ارزیابی نشانگرهای مبتنی بر رتروترنسپوزون ها در شناسایی مکان های مرتبط با صفات مهم زراعی و مقاومت به بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی یقه ساقه در آفتابگردان روغنی (Helianthus annuus L.) تحت شرایط مزرعه ای

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 275

This Paper With 14 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JFCR-16-1_006

تاریخ نمایه سازی: 22 اسفند 1399

Abstract:

آفتابگردان (Helianthus annuus L.) یکی از گیاهان دانه روغنی است. پوسیدگی طوقه یکی از مهمترین بیماری‌های آفتابگردان در دنیا می‌باشد که در شرایط محیطی مناسب باعث از بین رفتن کل محصول می‌شود. در این مطالعه به منظور تجزیه ارتباطی صفات مهم زراعی و مقاومت به قارچ اسکلروتینیا (Sclerotinia sclerotiorum) تعداد 100 لاین خالص آفتابگردان روغنی در مزرعه‌ای در روستای وقاصلوی سفلی از توابع شهرستان ارومیه در قالب طرح لاتیس ساده 10×10 در 2 تکرار کشت شدند. پنج بوته از هر ژنوتیپ در هر تکرار با جدایه قارچی جمع‌آوری شده از گیاهان آفتابگردان آلوده همان مزرعه در سال قبل تلقیح شدند. صفات درصد پیشرفت آلودگی قارچی بعد از 4، 8 و 12 روز، وزن صد دانه گیاه آلوده نشده، وزن صد دانه گیاه آلوده شده، عملکرد گیاه آلوده نشده، عملکرد گیاه آلوده شده، افت وزن صد دانه و افت عملکرد ارزیابی شدند. از طرفی پروفیل مولکولی جمعیت با 28 آغازگر مبتنی بر رتروترنسپوزن (7 جفت آغازگر IRAP و 7 جفت آغازگر REMAP) تهیه شد. تجزیه ساختار ژنتیکی جمعیت به‌عنوان پیش نیاز تجزیه ارتباط با روش بیزین منجر به شناسایی 2 زیر جمعیت شد. در تجزیه ارتباط بر اساس مدل خطی مخلوط (MLM)، 27 نشانگر رتروترنسپوزونی مرتبط با صفات مورد مطالعه شناسایی شدند. بیشترین تعداد نشانگر برای صفات درصد پیشرفت آلودگی بعد از 4 روز و عملکرد تک بوته گیاه آلوده شده شناسایی شد. در این مطالعه چندین مکان مشترک برای صفات مورد مطالعه شناسایی شد. وجود نشانگرهای مشترک در میان برخی صفات بررسی شده می‌تواند ناشی از اثرات پلیوتروپی و یا پیوستگی نواحی ژنومی دخیل در کنترل این صفات باشد. نتایج به‌دست آمده از این مطالعه اطلاعات ارزشمندی در زمینه مبنای ژنتیکی صفات مورد مطالعه ارائه می‌دهد که از این اطلاعات می‌توان در برنامه‌های مختلف و از جمله انتخاب به کمک نشانگر (MAS) در آفتابگردان استفاده نمود. می‌توان با توالی‌یابی مکان‌هایی که تغییرات قابل توجهی از صفات را توجیه می‌نمایند، ژن‌های کدکننده مقاومت به بیماری و صفات مهم زراعی را شناسایی نمود.

