شناسایی نشانگرهای میکروساتلیت پیوسته با نواحی ژنومی دخیل در مقاومت به جدایه های عامل بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی یقه ساقه در آفتابگردان روغنی (Helianthus annuus L.) در شرایط کنترل شده

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 300

This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_PGRLU-5-2_001

تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1399

Abstract:

آفتابگردان ‌(.Helianthus annuus L) ‌یک ‌محصول ‌مهم ‌زراعی ‌می‌‌باشد ‌که ‌روغن ‌آن ‌ارزش ‌غذایی ‌و ‌اقتصادی ‌بالایی ‌دارد. ‌پوسیدگی ‌پایه‌‌ی ‌ساقه ‌که ‌توسط ‌قارچ‌‌های ‌Sclerotinia sclerotiorum ‌و ‌S. minor ‌ایجاد ‌می‌‌شود، ‌یکی ‌از ‌بیماری‌‌های ‌مهم ‌و ‌مخرّب ‌آفتابگردان ‌است. ‌استفاده ‌از ‌ارقام ‌مقاوم ‌به ‌عنوان ‌مهمترین ‌و ‌موثرترین ‌روش ‌برای ‌کنترل ‌بیماری ‌در ‌نظر ‌گرفته ‌می‌‌شود. ‌در ‌پژوهش ‌حاضر، ‌ارتباط ‌و ‌پیوستگی ‌بین ‌30 ‌جفت ‌نشانگر ‌ریزماهواره ‌با ‌مقاومت ‌به ‌سه ‌جدایه ‌S. sclerotiorum ‌و ‌سه ‌جدایه ‌S. minor ‌در ‌100 ‌لاین ‌آفتابگردان ‌با ‌استفاده ‌از ‌نرم‌‌افزارهای ‌Structure ‌و ‌Tassel ‌مورد ‌ارزیابی ‌قرار ‌گرفت. ‌بر ‌اساس ‌30 ‌جفت ‌نشانگر ‌ریزماهواره ‌مورد ‌استفاده ‌در ‌این ‌مطالعه، ‌ساختار ‌ژنتیکی ‌جمعیت ‌به ‌دو ‌زیر ‌جمعیت ‌(2=K) ‌تقسیم ‌گردید ‌که ‌نتایج ‌حاصل ‌از ‌رسم ‌بارپلات ‌نیز ‌مؤید ‌آن ‌بود. ‌در ‌تجزیه ‌ارتباط ‌با ‌استفاده ‌از ‌نرم‌‌افزار TASSEL ‌از ‌طریق ‌دو ‌روش GLM ‌و ‌MLM ‌، ‌به ‌ترتیب ‌14 ‌و ‌12 ‌نشانگر ‌SSR ‌شناسایی ‌شد ‌که ‌ارتباط ‌معنی‌‌داری ‌با ‌نواحی ‌ژنومی ‌کنترل ‌کننده ‌مقاومت ‌به ‌بیماری ‌داشتند ‌و ‌تغییرات ‌قابل ‌توجهی ‌از ‌صفت ‌را ‌توجیه ‌نمودند. ‌شناسایی ‌نشانگرهای ‌مشترک ‌مانند ‌نشانگر ‌ORS617 ‌برای ‌جدایه‌‌های ‌M1 ‌از ‌گونه ‌S.minor ‌و ‌J1 ‌از ‌گونه ‌S.sclerotiorum ‌می‌‌تواند ‌ناشی ‌از ‌اثرات ‌پلیوتروپی ‌یا ‌پیوستگی ‌نواحی ‌ژنومی ‌دخیل ‌در ‌کنترل ‌مقاومت ‌به ‌این ‌جدایه‌‌ها ‌باشد. ‌به ‌دلیل ‌اینکه ‌این ‌نشانگرها ‌گزینش ‌همزمان ‌مقاومت ‌به ‌چندین ‌جدایه ‌قارچی ‌را ‌امکان‌‌پذیر ‌می‌‌سازد، ‌در ‌برنامه‌‌های ‌به‌‌نژادی ‌آفتابگردان ‌جهت ‌انتخاب ‌به ‌کمک ‌نشانگر ‌(MAS) ‌و ‌تولید ‌ارقام ‌مقاوم ‌به ‌بیماری ‌اهمیت ‌اساسی ‌دارد. 

