بررسی بیوانفورماتیکی مسیر سیگنالینگ T-Cell Reseptor has-mir -582-5p , بر روی ژن بر روی ژن ACE2 در وخامت COVID-19

کروناویروس جدید با نام SARS-CoV-2 شناخته شده است و بیماری ناشی از آن کووید- 19 نامیده می شود. این بیماری قدرت انتقال فرد به فرد زیادی داشته و به نظر می رسد به علت توانایی بالا و تمایل پروتئین Spike به گیرنده سلولی ACE2 انسانی است بیماری تنفسی COVID-19 که توسط SARS-CoV-2 در شهر ووهان چین منتشر شد , به سرعت در حال گسترش در کل جهان است .ویروس کرونا از ACE2 به عنوان گیرنده ی عملکردی استفاده کرده و وارد سلول میزبان می شود .میکرو ان ها جزو از RNA های تنظیمی هستند که غالبا با هدف گیری ناحیه ی 3 ژن ها منجر به تنظیم بیان ژن ها می شوند. در این مطالعه ی بیون افورما تیکی از دیتا بیس های KEGG و MIR WAIK , MIR BASE , MIR SNP , NCBI استفاده کردیم با توجه به این که has-mir-582-5p ژن ACE2 را در ناحیه ی 3 هدف قرار میدهد پیش بینی می کنیم has-mir-582-5p با مهار این ژن بیان ACE2 را کاهش می دهد. در مقابل آن اگر بیان این میکرو ار ان ای کاهش یابد و یا به واسطه وجود پلی مورفیسم ها در ناحیه UTR3 این ژن را هدف قرار ندهد، بیان ژن ACE2 افزایش می دهد. طبق مسیر T-Cell Reseptor در KEGG میتوان پیش بینی کرد که ژن ACE2 با اثر بر ژن RAS در نهایت می تواند باعث فعال کردن مسیر های التهابی و طوفان سایتوکاینی شود که این مسیر ها شامل ترشح IL-4 , IL-2، IL-10 , IL-5 می باشد در نهایت پیش بینی می شود افزایش بیان has-mir-582-5p با کاهش بیان ACE2 طبق مسیر پیش بینی شده منجر به مهار مسیر طوفان سایتوکاینی میشود و افزایش بیان ACE2 با فعال کردن طوفان سایتو کاینی منجر به ابتلا و حاد شدن وضعیت بیمار می شود.

Keywords:

ژن ACE2 , کرونا ویروس , بیو انفورماتیک , مسیر التهابی