مقایسه روش‌های مختلف استخراج RNA در برگ سیب (Malus domestica)

Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 257

This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_NCMBJ-7-27_006

تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1399

Abstract:

سابقه و هدف: جداسازی RNA از گیاهانی که دارای مقدار زیادی ترکیبات پلی‌ساکارید و پلی‌فنل می‌باشند به علت اتصال و رسوب این ترکیبات با RNA  مشکل است. بنابراین در این مطالعه 11 پروتکل مختلف استخراجRNA  از برگ‌های سیب  غنی از ترکیبات فنلی مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش ها: کیفیت و کمیت  RNAبا الکتروفورز ژل آگارز 1.2% و اسپکتروفتومتری نانودراپ در طول موج 230، 260 و 280 نانومتر تعیین شد و سنتز cDNA و آنالیز RT-PCR  با پرایمر اختصاصی ژن اکتین سیب انجام گرفت. یافته­ ها: نتایج نشان داد که روش استخراج جمی‌چات‌چائو و همکاران (2012) و راجاکانی و همکاران (2013) مناسب‌ترین روش‌های استخراجRNA  از برگ سیب بودند. عملکرد RNA کل استخراج شده در این روش‌ها به ترتیب بین 152.4 تا 800.2 و 362.1 تا 452.6 نانوگرم در میکرولیتر به دست آمد. باندهای S18 و S28 در الکتروفورز افقی مشاهده شدند. بحث:  در هر دو روش نسبت 260 به 280 و 260 به 230 به ترتیب بین 1.99 تا 2.03 و 2.07 تا 2.17 بود که نشان دهنده خلوص بالایRNA  و عدم آلودگی به پلی‌فنلی، پروتئینی و پلی‌ساکاریدی می‌باشد. نتیجه‌گیری: کیفیت بالای واکنش RT-PCR در هر دو روش نشان داد که RNA استخراج شده می‌تواند با اطمینان جهت آزمایش‌های مولکولی پائین دستی مورد استفاده قرار گیرد.

Authors

شهرام منتظری

Department of Plant Breeding, Khuzestan Science and research Branch, Islamic Azad University, Ahvaz, Iran.

شهاب سادات

Department of Plant Breeding, Ahvaz Branch, Islamic Azad University, Ahvaz, Iran