Authors

خدیجه موسی خلیفانی

Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran

رضا درویش زاده

Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran

مسعود ابرین بنا

Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Urmia University

آرام نوری

Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Urmia University

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Abdullah, S.K. and Al-Mousawi, K.A. (2010). Fungi associated with seeds ...
  • Anonymous. (2010). Agribusiness handbook: sunflower crude and refined oil. FAO/EBRD ...
  • Abdurakhmonov, I.Y. and Abdukarimov, A. (2008). Application of association mapping ...
  • Alizadeh, M., Aalami, A., Shirzadian-Khorramabad, R., Ebadi, A.A. and Azizi, ...
  • Amoozadeh, M., Darvishzadeh, R., Davar, R., Abdollahi-Mandoulakani, B., Haddadi, P. ...
  • Amoozadeh, A., Rahmani, S. and Nemati, F. (2013). Poly (ethylene) ...
  • Ataii, R., Mohammadi, V., Taleai, A.R. and Nagavi, M.R. (2013). ...
  • Azizi, H., Aalami, A., Esfahani, M. and Ebadi. A.A. (2017). ...
  • Basirnia, A., Hatami Maleki, H., Darvishzadeh, R. and Ghavami, F. ...
  • Bert, P.F., Jouan, I., de Labrouhe, T.D., Serre, F., Nicolas, ...
  • Bhutta, A.R. (1998). Biological studies on some fungi associated with ...
  • Boland, G.J. and Hall, R. (1994). Index of plant hosts ...
  • Bolton, M.D., Thomma, B.P. and Nelson, B.D. (2006). Sclerotinia sclerotiorum ...
  • Breseghello, F. and Sorrells, M. E. (2006). Association analysis as ...
  • Çevik, F., Göksu, M.Z.L., Derici, O.B. and Fındık, Ö. (2009). ...
  • Chang, C. and Janzen, H.H. (1996). Long-term fate of nitrogen ...
  • Chapman, J.M., Cooper, J.D., Todd, J.A. and Clayton, D.G. (2003). ...
  • Dadras, A.R., Sabouri, H., Nejad, G.M., Sabouri, A. and Shoai-Deylami, ...
  • Darvishzadeh, R. (2016). Genetic variability, structure analysis, and association mapping ...
  • Davar, R., Darvishzadeh, R. and Majd, A. (2011). Genotype-isolate interaction ...
  • Davar, R., Darvishzadeh, R., Majd, A., Ghosta, Y. and Sarrafi, ...
  • Duan, Y., Ge, C., Zhang, X., Wang, J. and Zhou, ...
  • Ersoz, E.S., Yu, J. and Buckler, E.S. (2007). Applications of ...
  • Evanno, G., Regnaut, S. and Goudet, J. (2005). Detecting the ...
  • FAO. (2016). Food and Agriculture Organization. Available online at://faostat.fao.org/. ...
  • Farrokhi, J., Darvishzadeh, R., Hatami Maleki, H., Nasseri, L.A. and ...
  • Farrokhi, E., Khodabandeh, A., Daneshian, J. and Rhmanpour, S. (2010). ...
  • Fusari, C.M., Di Rienzo, J.A., Troglia, C., Nishinakamasu, V., Moreno, ...
  • Gaetán, S. and Madia, M. (2005). Occurrence of stem rot ...
  • Gomes, L.C., Di Benedetto, G. and Scorrano, L. (2011). During ...
  • Gupta, P.K., Rustgi, S. and Kulwal, P.L. (2005). Linkage disequilibrium ...
  • Hahn, V. (2002). Genetic variation for resistance to Sclerotinia head ...
  • Hansen, M., Kraft, T., Ganestam, S., Saell, T. and Nilsson, ...
  • Hittalmani, S., Huang, N., Courtois, B., Venuprasad, R., Shashidhar, H.E., ...
  • Iquira, E., Humira, S. and François, B. (2015). Association mapping ...
  • Jannatdoust, M., Darvishzadeh, R., Ziaeifard, R., Azizi, H. and Gholinezhad, ...
  • Jun, T.H., Van, K., Kim, M.Y., Lee, S.H. and Walker, ...
  • Kearsey, M.J. and Pooni, H.S. (1996). The genetical analysis of ...
