برآورد صحت ارزش های اصلاحی صفات پیچیده در جمعیت های بدون شجره با استفاده از نشانگرهای متراکم
عنوان مقاله: برآورد صحت ارزش های اصلاحی صفات پیچیده در جمعیت های بدون شجره با استفاده از نشانگرهای متراکم
شناسه ملی مقاله: JR_IJAS-48-2_002
منتشر شده در شماره 2 دوره 48 فصل در سال 1396
شناسه ملی مقاله: JR_IJAS-48-2_002
منتشر شده در شماره 2 دوره 48 فصل در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:
الهام الهی نژاد - دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد
حسین مهربان - استادیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد
مصطفی شخصی نیائی - استادیار ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم، دانشگاه شهرکرد
خلاصه مقاله:
الهام الهی نژاد - دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد
حسین مهربان - استادیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد
مصطفی شخصی نیائی - استادیار ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم، دانشگاه شهرکرد
هدف از این پژوهش برآورد صحت ارزشهای اصلاحی ژنگانی با استفاده از مدلGBLUP (Genomic Best Linear Unbiased Prediction) و مقایسه آن با روش سنتی با (BLUP) و بدون شجره (BLUP_noPed) به وسیله همانندسازی رایانهای بود. در این تحقیق، ژنگانی با سی جفت کروموزوم به گونه ای همانندسازی شد که شمار QTLها 3000 و شمار نشانگرها (SNP) 45000 جایگاه در نظر گرفته شدند. همچنین پیش فرضهای مختلف شامل دو جمعیت موثر 100 و 1000 راسی، دو جمعیت مرجع 1000 و 2000 راسی و مقادیر وراثت پذیری پایین (05/0)، متوسط (30/0) و بالا (50/0) بررسی شد و برای مقایسه مدلها از معیارهای صحت، اریبی و میانگین مربعات خطا استفاده گردید. نتایج نشان داد، با افزایش وراثت پذیری، صحت ارزشهای اصلاحی در روشهای سنتی و ژنگانی افزایش یافت؛ در همه پیش فرض ها مدل GBLUP صحت بیشتری نسبت به مدل BLUP_noPed داشت؛ اما روش ژنگانی عملکرد بهتری در وراثتپذیری بالاتر نسبت به روش سنتی BLUP داشت. افزایش جمعیت موثر از 100 به 1000 منجر به کاهش صحت ارزشهای اصلاحی ژنگانی به میزان 11درصد شد؛ ولی تاثیری بر صحت ارزشهای اصلاحی روشهای سنتی نداشت. اما با افزایش جمعیت مرجع از 1000 به 2000 حیوان نسبت بهبود صحت ارزشهای اصلاحی ژنگانی به میزان 5درصد بهبود یافت. اگرچه در همه پیش فرض های اریبی (کم برآورد) روش ژنگانی نسبت به روشهای سنتی بیشتر بود؛ اما با افزایش اندازه جمعیت مرجع و وراثتپذیری، میانگین مربعات خطا در روش ژنگانی نسبت به روش سنتی BLUP کاهش یافت. بنابراین مدل GBLUP میتواند برای انتخاب حیوانات برتر در جمعیت های بدون شجره استفاده شود.
کلمات کلیدی: انتخاب ژنگانی, جمعیت موثر, صحت, همانند سازی, وراثت پذیری
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1015779/