شناسایی نواحی تحت انتخاب مثبت در ژنگان اسب های کرد و عرب ایرانی با استفاده از روش مبتنی بر نامتعادلی پیوستگی ژنی

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 325

This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-49-2_014

تاریخ نمایه سازی: 6 خرداد 1399

Abstract:

اسب­های عرب به داشتن عملکرد خوب در مسابقه های استقامتی، پرش و زیبایی شهرت دارند. اسب­های کرد بومی منطقه های کوهستانی غرب ایران، مناسب مسابقه های چوگان هستند. اسب­های کرد، قد کوتاه­تر و وزن سنگین­تری نسبت به اسب­های عرب دارند. در این بررسی آماره XP-EHH که مبتنی بر نامتعادلی پیوستگی ژنی (لینکاژی) است برای شناسایی قطعه های کروموزومی تحت انتخاب در ژنگان (ژنوم) اسب­های کرد و عرب ایرانی استفاده شد. برای این منظور، از نمونه خون و مو 38 اسب عرب و 58 اسب کرد DNA ژنگانی استخراج شد. همه نمونه­ها DNA توسط آرایه Axiom MNEC670 تعیین نژادگان (ژنوتیپ) شدند. پس از پالایش داده ها آماره XP-EHH محاسبه شد. در اسب­های عرب 51 جایگاه (85 ژن) و در اسب های کرد 7 جایگاه (13 ژن) تحت انتخاب شناسایی شد. نواحی تحت انتخاب در اسب­های عرب با مسیرهای درگیر در سامانه ایمنی، تشکیل پروتئین شیر، رشد و نمو و سوخت وساز (متابولیسم) ماهیچه، بینایی، شبکه عصبی و اندازه بدن مرتبط بودند درحالی که در اسب­های کرد با مسیر گیرنده جفت شونده با پروتئین G، رشد و بلوغ فیبرهای ماهیچه، تنظیم خون بندآوری (هموستازی) اکسیژن یاخته ای، رنگدانه­سازی در پوست و مو ارتباط داشتند.

Authors

صابر محمد مقصودی

دانشجوی دکتری، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

حسن مهربانی یگانه

دانشیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

اردشیر نجاتی جوارمی

استاد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Ala Amjadi, M., Mehrabani Yeganheh, H. & Sadeghi, M. (2018). ...
  • Areal, H., Abrantes, J. & Esteves, P. J. (2011). Signatures ...
  • Baysal, B. E., Lawrence, E. C. & Ferrell, R. E. ...
  • Beltrán, N. A. R., Meira, C. T., de Oliveira, H. ...
  • Bimonte, S., De Angelis, A., Quagliata, L., Giusti, F., Tammaro, ...
  • Brinkmann, J., Jagannathan, V., Drogemuller, C., Rieder, S., Leeb, T., ...
  • Capomaccio, S., Cappelli, K., Barrey, E., Felicetti, M., Silvestrelli, M. ...
  • Chang, T. C., Klabnik, J. L. & Liu, W. S. ...
  • Chen, H., Patterson, N. & Reich, D. (2010). Population differentiation ...
  • Chen, M., Pan, D., Ren, H., Fu, J., Li, J., ...
  • Clarkson, P. M. & Sayers, S. P. (1999). Etiology of ...
  • Cole, J. B., Wiggans, G. R., Ma, L., Sonstegard, T. ...
  • Conley, Y. P., Jakobsdottir, J., Mah, T., Weeks, D. E., ...
  • Daub, J. T., Hofer, T., Cutivet, E., Dupanloup, I., Quintana-Murci, ...
  • Dennis, G., Jr., Sherman, B. T., Hosack, D. A., Yang, ...
  • Diamond, J. (2002). Evolution, consequences and future of plant and ...
  • Emond, M. R., Biswas, S. & Jontes, J. D. (2009). ...
  • Gautier, M. & Vitalis, R. (2012). rehh: an R package ...
  • Gharahveysi, S. & Irani, M. (2011). Inbreeding Study on the ...
  • Gu, J., Orr, N., Park, S. D., Katz, L. M., ...
  • Guttridge, D. C. (2011). Making muscles grow by g protein-coupled ...
  • Hayes, B. J., Chamberlain, A. J., Maceachern, S., Savin, K., ...
  • Hensen, E. F. & Bayley, J. P. (2011). Recent advances ...
  • Her, Y. F., Nelson-Holte, M. & Maher, L. J., 3rd. ...
  • Hider, J. L., Gittelman, R. M., Shah, T., Edwards, M., ...
  • Kader, A., Li, Y., Dong, K., Irwin, D. M., Zhao, ...
  • Kang, H. Y., Lee, B., Lee, D. O., Kim, K., ...
  • Kim, H., Lee, T., Park, W., Lee, J. W., Kim, ...
  • Kimura, R., Fujimoto, A., Tokunaga, K. & Ohashi, J. (2007). ...
  • Klein, C. & Troedsson, M. H. (2011). Transcriptional profiling of ...
  • Lester, S. N. & Li, K. (2014). Toll-like receptors in ...
  • Liu, Q., Chen, Y., Kubota, F., Pan, J. J. & ...
  • Liu, X. X., Pan, J. F., Zhao, Q. J., He, ...
  • Ma, Y., Zhang, H., Zhang, Q. & Ding, X. (2014). ...
  • Maghsoodi, S. M., Mehrabani Yeganheh, H., Nejati Javaremi, A. & ...
  • Maurano, M. T., Humbert, R., Rynes, E., Thurman, R. E., ...
  • McGowan, K. A., Li, J. Z., Park, C. Y., Beaudry, ...
  • Metzger, J., Karwath, M., Tonda, R., Beltran, S., Agueda, L., ...
  • Mi, H., Muruganujan, A. & Thomas, P. D. (2013). PANTHER ...
  • Mienaltowski, M. J., Huang, L., Stromberg, A. J. & MacLeod, ...
  • Montague, M. J., Li, G., Gandolfi, B., Khan, R., Aken, ...
  • Moridi, M., Masoudi, A. A., Vaez Torshizi, R. & Hill, ...
  • Mosapour Kaleibar, P., Aghazade, A. M., Hassanpour, A., Mahpeikar, H. ...
  • Oleksyk, T. K., Smith, M. W. & O Brien, S. ...
  • Petersen, J. L., Mickelson, J. R., Rendahl, A. K., Valberg, ...
  • Pickrell, J. K., Coop, G., Novembre, J., Kudaravalli, S., Li, ...
  • Ponsuksili, S., Murani, E., Phatsara, C., Schwerin, M., Schellander, K. ...
  • Qanbari, S., Strom, T. M., Haberer, G., Weigend, S., Gheyas, ...
  • Rafeie, F., Amirinia, C., Nejati Javaremi, A., Mirhoseini, S. Z. ...
  • Roll, P., Rudolf, G., Pereira, S., Royer, B., Scheffer, I. ...
  • Rothammer, S., Seichter, D., Forster, M. & Medugorac, I. (2013). ...
  • Sabeti, P. C., Schaffner, S. F., Fry, B., Lohmueller, J., ...
  • Sabeti, P. C., Varilly, P., Fry, B., Lohmueller, J., Hostetter, ...
  • Scheet, P. & Stephens, M. (2006). A fast and flexible ...
  • Sokol, C. L. & Luster, A. D. (2015). The chemokine ...
  • Taye, M., Kim, J., Yoon, S. H., Lee, W., Hanotte, ...
  • Taye, M., Lee, W., Jeon, S., Yoon, J., Dessie, T., ...
  • Taye, M., Yoon, J., Dessie, T., Cho, S., Oh, S. ...
  • Uniacke-Lowe, T., Huppertz, T. & Fox, P. F. (2010). Equine ...
  • Utsunomiya, Y. T., Perez O Brien, A. M., Sonstegard, T. ...
  • Utsunomiya, Y. T., Perez O Brien, A. M., Sonstegard, T. ...
  • Vafaei Sayah, G. & Mehrannezhad, R. (2005). Cytogenetical study of ...
  • Vernot, B., Stergachis, A. B., Maurano, M. T., Vierstra, J., ...
  • Wu, H., Zhao, S. & Fan, B. (2010). Investigation of ...
  • Yousefi Mashouf, N. (2016). Phenotypic and genetic characterization of the ...
  • Yu, W., Dong, S., Zhao, C., Wang, H., Dai, F. ...
  • Zandi, A., Nejati-Javaremi, A. & Pakdel, A. (2014). Detecting selective ...
  • Zhu, C., Fan, H., Yuan, Z., Hu, S., Zhang, L., ...
  • نمایش کامل مراجع