تجزیه و تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی با استفاده از مطالعات پویش کل ژنومی جهت شناسایی ژنها و مسیرهای مرتبط با تعداد نتاج در نژادهای مختلف گوسفند
عنوان مقاله: تجزیه و تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی با استفاده از مطالعات پویش کل ژنومی جهت شناسایی ژنها و مسیرهای مرتبط با تعداد نتاج در نژادهای مختلف گوسفند
شناسه ملی مقاله: JR_JAP-22-3_001
منتشر شده در در سال 1399
شناسه ملی مقاله: JR_JAP-22-3_001
منتشر شده در در سال 1399
مشخصات نویسندگان مقاله:
امیرحسین خلت آبادی فراهانی - استادیار گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه اراک
حسین محمدی - دانش آموخته دکتری گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
محمد حسین مرادی - . استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک، اراک، ایران
خلاصه مقاله:
امیرحسین خلت آبادی فراهانی - استادیار گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه اراک
حسین محمدی - دانش آموخته دکتری گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
محمد حسین مرادی - . استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک، اراک، ایران
هدف از این پژوهش، بررسی صفت تعداد نتاج در هر زایش میش بهعنوان یک صفت تولیدمثلی مهم بود. به این منظور از رکوردهای فنوتیپی هفت نژاد گوسفند وادی، هوی، ایسلندی، فینشیپ و رومانوف با باروری بالا و نژادهای تکسل و راهمنی با باروری پایین، برای مطالعه پویش ژنومی بر پایه آنالیز غنیسازی بهمنظور شناسایی مکانیسمهای زیستی استفاده شد. ارزیابی پویش کل ژنومی در بسته GenABEL برنامه R انجام شد. آنالیز غنیسازی مجموعه ژنی با بسته نرمافزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی طبقات عملکردی و مسیرهای زیستی ژنهای نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا انجام شد. در این پژوهش ژنهای BMP۵، DHCR۲۴، BMPR۱B، ESR۱، ESR۲ و PLCB۱ در نژادهای وادی و رومانوف، ژنهای SMAD۱، SMAD۲، INSR و PTGS۲ در نژادهای فینشیپ و هوی، ژنهای BMP۷، NCOA۱ و ERBB۴ در گوسفند ایسلند، ژنهای BMP۴، MSRB۳ و SPP۱ در نژاد تکسل، و ژنهای BMP۷، EGFR و KCNMA۱ در نژاد راهمنی با تعداد نتاج متولدشده مرتبط بودند. در تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی، تعداد ۳۰ مسیر با صفت تعداد نتاج در هر زایش مرتبط بودند. از بین مسیرهای زیستی شناساییشده، مسیرهای TGF-β signaling pathway،Oxytocin signaling pathway ، Estrogen signaling pathway، Prolactin signaling pathway وInsulin signaling pathway نقش مهمی در نرخ تخمکریزی و چند قلوزایی داشتند. با توجه به تایید مناطق قبلی پویش ژنومی و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافتههای این پژوهش میتواند در انتخاب ژنتیکی گوسفند از طریق تعداد نتاج بیشتر در هر زایش مفید باشد.
کلمات کلیدی: آنالیز غنیسازی, پویش ژنوم, چند قلوزایی, گوسفند, مسیرهای زیستی
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1194750/