مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم با صفات تولید شیر و معیار سلولهای بدنی گاوهای هلشتاین ایران
Publish place: IRANIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE، Vol: 51، Issue: 3
Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 331
This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJAS-51-3_006
تاریخ نمایه سازی: 8 اردیبهشت 1400
Abstract:
در پرورش گاوشیری هدف اصلی افزایش سود است. افزایش بیماری ورمپستان از مشکلات اصلی پرورش گاوشیری با کاهش طولعمر تولیدی و افزایش هزینهها، سبب تحمیل زیانهای اقتصادی جدی به این صنعت شدهاست. این مطالعه باهدف بررسی معماری ژنتیکی و شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با صفات تولیدشیر و تعداد سلولهای بدنی بهعنوان یکی از شاخصهای ارزیابی کیفیت شیر و معیاری غیرمستقیم از بیماری ورمپستان، انجام شدهاست. برای بررسی ارتباط و شناسایی پنجرههای ژنومی اصلی، از روش مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم یکمرحلهای با دادههای ژنومی ۱۹۳۸ راس گاو نر استفاده شد. نتایج براساس واریانس ژنتیکی افزایشی پنجرههای ۵/۱ مگابازی از SNPهای مجاور ارائه شده است. پنجرههایی که بیش از ۱% واریانس را کنترل میکنند بهعنوان نواحی ژنومی اصلی و جهت یافتن ژنهای کاندیدا استفاده شدند. تعداد ۱۱ پنجره ژنومی اصلی روی ۹ کروموزوم اتوزوم، حاوی ۹۴ ژن کاندیدا حدود ۲۰% واریانس ژنتیکی معیار سلولهای بدنی را توصیف میکردند. بیشترین واریانس مربوط به پنجرهای روی کروموزوم ۱۴ (۸۵/۳%) بود. تعداد ۶ پنجره اصلی روی ۶ کروموزوم شامل ۸۹ ژن کاندیدا، مرتبط با تولیدشیر بودند. این پنجرهها ۸/۸% واریانس و مهمترین پنجره روی کروموزوم ۱۰، حدود ۰۸/۲% واریانس را کنترل مینمودند. درخصوص مقدار چربی و پروتئین شیر، بهترتیب تعداد ۹ منطقه روی ۷ کروموزوم، حدود ۶/۱۵% و ۹ پنجره روی ۸ کروموزوم، حدود ۶/۱۰% از واریانس را توصیف میکردند. نتایج نشان داد که ۴ ناحیه ژنومی اثر پلیوتروپی دارند. یافتههای این تحقیق میتواند بهعنوان منبع اطلاعاتی مهمی در ارزیابیهای ژنومی صفات تولید شیر و تعداد سلولهای بدنی باشد.
Keywords:
Authors
رستم پهلوان
دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
محمد مرادی شهربابک
استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
اردشیر نجاتی جوارمی
استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
رستم عبداللهی آرپناهی
محقق، دانشگاه فلوریدا، آمریکا