروتئین حیوانی با کیفیت بالا در جوجه های گوشتی (Gallus gallus domesticus)، معمولا منجر به افزایش وزن بیش از حد خواهد شد که نتیجه آن تاثیر منفی بر راندمان مصرف خوراک و کیفیت لاشه مانند افزایش چربی محوطه بطنی می­شود. هدف این مطالعه استفاده از پروفایل ترانسکریپتوم بافت چربی دو دسته جوجه های گوشتی با چربی زیاد و کم در محوطه بطنی، به منظور شناسایی ژن­های موثر در متابولیسم و ذخیره چربی می­باشد. در تجزیه داده­های ریزآرایه و RNA-seq برای بیان تفاوت ژنی به­ترتیب 2914 و 1867 ژن استخراج شد که در مجموع با مقایسه ژن­های شناسایی­شده که تفاوت بیانی معنی­داری داشتند (000001/0P<)، 1835 ژن شناسایی شد. سپس با مقایسه تعداد ژن مربوطه در میان پروفایل­های ترانسکریپتوم، ژن­های مشترک مرتبط شامل THBS1، COLEC12، ANXA7، RGS19، TMEM258 و HTR7L بودند که در فرآیند اصلی مسیرهای کنترل سنتز، متابولیسم و ذخیره چربی و مسیر سیگنالینگ غدد درون­ریز فعال شده توسط آدیپوکین­ها دارای نقش می­باشند. تجزیه و تحلیل ترانسکریپتوم مرتبط با ذخیره چربی محوطه بطنی می­تواند بیان­کننده نقش آن به عنوان یک اندام متابولیک و درون­ریز در جوجه های گوشتی باشد.

Keywords:

Authors

فرزاد غفوری

دانشجوی کارشناسی ارشد، ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

مصطفی صادقی

دانشیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

ابوالفضل بهرامی

دانشجوی سابق دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

سید رضا میرائی آشتیانی

استاد ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Abdollahi, M. R., Ravindran, V. &amp; Svihus, B. (2013). Pelleting ...
  • Andrews S. (2010). FastQC: a quality control tool for high ...
  • Blankenberg, D., Gordon, A., Von Kuster, G., Coraor, N., Taylor, ...
  • Bolger, A. M., Lohse, M. &amp; Usadel, B. (2014). Trimmomatic: ...
  • Bourneuf, E., Hérault, F., Chicault, C., Carré, W., Assaf, S., ...
  • Burt, D. W. (2007). Emergence of the chicken as a ...
  • Byerly, M. S., Simon, J., Cogburn, L. A., Le Bihan-Duval, ...
  • Caohuy, H. &amp; Pollard, H. B. (2001). Activation of annexin ...
  • Chun, T. H. (2012). Peri-adipocyte ECM remodeling in obesity and ...
  • Cogburn, L. A. (2007). Hepatic transcriptional profiling of juvenile broiler ...
  • Cogburn, L. A., Porter, T. E., Duclos, M. J., Simon, ...
  • Crespo, N. &amp; Esteve- Garcia, E. (2001). Dietary fatty acid ...
  • Davis S, Meltzer P (2007). GEOquery: a bridge between the ...
  • Degenhardt, F., Niklowitz, P., Szymczak, S., Jacobs, G., Lieb, W., ...
  • Dodgson, J. B. (2007). The chicken genome: some good news ...
  • Du, P., Kibbe, W. A. &amp; Lin, S. M. (2008). ...
  • Friedman-Einat, M., Cogburn, L. A., Yosefi, S., Hen, G., Shinder, ...
  • Graham, D. B., Lefkovith, A., Deelen, P., de Klein, N., ...
  • Hassanzadeh, M., Gilanpour, H., Charkhkar, S., Buyse, J. &amp; Decuypere, ...
  • Hermier, D. Q. B. A., Quignard-Boulange, A., Dugail, I., Guy, ...
  • Hoque, M., Rentero, C., Cairns, R., Tebar, F., Enrich, C. ...
  • Hoyer, D., Clarke, D. E., Fozard, J. R., Hartig, P. ...
  • Huang, D. W., Sherman, B. T. &amp; Lempicki, R. A. ...
  • Huang, G. &amp; Greenspan, D. S. (2012). ECM roles in ...
  • Huber, W., Carey, V.J., Gentleman, R., Anders, S., Carlson, M., ...
  • Ikeobi, C. O. N., Woolliams, J. A., Morrice, D. R., ...
  • Inoue, M., Jiang, Y., Barnes, R. H., Tokunaga, M., Martinez-Santibañez, ...
  • Ji, B., Ernest, B., Gooding, J. R., Das, S., Saxton, ...
  • Ji, B., Middleton, J. L., Ernest, B., Saxton, A. M., ...
  • Julian, R. J. (1997). Causes and prevention of ascites in ...
  • Ka, S., Albert, F. W., Denbow, D. M., Pääbo, S., ...
  • Khan, T., Muise, E. S., Iyengar, P., Wang, Z. V., ...
  • Kim, D., Pertea, G., Trapnell, C., Pimentel, H., Kelley, R. ...
  • Le Mignon, G., Pitel, F., Gilbert, H., Le Bihan‐Duval, E., ...
  • Leclercq, B., Blum, J. C. &amp; Boyer, J. P. (1980). ...
  • Leclercq, B., Hermier, D. &amp; Salichon, M. R. (1984). Effects ...
  • Leheska, J. M., Montgomery, J. L., Krehbiel, C. R., Yates, ...
  • Martin, G. R. (1995). Operational characteristics of a 5-HT receptor ...
  • Merkel, M., Loeffler, B., Kluger, M., Fabig, N., Geppert, G., ...
  • Moody, D.E., Hancock, D.L., Anderson. D.B. &amp; Mello, J. P. ...
  • Nilsson, C., Raun, K., Yan, F. F., Larsen, M. O. ...
  • Ohtani, K., Suzuki, Y., Eda, S., Kawai, T., Kase, T., ...
  • Rankinen, T., Zuberi, A., Chagnon, Y. C., Weisnagel, S. J., ...
  • Resnyk, C. W., Carré, W., Wang, X., Porter, T. E., ...
  • Resnyk, C. W., Carré, W., Wang, X., Porter, T. E., ...
  • Resnyk, C. W., Chen, C., Huang, H., Wu, C. H., ...
  • Ritchie, M. E., Phipson, B., Wu, D., Hu, Y., Law, ...
  • Sakomura, N. K., Longo, F. A., Oviedo-Rondon, E. O., Boa-Viagem, ...
  • Simon, J. (1989). Chicken as a usefull species for the ...
  • Simon, J. &amp; Leclercq, B. (1982). Longitudinal study of adiposity ...
  • Simon, J., Milenkovic, D., Godet, E., Cabau, C., Collin, A., ...
  • Stern, C. D. (2005). The chick: a great model system ...
  • Trapnell, C., Williams, B. A., Pertea, G., Mortazavi, A., Kwan, ...
  • Tumova, E. &amp; Teimouri, A. (2010). Fat deposition in the ...
  • Ullmer, C., Schmuck, K., Kalkman, H. O. &amp; Lübbert, H. ...
  • Varma, V., Yao-Borengasser, A., Bodles, A. M., Rasouli, N., Phanavanh, ...
  • Zheng, Q., Zhang, Y., Chen, Y., Yang, N., Wang, X. ...
    • نمایش کامل مراجع