واکاوی بیوانفورماتیکی و فیلوژنی ناحیه 5 UTR ژن نوروپپتید وای (Neuropeptide Y) و ارتباط آن با صفات تولیدی در مرغ بومی فارس
عنوان مقاله: واکاوی بیوانفورماتیکی و فیلوژنی ناحیه 5 UTR ژن نوروپپتید وای (Neuropeptide Y) و ارتباط آن با صفات تولیدی در مرغ بومی فارس
شناسه ملی مقاله: JR_IJAS-49-3_011
منتشر شده در شماره 3 دوره 49 فصل در سال 1397
شناسه ملی مقاله: JR_IJAS-49-3_011
منتشر شده در شماره 3 دوره 49 فصل در سال 1397
مشخصات نویسندگان مقاله:
مهرنسا جمال پور - دانشجوی سابق کارشناسی ارشد اصلاح نژاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
محمد دادپسند - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
هادی آتشی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
علی نیازی - استاد، پژوهشکده زیست فناوری، دانشگاه شیراز
خلاصه مقاله:
مهرنسا جمال پور - دانشجوی سابق کارشناسی ارشد اصلاح نژاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
محمد دادپسند - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
هادی آتشی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
علی نیازی - استاد، پژوهشکده زیست فناوری، دانشگاه شیراز
این پژوهش بهمنظور بررسی فیلوژنی و بیوانفورماتیکی جهش تک نوکلئوتیدی در ناحیه 5 UTR ژن نوروپپتید وای (Neuropeptide Y=NPY) و ارتباط آن با صفات تولید تخممرغ و وزن بدن در مرغان بومی استان فارس، انجام گرفت. از 200 قطعه مرغ بومی ایستگاه پرورش و اصلاحنژاد مرغ بومی استان فارس خونگیری انجام شد. استخراج DNA با روش نمکی انجام شد. جهش تک نوکلئوتیدی ژن NPY با تکنیک PCR-RFLP شناسایی شد. فراوانی آلل های A و B بهترتیب 46/0 و 54/0 برآورد شد و جمعیت مورد مطالعه در تعادل هاردی-واینبرگ نبود. واکاوی آماری نشان داد که، بین چندریختی نوروپپتید وای و صفات مورد مطالعه (شمار تخممرغ، اولین سن تخمگذاری، وزن تخممرغ در 84 هفتگی و وزن بدن در 12 هفتگی) ارتباط معنیداری وجود ندارد. همچنین، واکاوی فیلوژنی نشان داد که ناحیه توالی یابیشده ژن NPY مرغ بومی فارس با اطلاعات توالی های EU447658.1 و EU447659.1 دارای بیشترین شباهت است. نکته قابل توجه در واکاوی فیلوژنی، وجود ژن NPY از گونه بلدرچین بود که می تواند نشان دهنده نقش کلیدی این ژن در تنظیم فرآیندهای فیزیولوژیک محسوب گردد.
کلمات کلیدی: جهش نقطه ای, نوروپپتید وای, ناحیه 5 UTR
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1015719/