Authors

رشید پاک نیا

دانشگاه فردوسی مشهد

فرج اله شهریاری

دانشگاه فردوسی مشهد

رضا درویش زاده

دانشگاه ارومیه

سعید ملک زاده

دانشگاه فردوسی مشهد

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Abdi, N., Darvishzadeh, R., Jafari, M., Pirzad, A., and Haddadi, ...
  • Allinne, C., Maury, P., Sarrafi, A., and Grieu, P. 2009. ...
  • Anandhan, T., Manivannan, N., Vindhiyaman, P., and Jeykaumar, P. 2010. ...
  • Andaya, V. C., Tabanao, D., Maramara, G., and Sebastian, L. ...
  • Aranzana, M. J., Kim, S., Zhao, K., Bakker, E., Horton, ...
  • Bolton, M. D., Thomma, B. P. H. J., and Nelson, ...
  • Bradbury, P. J., Zhang, Z., Kroon, D. E., Casstevens, T. ...
  • Breseghello, F., and Sorrells, M. E. 2006. Association mapping of ...
  • Campbell, M. A., Fitzgerald, H. A., and Ronald, P. C. ...
  • Carson, M. L. 1991. Relationship between phoma black stem severity ...
  • Darvishzadeh, R. 2012. Association of SSR markers with patial resistance ...
  • Ebrahimi, A., and Sarrafi, A. 2012. Genetic Variability and identification ...
  • Evanno, G., Reganut, E., and Goudet, J. 2005. Detecting the ...
  • Eyvaznejad, N., and Darvishzadeh, R. 2014. Identification of QTLs for ...
  • Flint-Garcia, S. A., Thornsberry, J. M., and Buckler, E. S. ...
  • Fusari C. M., Rienzo J. A. D., Troglia C., Nishinakamasu ...
  • Gulya, T. J., Rashid, K. Y., and Masirevic, S. N. ...
  • Hahn, V. 2002. Genetic variation for resistance to Sclerotinia head ...
  • Inostroza, L., Pozo, A. D., Matus, I., Castillo, D., Hayes, ...
  • Jun, T. H., Van, K., Kim, M. Y., Lee, S. ...
  • Liue, L., Wang, L., Yao, J., Zheng, Y., and Zhao, ...
  • Mandel, J. R., Nambeesan, S., Bowers, J. E., Marek, L. ...
  • Masirevic, S., and Gulya, T. J. 1992. Sclerotinia and phomopsis-two ...
  • Micic, Z., Hahn, V., Bauer, E., Schon, C. C., Knapp, ...
  • Myles, S., Peiffer, J., Brown, P. J., Ersoz, E. S., ...
  • Onemli, F., and Gucer, T. 2010. Response to drought of ...
  • Pritchard, J. K., Stephens, M., and Donnelly, P. 2000. Inference ...
  • Purdy, L. H. 1979. Sclerotinia sclerotiorum: History, diseases and symptomatology, ...
  • Rafalski, J. A. 2002a. Applications of single nucleotide polymorphisms in ...
  • Rafalski, J. A. 2002b. Novel genetic mapping tools in plants: ...
  • Rönicke, S., Hahn, V., and Friedt, W. 2005. Resistance to ...
  • Rosenberg, N. A., Pritchard, J. K., Weber, J. L., Cann, ...
  • Roy, J. K., Bandopadhyay, R., Rustgi, S., Balyan, H. S., ...
  • Spataro, G., Tiranti, B., Arcaleni, P., Bellucci, E., Attene, G., ...
  • Speed, D., Hemani, G., Johnson, M. R., and Balding, D. ...
  • Sukumaran, S., Xiang, W., Bean, S. R., Pedersen, J. F., ...
  • Talukder, I. Z., Hulke, S. B., Qi, L., Scheffler, E. ...
  • Thornsberry, J. M., Goodman, M. M., Doebley, J., Kresovich, S., ...
  • Tuberosa, R., Salvi, S., Sanguineti, M. C., Landi, P., Maccaferri, ...
  • Wang, W. Y. S., Barratt, B. J., Clayton, D. G., ...
  • Würschum, T., Anyanga, W. O., and Hahn, V. 2014. Inheritance ...
  • Yue, B., Radi, S. A., Vick, B. A., Cai, X., ...
  • Zhu, C., Gore, M., Buckler, E. S., and Yu, J. ...
  • نمایش کامل مراجع