مقایسه روشهای مختلف استخراج RNA در برگ سیب (Malus domestica)
Publish place: New Cellular Biotechnology - Molecular، Vol: 7، Issue: 27
Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 257
This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_NCMBJ-7-27_006
تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1399
Abstract:
سابقه و هدف: جداسازی RNA از گیاهانی که دارای مقدار زیادی ترکیبات پلیساکارید و پلیفنل میباشند به علت اتصال و رسوب این ترکیبات با RNA مشکل است. بنابراین در این مطالعه 11 پروتکل مختلف استخراجRNA از برگهای سیب غنی از ترکیبات فنلی مورد بررسی قرار گرفت.
مواد و روش ها: کیفیت و کمیت RNAبا الکتروفورز ژل آگارز 1.2% و اسپکتروفتومتری نانودراپ در طول موج 230، 260 و 280 نانومتر تعیین شد و سنتز cDNA و آنالیز RT-PCR با پرایمر اختصاصی ژن اکتین سیب انجام گرفت.
یافته ها: نتایج نشان داد که روش استخراج جمیچاتچائو و همکاران (2012) و راجاکانی و همکاران (2013) مناسبترین روشهای استخراجRNA از برگ سیب بودند. عملکرد RNA کل استخراج شده در این روشها به ترتیب بین 152.4 تا 800.2 و 362.1 تا 452.6 نانوگرم در میکرولیتر به دست آمد. باندهای S18 و S28 در الکتروفورز افقی مشاهده شدند.
بحث: در هر دو روش نسبت 260 به 280 و 260 به 230 به ترتیب بین 1.99 تا 2.03 و 2.07 تا 2.17 بود که نشان دهنده خلوص بالایRNA و عدم آلودگی به پلیفنلی، پروتئینی و پلیساکاریدی میباشد.
نتیجهگیری: کیفیت بالای واکنش RT-PCR در هر دو روش نشان داد که RNA استخراج شده میتواند با اطمینان جهت آزمایشهای مولکولی پائین دستی مورد استفاده قرار گیرد.
Keywords:
Authors
شهرام منتظری
Department of Plant Breeding, Khuzestan Science and research Branch, Islamic Azad University, Ahvaz, Iran.
شهاب سادات
Department of Plant Breeding, Ahvaz Branch, Islamic Azad University, Ahvaz, Iran