شناسایی نشانگرهای ریزماهواره پیوسته با مقاومت به بیماری تغییر رنگ دانه در ژنوتیپ های برنج

Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 588

This Paper With 26 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-12-2_008

تاریخ نمایه سازی: 26 شهریور 1399

Abstract:

هدف: بیماری تغییر رنگ دانه برنج به عنوان تهدید جدی بر عملکرد دانه و کیفیت آن در ارقام دیررس و به نژادی شده در نواحی برنج کاری شمال ایران محسوب شده که موجب ایجاد خسارت در کیفیت و خصوصیات فیزیکی بذر می گردد. بدین جهت به نژادی ژنوتیپ های برنج برای صفت مقاومت به بیماری، از استراتژی های ترجیحی در مدیریت بیماری تغییر رنگ دانه در برنج محسوب می شود. یکی از مهمترین کاربردهای نشانگرهای مولکولی در برنامه های به نژادی گیاهان، نقش آن ها در افزایش کارایی به نژادی سنتی گیاهان از طریق انتخاب غیرمستقیم با کاربرد نشانگرهای پیوسته با صفات هدف می باشد. از این رو، در این پژوهش، از تجزیه ارتباطی برای شناسایی نشانگرهای پیوسته مرتبط با صفت مقاومت به بیماری تغییر رنگ دانه در ژنوتیپ های برنج استفاده شد. مواد و روش ها: در پژوهش حاضر، جهت ارزیابی فنوتیپی مقاومت 94 ژنوتیپ برنج شامل ارقام محلی و به نژادی شده ایرانی و وارداتی به بیماری تغییر رنگ دانه طی دو سال زراعی 1396 و 1397 مورد بررسی قرار گرفت. ارزیابی ژنوتیپی با استفاده از128 نشانگر چند شکل ریزماهواره روی 94 ژنوتیپ برنج اجرا شد. سپس تجزیه ارتباطی از طریق مدل خطی عمومی (GLM) و مدل خطی مخلوط (MLM)، با استفاده از نرم افزار TASSEL انجام شد. نتایج: نتایج ارزیابی فنوتیپی نشان داد که تنوع بالایی در ژنوتیپ های مورد مطالعه برای مقاومت به بیماری تغییر رنگ دانه وجود دارد. بر اساس تجزیه ساختار مبتنی بر مدل، ژنوتیپ های برنج مورد بررسی در دو زیر جمعیت کلاستربندی شدند. در تجزیه ارتباطی به دو روش GLM و MLM، بعد از تصحیح بنفرونی به ترتیب، 12 و 3 نشانگر ارتباط معنی داری را با صفت مقاومت به بیماری تغییر رنگ دانه در هر دو سال نشان دادند. نتیجه گیری: نشانگرهای RM242، RM5709 و RM5955 در دو مدل آماری GLM و MLM ارتباط معنی داری با مقاومت به بیماری تغییر رنگ دانه در دو سال 1396 و 1397 نشان دادند. بنابراین می توان از آن ها به عنوان نشانگرهای پیوسته با صفت مقاومت در برنامه های به نژادی برنج نظیر انتخاب به کمک نشانگر استفاده نمود.

Authors

سمیه داریوش

بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران.

