شناسایی قارچهای بومی خاکهای آلوده حوزه نفتی مارون اهواز
عنوان مقاله: شناسایی قارچهای بومی خاکهای آلوده حوزه نفتی مارون اهواز
شناسه ملی مقاله: JR_SBJ-7-2_004
منتشر شده در در سال 1398
شناسه ملی مقاله: JR_SBJ-7-2_004
منتشر شده در در سال 1398
مشخصات نویسندگان مقاله:
فرزانه دهداری - دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز
مهدی مهرابی کوشکی - دانشیار بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز؛ مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی و علوم زیستی، دانشگاه شهید چمران اهواز
جمشید حیاتی - دانشیار بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز
خلاصه مقاله:
فرزانه دهداری - دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز
مهدی مهرابی کوشکی - دانشیار بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز؛ مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی و علوم زیستی، دانشگاه شهید چمران اهواز
جمشید حیاتی - دانشیار بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز
در طی این پژوهش، 16 نمونه خاک آلوده به مواد نفتی از چهار میدان در حوزه نفتی مارون اهواز جمعآوری شد. با کشت نمونههای خاک، 33 جدایه قارچی جداسازی و با استفاده از روش تکاسپور و نوکهیف خالصسازی شدند. بر اساس خصوصیات میکروسکوپی جدایهها و مشاهده انواع ساختارهای رویشی و تولیدمثلی، 23 جدایه قارچی جهت شناسائی مبتنی بر ریختشناسی و مولکولی انتخاب شدند. از جدایههای خالص شده در محیط کشت مایع سیب زمینی- دکستروز- بروث زیستتوده (توده میسیلیومی) قارچی تهیه شد. پس از استخراج DNA از میسیلیومهای خشک - انجمادی شده، نواحی ژنی ITS و Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (GPDH، فقط برای Curvularia) با استفاده از آغازگرهای مناسب تکثیر شدند. قطعات تکثیری با استفاده از دو روش رسوب با اتانول و استخراج از ژل خالصسازی و سپس توسط شرکت ماکروژن توالییابی گردیدند. توالیهای بدست آمده ویراستاری و مونتاژ شدند و با انجام عملیات جستجوی بلاست و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی با استفاده از الگوریتم درستنمائی بیشینه، جدایهها شناسایی شدند. بر اساس بررسیهای مولکولی و ریختشناسی، جدایههای این تحقیق گونههایAcremonium sclerotigenum، Alternaria destruens، Aspergillus sp.، Cladosporium puyae، Curvularia sp.، Fusarium sp.، Mucor circinelloides، Penicillium oxalicum، P. chrysogenum، Paramyrothecium terrestris، Rhizopus oryzaeوجدایههایی از دو جنس Allophomaو Neodidymelliopsisاز خانوادهDidymellacaeرا شامل شدند. دو گونهی Cladosporium puyae و Paramyrothecium terrestris برای میکوبیوتای ایران جدید میباشند.
کلمات کلیدی: ناحیه ITS, BLASTn, آنالیز فیلوژنتیکی
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1178089/