رضا خلخالی ایوریق - دانشآموخته دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران
نعمت هدایت ایوریق - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران
حسن حافظیان - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران
ایوب فرهادی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران
محمدرضا بختیاری زاده - دانشیار، گروه علوم دام و طیور، پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران، پاکدشت، ایران

مطالعه حاضر بهمنظور شناسایی تنوع تعداد کپی و بررسی اثرات آنها بر ژنهای شترهای تککوهانه با استفاده از دادههای توالییابی کامل ژنومی دو نفر شتر ایرانی (شتر یزدی و شتر طرودی) انجام شد. توالییابی کامل ژنوم نمونههای یزدی و طرودی، به ترتیب حدود ۴۵۶ و ۸/۴۱۸ میلیون خوانش با اندازه ۱۰۰ جفتبازی تولید کرد. پس از همردیفی خوانشهای پالایش شده در ژنوم مرجع (شماره دسترسی در NCBI: GCA_۰۰۰۷۶۷۵۸۵.۱)، از الگوریتم مبتنی بر عمق خوانش، برای شناسایی تنوع تعداد کپیها استفاده شد. تنوع تعداد کپی شناساییشده برای نمونههای موردمطالعه برابر با ۸۳۱ برای شتر یزدی و ۳۱۲ برای شتر طرودی بود. نزدیک به ۶۰ درصد (۶۰۶ ژن برای شتر یزدی و ۲۸۸ ژن برای شتر طرودی) از تنوعات شناساییشده، با ژنها دارای تداخل بودند و ما بقی در نواحی خارج ژنی قرار داشتند. نتایج بهدستآمده نشان داد که ژنهای مهمی از جمله ژنهای دخیل در عملکرد سیستم ایمنی و مرگ سلولی برنامهریزیشده دارای تنوع تعداد کپی هستند. همچنین دو ژن مهم OOEP و WWC۳ که در عملکرد تولیدمثلی پستانداران نقش دارند، در نمونههای مورد مطالعه دارای تنوع تعداد کپی بودند.

توالییابی نسل بعد, تولیدمثل, ژن آنتولوژی, ژنومیکس‏