مطالعه لایه سطحی و پارا اسپورال بادی (MH۱۴) Bacillus thuringiensis Israelensis و پیشبینی پایدارسازی (Cry۴Ba) با ایجاد جهش نقطه ای بر اساس یافته های بیوانفورماتیک
Publish place: Biological Journal of Microorganisms، Vol: 4، Issue: 14
Publish Year: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 289
This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_BJM-4-14_015
تاریخ نمایه سازی: 12 اردیبهشت 1400
Abstract:
مقدمه: باسیلوس تورنجینسیس مهمترین عامل زیستی است که با تولید پارا اسپورال بادی، نقش مهمی در مقابله با آفات کشاورزی دارد. همچنین، لایه سطحی تولید میکند که ساختاری کریستالی از جنس پروتئین یا گلیکوپروتئین است و کاربرد وسیعی در نانوبیوتکنولوژی دارد. بنابراین، مطالعه آن دارای اهمیت است. مواد و روشها: در این مطالعه، پارا اسپورال بادی خالصسازی شده، مخلوط کریستال/ اسپور با کوماسیبلو G۲۵۰ رنگآمیزی و با میکروسکوپ نوری مشاهده شدند. با ایجاد جهش نقطهای، افزایش پایداری در پروتئین CRY۴Ba پیشبینی شد و جایگاه حفرهها در این پروتئین توسط نرم افزار molegro پیشبینیشد. در نهایت، لایه سطحی استخراج و شکل و وزن مولکولی آن بررسی شد. به منظور مقایسه لایه سطحی و پاراسپورالبادی، برخی ویژگیهای پروتئین آنها توسط پایگاه Protparam تعیین شد. نتایج: یافتهها گویای وجود کریستالهای پروتئینی چند وجهی بود که پس از آزاد شدن از اسپور مجتمع میشوند و کریستالهای درشتتر تشکیل میدهند. همچنین، در این پژوهش پیشبینی میشود که با جایگزینی اسید آمینه آسپارتیکاسید موقعیت ۴۵۱ با ایزولوسین، پروتئین مقاومتر کشنده حشرات CRY۴Ba ایجاد میشود. این پروتئین سه زیر واحدی حاوی ۵۹ حفره است و همانند لایهسطحی از همین سویه، درصد حضور اسیدهای آمینه متیونین، هیستیدین، سیستئین و تریپتوفان درآن بسیار پایین است. بحث و نتیجه گیری: باسیلوس تورنجینسیس در فاز اسپورزایی، کریستالهای کشنده حشرات تولید میکند که این کریستالها پس از رها شدن از اسپور مجتمع میشوند و کریستالهای درشتتر را تشکیل میدهند. پیشبینی میشود که جایگزینی آسپارتیکاسید موقعیت ۴۵۱ با ایزولوسین، موجب افزایش پایداری پروتئین CRY۴Ba میشود. این باکتری در فاز رویشی پروتئین سطحی KD۱۰۰ تولید میکند که از لحاظ ریختشناسی و درصد برخی اسیدهای آمینه به پارا اسپورالبادی شباهت بسیاری دارد.
Keywords:
لایه سطحی , پارا اسپورالبادی , CRY۴Ba , (MH۱۴) Bacillus thuringiensis Israelensis
Authors
غزال باب المراد
دانشجوی کارشناسی ارشد میکروبیولوژی، دانشگاه اصفهان، ایران
گیتی امتیازی
استاد میکروبیولوژی، دانشگاه اصفهان، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :