بازسازی شبکههای ژنی دخیل در پاسخ به تنش خشکی درگیاه جو
Publish place: New Cellular Biotechnology - Molecular، Vol: 8، Issue: 29
Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 352
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_NCMBJ-8-29_004
تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1399
Abstract:
سابقه و هدف: با توجه به اهمیت تنش خشکی و نظر به اینکه تحمل به تنش خشکی صفتی چند ژنی میباشد، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژنهای کلیدی دخیل در تنش خشکی درگیاه جو با استفاده از تجزیه و تحلیل دادههای ریزآرایه و همچنین شناسایی فرایندهای موثر بوده است.
مواد و روشها: تمامی ژنهای دارای بیان افتراقی (≤ 5/2 و≥ 5/2-) در بین تمامی آزمایشات ریزآرایه انجام شده ، با استفاده از نرمافزار Genevestigator شناسایی شدند. ترسیم شبکه برهمکنش پروتئینی و شناسایی ژنهای کلیدی با استفاده از نرمافزار Cytoscape و بررسی هستی شناسی ژنها بوسیله نرم افزار AgriGO صورت گرفت.
یافته ها: نتایج بدست آمده از بازسازی شبکه برهمکنش پروتئینی منجر به شناسایی 14 و 15 ژن کلیدی دخیل در تنش خشکی به ترتیب در مرحله نموی رویشی و زایشی شد.
بحث: براساس نتایج بدست آمده، از موثرترین ژنهای کلیدی دخیل در تحمل به تنش خشکی میتوان به ژنهای عوامل رونویسی ARF1، ABF3، DREB1A، DREB2A،HY5 و HYHاشاره کرد.
نتیجه گیری: بررسی هستی شناسی ژنهای پاسخدهنده به خشکی و هاب روشن ساخت که تنظیم فرایندهای زیستی، فرایندهای متابولیسمی، کنترل دوره نوری و فتوسنتز و همچنین تنظیم زمان گلدهی از مهمترین فرآیندهای تاثیر گذار بر این تنش میباشند.
Keywords:
Barley , Drought stress , Biological network , Hub genes , گیاه جو , تنش خشکی , شبکههای زیستی , ژن هاب
Authors
سیده مهری جوادی
Department of Plant Breeding, Science and Research Branch, Islamic Azad University Tehran, Iran
زهرا سادات شبر
Department of Systems Biology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
آسا ابراهیمی
Department of Plant Breeding, Science and Research Branch, Islamic Azad University Tehran, Iran
مریم شهبازی
Department of Molecular physiology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran