پویش ژنگان کل برای تعیین جایگاه های تحت انتخاب مثبت در گوسفندان نژاد زندی
عنوان مقاله: پویش ژنگان کل برای تعیین جایگاه های تحت انتخاب مثبت در گوسفندان نژاد زندی
شناسه ملی مقاله: JR_IJAS-48-4_006
منتشر شده در شماره 4 دوره 48 فصل در سال 1396
شناسه ملی مقاله: JR_IJAS-48-4_006
منتشر شده در شماره 4 دوره 48 فصل در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:
حسین محمدی - دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز
سید عباس رافت - استاد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز
حسین مرادی شهربابک - استادیار گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
جلیل شجاع - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.
خلاصه مقاله:
حسین محمدی - دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز
سید عباس رافت - استاد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز
حسین مرادی شهربابک - استادیار گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
جلیل شجاع - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.
شناسایی مناطق ژنگانی (ژنوم) که هدف انتخاب بودهاند، یکی از راهکار های اصلی تحقیقات زیستی است. هدف این پژوهش، پویش کل ژنگان برای شناسایی مناطقی از ژنگان گوسفندان نژاد زندی که در طی سالهای مختلف هدف انتخابهای طبیعی یا مصنوعی قرار گرفته اند، بود. بدین منظور 96 راس گوسفند نژاد زندی با استفاده از آرایههای ژنگانی Illumina ovine SNP50K BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. برای شناسایی نشانههای انتخاب بر پایه روشهای نداشتن تعادل پیوستگی (لینکاژی) از آزمون (iHS)integrated haplotype score استفاده شد. نتایج یازده منطقه ژنگانی روی کروموزومهای 1 (2 منطقه)، 3، 6، 7، 8، 9، 10، 17، 22 و 26 را شناسایی کرد. تجزیه وتحلیل داده های زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد، برخی از این مناطق ژنگانی به طور مستقیم و غیرمستقیم با ژنهای موثر بر سازگاری (آداپتاسیون) به آب وهوای گرم و خشک (DNAJB4، HSPA4L، MSRB3)، پاسخ ایمنی (IL23A، STAT6، LY96)، توسعه و اندازه بدن (STAC3، LAP3)، توسعه نظام ساختار بدنی یا اسکلتی (SPP1، MEPE، IBSP) و سوخت وساز (متابولیسم) انرژی (ATP5B، GLS2، CS) همپوشانی دارند. درنهایت بررسیQTLهای گزارش شده در ژنگان گوسفند نشان داد، این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با رشد، لاشه و پشم در ارتباط است. به هرحال، برای شناسایی دقیق این ژنها و QTLها لازم است بررسی های پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام شود.
کلمات کلیدی: آزمونiHS, پویش ژنگانی, سازگاری, شناسایی نشانه های انتخاب
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1015756/