مصطفی درویش نیا

بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران

علی اکبر عبادی

استادیار و عضو هیات علمی موسسه تحقیقات برنج کشور

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • پاداشت دهکایی فریدون؛ (1394) مقاومت به بیماری تغییر رنگ دانه ...
  • رستمی مهدی؛ قاسمی ابو القاسم؛ رحیمیان حشمت الله؛ خسروی وحید؛ ...
  • رئیسی طیبه؛ صبوری عاطفه؛ (1394) اعتبارسنجی و تجزیه ارتباطی نشانگرهای ...
  • واجد ابراهیمی محمدتقی؛ محمدآبادی محمدرضا؛ اسماعیلی زاده علی (1396) بررسی ...
  • کاربرد نشانگرهای ریزماهواره برای مطالعه ژنوم گوسفندکرمانی [مقاله ژورنالی]
  • Agrama HA, Eizenga GC, Yan W (2007) Association mapping of ...
  • Ashkani S, Rafii MY, Shabanimofrad M et al. (2015) Molecular ...
  • Ashfaq M, Mubashar MS, Haider M, Ali A et al. ...
  • Botstein D, White RL, Skolnick M et al. (1980) Construction ...
  • Bradbury PJ, Zhang Z, Kroon DE et al. (2007) TASSEL: ...
  • Dallagnol LJ, Rodrigues FA, Mielli MVB, Ma JF (2014) Rice ...
  • Earl DA, vonHoldt BM (2012) Structure Harvester: A website and ...
  • Evanno G, Regnaut S, Goudet J (2005) Detecting the number ...
  • IRRI. 2013. Standard evaluation system (SES) for rice. (5st edn), ...
  • Jamali SH, Mohammadi SA, Sadeghzadeh B (2017) Association mapping for ...
  • Kaler AS, Purcell LC (2019) Estimation of a significance threshold ...
  • Kardin MK, Percich JA (1983) Resistance ofBipolaris oryzae to fenapanil. ...
  • Kumar V, Singh A, Mithra SA et al. (2015) Genome-wide ...
  • Leung H, Zhu Y, Revilla-Molina I et al. (2003) Using ...
  • Marchetti MA, Peterson HD (1984) The role of Bipolaris oryzae ...
  • McKinney HH (1923) Influence of soil, temperature and moisture on ...
  • Mew TW, Gonzales P (2002) A Handbook of Rice Seedborne ...
  • Misra JK, Gergon EB, Mew TW (1990) Organisms causing rice ...
  • Mizobuchi R, Sato H, Fukuoka S et al. (2013) Mapping ...
  • Mizobuchi R, Sato H, Fukuoka S et al. (2015) Fine ...
  • Mobasher-Amini M, Alizadeh MR, Padasht F et al. (2015) Rice ...
  • Mohammadifar A, Mohammadabadi MR (2011) Application of Microsatellite Markers for ...
  • Moran MD (2003) Arguments for rejecting the sequential Bonferroni in ...
  • Murray MG, Thompson WF (1980) Rapid isolation of high-molecular-weight plant ...
  • Nachimuthu VV, Muthurajan R, Duraialaguraja S et al. (2015) Diversity ...
  • Padasht-Dehkaei F (2016) Resistance to grain discoloration disease in Iranian ...
  • Pandey V, Agarwal VK, Pandey MP (2000) Location and seed ...
  • Pinson SRM, Shahjahan AKM, Rush MC, Groth DE (2010) Bacterial ...
  • Prabhu AS, Barbosa Filho MP, Datnoff LE et al. (2012) ...
  • Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P (2000) Inference of population ...
  • Raiesi T, Sabouri A (2015) Validation and association analysis of ...
  • Rostami M, Ghasemi A, Rahimian HA, Khosravi V (2013) Identification, ...
  • Shao Y, Jin L, Zhang G et al. (2011) Association ...
  • Spataro G, Tiranti B, Arcaleni P et al. (2011) Genetic ...
  • Sorkhe K, Masaeli M, Hosseini Chaleshtori M et al. (2016) ...
  • Vajed Ebrahimi MT, Mohammad Abadi MR, Esmailizadeh AK (2016) Analysis ...
  • Vajed Ebrahimi MT, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh AK (2017) Genetic Diversity ...
  • Yu J, Buckler ES (2006) Genetic association mapping and genome ...
  • Yu JM, Pressoir G, Briggs WH et al. (2006) A ...
  • Zhang P, Zhong K, Shahid MQ, Tong H (2016) Association ...
  • Zhu C, Gore M, Buckler ES, Yu J (2008) Status ...
  • نمایش کامل مراجع