CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

شناسایی قارچ‌های بومی خاک‌های آلوده حوزه نفتی مارون اهواز

عنوان مقاله: شناسایی قارچ‌های بومی خاک‌های آلوده حوزه نفتی مارون اهواز
شناسه ملی مقاله: JR_SBJ-7-2_004
منتشر شده در در سال 1398
مشخصات نویسندگان مقاله:

فرزانه دهداری - دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز
مهدی مهرابی کوشکی - دانشیار بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز؛ مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی و علوم زیستی، دانشگاه شهید چمران اهواز
جمشید حیاتی - دانشیار بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز

خلاصه مقاله:
در طی این پژوهش، 16 نمونه خاک آلوده به مواد نفتی از چهار میدان در حوزه نفتی مارون اهواز جمع‌آوری شد. با کشت نمونه‌های خاک، 33 جدایه قارچی جداسازی و با استفاده از روش تک‏اسپور و نوک‏هیف خالص‌سازی شدند. بر اساس خصوصیات میکروسکوپی جدایه­ها و مشاهده انواع ساختارهای رویشی و تولیدمثلی، 23 جدایه قارچی جهت شناسائی مبتنی بر ریخت‏شناسی و مولکولی انتخاب شدند. از جدایه‌های خالص شده در محیط کشت مایع سیب زمینی- دکستروز- بروث زیست‏توده (توده میسیلیومی) قارچی تهیه شد. پس از استخراج DNA از میسیلیوم­های خشک - انجمادی شده، نواحی ژنی ITS و Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (GPDH، فقط برای Curvularia) با استفاده از آغازگرهای مناسب تکثیر شدند. قطعات تکثیری با استفاده از دو روش رسوب با اتانول و استخراج از ژل خالص‌سازی و سپس توسط شرکت ماکروژن توالی­یابی گردیدند. توالی‏های بدست آمده ویراستاری و مونتاژ شدند و با انجام عملیات جستجوی بلاست و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی با استفاده از الگوریتم درست‏نمائی بیشینه، جدایه‏ها شناسایی شدند. بر اساس بررسی‏های مولکولی و ریخت‏شناسی، جدایه‏های این تحقیق گونه‏هایAcremonium sclerotigenum، Alternaria destruens، Aspergillus sp.، Cladosporium puyae، Curvularia sp.، Fusarium sp.، Mucor circinelloides، Penicillium oxalicum، P. chrysogenum، Paramyrothecium terrestris، Rhizopus oryzaeوجدایه‌هایی از دو جنس Allophomaو Neodidymelliopsisاز خانوادهDidymellacaeرا شامل شدند. دو گونه‏ی Cladosporium puyae و Paramyrothecium terrestris  برای میکوبیوتای ایران جدید می‏باشند.

کلمات کلیدی:
ناحیه ITS, BLASTn, آنالیز فیلوژنتیکی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1178089/