شناسایی بیوانفورماتیکی اعضاء جدید فاکتورهای رونویسی خانواده ی ژنی WRKY در گیاه کاملینا
Publish place: The 7th Scientific Congress on the Development and Promotion of Architecture and Urbanism in Iran
Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 234
This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
PDCONF07_151
تاریخ نمایه سازی: 10 اسفند 1399
Abstract:
کاملینا Camelina Sativa یک گیاه آلوهگزاپلوئید از اعضاء خانواده ی براسیکاسه میباشد که به دلیل توانایی تولید محصولات جدید، تولیدات سوختی و خوراک دام برای محققان حائز اهمیت میباشد. فاکتورهای رونویسی WRKY از بزرگترین تنظیم کننده های رونویسی در گیاهان می باشند که در مقاومت گیاه به تنشهای زیستی و غیرزیستی نقش دارند. پروتئینهای خانوادهWRKY نامشان را 60 آمینواسید بشدت محافظت شده در جایگاه WRKY domain گرفته اند. برای شناسای اعضاء جدید این خانوادهی ژنی توالیهای پروتئینی و ژنی و سایر اطلاعات مربوط به گیاه کاملینا از پایگاه های اطلاعاتی (PlantTFDB) و (Camelina genome pororal) جمع آوری شدند. توالی پروتئینی هردو پایگاه در پایگاه NCBI، blastp شدند. برای شناسایی اعضاء جدید خانواده ی ژنی WRKY در گیاه کاملینا، فاکتورهای رونویسی کاملینا با فاکتورهای رونویسی گیاه مدل آرابیدوپسیس در پایگاه NCBI نیز blastp شدند. در این بررسی 102 عضو جدید پروتئین برای گیاه کاملینا یافت شد. از 102 عضو جدید یافت شده، 8 عضو از blastp پایگاه های (Camelina genome pororal) و (PlantTFDB) و 94 عضو جدید از blastp توالی های پروتئینی کاملینا و گیاه آرابیدوپسیس حاصل شدند.
Keywords:
Authors
سیده مریم سیدحسن پور
دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی ژنتیک و بهنژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز
لیلا نژادصادقی
استادیار گروه مهندسی ژنتیک و بهنژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز