ایجاد جمعیت پایه ژنتیکی قزل آلای رنگین کمان بر اساس مطالعه تنوع ژنتیکی مولدین این ماهی با استفاده از ریزماهوارک ها
عنوان مقاله: ایجاد جمعیت پایه ژنتیکی قزل آلای رنگین کمان بر اساس مطالعه تنوع ژنتیکی مولدین این ماهی با استفاده از ریزماهوارک ها
شناسه ملی مقاله: R-1056154
منتشر شده در سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی در سال 1392
شناسه ملی مقاله: R-1056154
منتشر شده در سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی در سال 1392
مشخصات نویسندگان مقاله:
عین الله گرجی پور
مصطفی محقق دولت آبادی
فرحناز ایمانی خواه
رسول زارع
داود ضرغام
کیانوس کمایی
کمیل رزمی
محمدمیثم صلاحی
حامد کریمی
علی نکوئی فرد
جواد مهدوی
احمدرضا حسینی
حبیب اله گندمکار
حسین مرادیان
طیبه باشتی
محسن محمدپور
خلاصه مقاله:
عین الله گرجی پور
مصطفی محقق دولت آبادی
فرحناز ایمانی خواه
رسول زارع
داود ضرغام
کیانوس کمایی
کمیل رزمی
محمدمیثم صلاحی
حامد کریمی
علی نکوئی فرد
جواد مهدوی
احمدرضا حسینی
حبیب اله گندمکار
حسین مرادیان
طیبه باشتی
محسن محمدپور
به منظور اجرای پروژه، تعداد 446 نمونه از ماهی قزل الا از 24 مزرعه از استانهای مختلف کشور جمع آوری گردید. از هر نمونه 2 تا 3 گرم از باله دمی بریده و پس از تثبیت در الکل اتانول مطلق به آزمایشگاه منتقل گردید. DNA ژنومی نمونه ها از بافت نرم باله ماهی به روش فنل- کلروفرم استخراج و سپس کمیت و کیفیت DNA استخراج شده با استفاده از اسپکتروفتومتر و الکتروفورز ژل آگارز 1 درصد تعیین شد. واکنش PCR با استفاده از 10 جفت پرایمر ریزماهواره صورت گرفت. محصول PCR با استفاده از ژل پلی آکریل آمید 6 درصد الکتروفورز و با نیترات نقره رنگ آمیزی شد. جهت سنجش وزن مولکولی محصول PCR بر حسب جفت باز (bp) و تعیین ژنوتیپ ها از نرم افزار UV Duc استفاده گردید. مقادیر مربوط به فراوانی آللی، تعداد آللهای واقعی و موثر، هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار، شاخص شانون، میزان شباهت و فاصله ژنتیکی، تعادل هاردی- واینبرگ، مقادیر FST ، RST و جریان ژنی بر اساس تست AMOVA با استفاده از نرم افزار ژنتیکی Gene Alex و Popgene محاسبه گردید. نتایج بدست آمده از این بررسی نشان می دهد که 8 جفت پرایمر میکروستلایتی بررسی شده، پلی مورف بودند. در مجموع تعداد 50 الل شناسایی گردید که محدوده اندازه آنها بین 64-280 جفت باز بوده است. جایگاه Omyf با 26 آلل دارای بیشترین آلل و جایگاه 474 OTSG و Strurruta58 با 5 آلل دارای کمترین تعداد آلل بود. همچنین هتروزیگوسیتی مشاهده شده (Ho) بین مزرعه نمونه برداری در جایگاههای ده گانه بین 0/825 تا 0/964 در بررسی تعادل هاردی- واینبرگ مزارع ،18،15،20 4E و 21 در تمامی لوکوس ها ی مورد بررسی انحراف از تعادل هاردی واینبرگ را نشان داده و خارج از تعادل بودند (05.0> P) . در این بررسی، مزارع ،14،8،7،6 در 3 جایگاه در تعادل هاردی واینبرگ بودند و در بقیه جایگاهها خارج از تعادل بودند. سایر مزارع در یک یا دو جایگاه در تعادل بوده و در 8 یا 9 جایگاه خارج از تعادل بودند. نتایج بدست آمده از FST نشان می دهد که حداکثر آن (0/24) بین نمونه های مزرعه 1و11 که دارای کمترین میزان جریان ژنی (3/7) است مشاهده می شود. حداقل 04/0) FST) بین نمونه های مزرعه 8 و9 که دارای بیشترین میزان جریان ژنی (346) است مشاهده می شود. براساس نتایج حاصل از تست AMOVA بین تمام مزارع با یکدیگر اختلاف معنی دار مشاهده می شود (01.0> P) . علاوه بر این بر اساس معیار 1972) Nei) بیشترین فاصله ژنتیکی (0/89) بین نمونه های مزرعه 2 با 11 و کمترین شباهت ژنتیکی (0/15) میان نمونه های مزارع 3 با 4 وجود دارد. با توجه به داده های حاصله بررسی حاضر تنوع ژنتیکی بدست آمده در مزارع پرورشی ماهی قزل الا در کشور قابل توجه بوده و می تواند به عنوان مطالعه پایه در ایجاد جمعیت پایه در برنامه های اصلاح نژادی کمک نماید.
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1056154/