CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

برآورد صحت ارزش های اصلاحی صفات پیچیده در جمعیت های بدون شجره با استفاده از نشانگرهای متراکم

عنوان مقاله: برآورد صحت ارزش های اصلاحی صفات پیچیده در جمعیت های بدون شجره با استفاده از نشانگرهای متراکم
شناسه ملی مقاله: JR_IJAS-48-2_002
منتشر شده در شماره 2 دوره 48 فصل در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:

الهام الهی نژاد - دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد
حسین مهربان - استادیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد
مصطفی شخصی نیائی - استادیار ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم، دانشگاه شهرکرد

خلاصه مقاله:
هدف از این پژوهش برآورد صحت ارزش­های اصلاحی ژنگانی با استفاده از مدلGBLUP (Genomic Best Linear Unbiased Prediction) و مقایسه آن با روش سنتی با (BLUP) و بدون شجره (BLUP_noPed) به وسیله همانندسازی رایانه­ای بود. در این تحقیق، ژنگانی با سی جفت کروموزوم به گونه ای همانند­سازی شد که شمار QTLها 3000 و شمار نشانگرها (SNP) 45000 جایگاه در نظر گرفته شدند. همچنین پیش فرض­های مختلف شامل دو جمعیت موثر 100 و 1000 راسی، دو جمعیت مرجع 1000 و 2000 راسی و مقادیر وراثت پذیری پایین (05/0)، متوسط (30/0) و بالا (50/0) بررسی شد و برای مقایسه مدل­ها از معیارهای صحت، اریبی و میانگین مربعات خطا استفاده گردید. نتایج نشان داد، با افزایش وراثت پذیری، صحت ارزش­های اصلاحی در روش­های سنتی و ژنگانی افزایش یافت؛ در همه پیش فرض ها مدل GBLUP صحت بیشتری نسبت به مدل BLUP_noPed داشت؛ اما روش ژنگانی عملکرد بهتری در وراثت­پذیری بالاتر نسبت به روش سنتی BLUP داشت. افزایش جمعیت موثر از 100 به 1000 منجر به کاهش صحت ارزش­های اصلاحی ژنگانی به میزان 11درصد شد؛ ولی تاثیری بر صحت ارزش­های اصلاحی روش­های سنتی نداشت. اما با افزایش جمعیت مرجع از 1000 به 2000 حیوان نسبت بهبود صحت ارزش­های اصلاحی ژنگانی به میزان 5درصد بهبود یافت. اگرچه در همه پیش فرض های اریبی (کم برآورد) روش ژنگانی نسبت به روش­های سنتی بیشتر بود؛ اما با افزایش اندازه جمعیت مرجع و وراثت­پذیری، میانگین مربعات خطا در روش ژنگانی نسبت به روش سنتی BLUP کاهش یافت. بنابراین مدل GBLUP می­تواند برای انتخاب حیوانات برتر در جمعیت های بدون شجره استفاده شود.

کلمات کلیدی:
انتخاب ژنگانی, جمعیت موثر, صحت, همانند سازی, وراثت پذیری

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1015779/