CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

همسانهسازی و بررسی بیوانفورماتیکی توالی رمزگردان (CDS) ژن دلتا ۶ دسچوراز از قارچ مورتیرلا آلپینا سویه CBS ۷۵۴.۶۸

عنوان مقاله: همسانهسازی و بررسی بیوانفورماتیکی توالی رمزگردان (CDS) ژن دلتا ۶ دسچوراز از قارچ مورتیرلا آلپینا سویه CBS ۷۵۴.۶۸
شناسه ملی مقاله: JR_BJM-7-26_009
منتشر شده در در سال 1397
مشخصات نویسندگان مقاله:

عصمت اشعارقدیم - کارشناس ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه صنعتی شاهرود، شاهرود، ایران
شاهرخ قرنجیک - استادیار ژنتیک مولکولی و مهندسی ژنتیک، دانشگاه صنعتی شاهرود، شاهرود، ایران

خلاصه مقاله:
مقدمه: دسچورازهای غشایی و آنزیمهای وابسته به آنها نقشی اساسی در بیوسنتز اسیدهای چرب غیراشباع ایفا میکنند. دلتا ۶ دسچوراز، آنزیمی کلیدی در بیوسنتز اسیدهای چرب غیراشباع است. قارچ مورتیرلا آلپینا، گونهای روغنی و دارای دلتا ۶ دسچوراز فعال است و در سالهای اخیر مورد توجه پژوهشگران قرارگرفته است. مواد و روشها: پس از استخراج RNA و سنتز cDNA از قارچ مورتیرلا آلپینا سویه CBS ۷۵۴.۶۸، ژن دلتا ۶ دسچوراز توسط آغازگرهای اختصاصی حاوی توالی کوزاک تکثیر و قطعه تکثیرشده در ناقل همسانهسازی pBlueScriptSK+ حاوی پروموتور اختصاصی بذر ناپین درج شد. پلاسمید نوترکیب با استفاده از روش شیمیایی به باکتری اشریشیا کلی سویه DH۵α ترانسفورم شد. سازه حاصل در ناقل دوگانه pBI۱۲۱ همسانهسازی و برای انتقال به گیاه، به آگروباکتریوم سویه LBA۴۴۰۴ ترانسفورم شد. ویژگیهای بیوانفورماتیکی ژن موردنظر با سرورهای TMHMM، ProtParam و Psipred بررسی شد. نتایج: درستی همسانهسازی با استفاده از واکنش زنجیرهای پلیمراز توسط آغازگرهای اختصاصی، هضم آنزیمی و توالییابی تایید شد. تکثیر قطعه ۸۳۰ جفت نوکلئوتیدی با استفاده از آغازگر داخلی پروموتور ناپین و ژن دلتا ۶ دسچوراز، الحاق ژن در امتداد پروموتور ناپین را تایید کرد. نتایج توالییابی نوکلئوتیدی نشان دادند که توالی نوکلئوتیدی این ژن، ۱۳۷۴ جفت باز است و پروتئینی با ۴۵۷ آمینواسید را رمز میکند. وجود دمین سیتوکروم b۵، سه موتیف جعبه هیستیدین، دمینهای تراغشایی و حفاظتشده از طریق بررسی بیوانفورماتیک تایید شدند. بحث و نتیجهگیری: با استناد به نتایج بلاست پروتئینی و تایید حضور دمینهای کارکردی، پیشبینی میشود که توالی همسانهسازیشده از این قارچ دارای فعالیت آنزیمی مدنظر است. تایید این نتایج به بررسی بیان این ژن در سیستم گیاهی مناسب و بررسی کارکرد آن در سطح آنزیمی نیازمند است.

کلمات کلیدی:
همسانهسازی, اسیدهای چرب غیراشباع, ژن دلتا ۶ دسچوراز, مورتیرلا آلپینا

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1198642/