  • Kraakman, A.T., Niks, R.E., Van den Berg, P.M., Stam, P. ...
  • Leonards-Schippers, C., Gieffers, W., Schäfer-Pregl, R., Ritter, E., Knapp, S.J., ...
  • Mannai, Y.E., Shehzad, T. and Okuno, K. (2011). Variation in ...
  • Micic, Z., Hahn, V., Bauer, E., Schon, C.C., Knapp, J., ...
  • Micic, Z., Hahn, V., Bauer, E., Schon, C.C., and Melchinger, ...
  • Micic, Z., Hahn, V., Bauer, E., Melchinger, A.E., Knapp, S.J., ...
  • Mestries, E., Gentzbittel, L., de Labrouhe, D.T., Nicolas, P. and ...
  • Moose, S.P. and Mumm, R.H. (2008). Molecular plant breeding as ...
  • Musa-Khalifani, Kh. (2016). Identification of molecular markers associated with resistance ...
  • Myles, S., Peiffer, J., Brown, P.J., Ersoz, E.S., Zhang, Z., ...
  • Nordborg, M. and Tavare, S. (2002). Linkage disequilibrium: what history ...
  • Oraguzie, N.C., Phillip, L.W., Rikkerink, E.H.A. and Silva, H.N.D. (2007). ...
  • Poormahamad Kiani, S., Talia P., Maury P., Grieu, P., Heinz, ...
  • Price, K. and Colhoun, J. (1975). A study of variability ...
  • Pritchard, J.K., Stephens, M., Rosenberg, N.A. and Donnelly, P. (2000). ...
  • Pritchard, J. K., Wen, X. and Falush, D. (2007). Documentation ...
  • Remington, D.L., Thornsberry, J.M., Matsuoka, Y., Wilson, L.M., Whitt, S.R., ...
  • Rönicke, S., Hahn, V., Vogler, A. and Friedt, W. (2005). ...
  • Roy, J.K., Bandopadhyay, R., Rustgi, S., Balyan, H.S. and Gupta, ...
  • Saeed, A. and Darvishzadeh, R. (2017). Association analysis of biotic ...
  • Saeed, A., Darvishzadeh, R. and Basirnia, A. (2013). Simple sequence ...
  • Saharan, G. S. and Mehta, N. (2008). Economic importance. In: ...
  • Sahranavard-Azartamar, F., Ghadimzadeh, M. and Darvishzadeh, R. (2016). Genetic diversity ...
  • Sahranavard-Azartamar, F., Darvishzadeh, R., Ghadimzadeh, M., Azizi, H. and Aboulghasemi, ...
  • Shaaf, S., Bihamta, M.R., Taleai, A.R., Mohammadi, V. and kaliliyan, ...
  • Sharfun-Nahar, S., Mushtaq, M. and Hashmi, M. H. (2005). Seed-borne ...
  • Shehzad, T., Iwata, H. and Okuno, K. (2009). Genome-wide association ...
  • Slatkin, M. (1994). An exact test for neutrality based on ...
  • Soleimani Gezeljeh, A., Darvishzadeh, R., Ebrahimi, A. and Bihamta, M.R. ...
  • Stich, B., Melchinger, A.E., Piepho, H.P., Hamrit, S., Schipprack, W., ...
  • Stich, B., Maurer, H.P., Melchinger, A.E., Frisch, M., Heckenberger, M., ...
  • Stich, B., Melchinger, A.E., Frisch, M., Maurer, H.P., Heckenberger, M. ...
  • Sun, J., Guo, N., Lei, J., Li, L., Hu, G. ...
  • Talukder, Z.I., Hulke, B.S., Qi, L., Scheffler, B.E., Pegadaraju, V., ...
  • Talukder, Z.I., Tharreau, D. and Price, A.H. (2004). Quantitative trait ...
  • Tang S., Yu J.K., Slabaugh M.B., Shintani D.K. and Knapp ...
  • Thornsberry, J.M., Goodman, M.M., Doebley, J., Kresovich, S., Nielsen, D. ...
  • Tuberosa, R., Salvi, S., Sanguineti, M. C., Landi, P., Maccaferri, ...
  • Young, N.D. (1996). QTL mapping and quantitative disease resistance in ...
  • Yu, J., Pressoir, G., Briggs, W.H., Bi, I.V., Yamasaki, M., ...
  • Yue, B., Radi, S.A., Vick, B.A., Cai, X., Tang, S., ...
  • Vanitha, J., Manivannan, N. and Chandirakala, R. (2014). Qualitative trait ...
  • Weiss, K.M. and Clark, A.G. (2002). Linkage disequilibrium and the ...
  • نمایش کامل مراجع