Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings
Login |Register |Help |عضویت کتابخانه ها
Paper
Title

ژنوتایپینگ جدایه های استرپتوکوکوس پیوژنز با استفاده از پروتکل بهینه RAPD-PCR

Year: 1398
COI: JR_BJM-8-32_012
Language: PersianView: 99
This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download

Buy and Download

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این Paper را که دارای 9 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

Authors

اکرم رحیمی مقدم - گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه الزهرا، تهران ایران
سیاوش سلمانزاده-اهرابی - گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه الزهرا، تهران، ایران
طاهره فلسفی - گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه الزهرا، تهران، ایران
مهوش سیفعلی - گروه علوم گیاهی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه الزهرا، تهران، ایران
زهرا پور رمضان - گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه الزهرا، تهران، ایران

Abstract:

مقدمه: استرپتوکوکوس پیوژنز بیماریهای عفونی و غیرعفونی متنوعی را ایجاد میکند. تایپینگ جدایههای استرپتوکوکوس پیوژنز یکی از ابزارهای ضروری در مطالعات اپیدمیولوژی مربوط به این باکتری هستند. RAPD-PCR یک تکنیک تایپینگ بر اساس PCR و روشی سریع، ارزان، آسان است. مشکل اصلی این روش تکرارپذیری کم نتایج است که با بهینه سازی پروتکل RAPD حل خواهد شد.مواد و روشها: در این مطالعه بهینهسازی پروتکل RAPD-PCR شامل روش استخراج DNA، نوع پرایمر، غلظت ترکیبات PCR و برنامه PCR با استفاده از طراحی فاکتوریال آزمایشها برای استرپتوکوکوس پیوژنز ATCC ۱۹۶۱۵ به عنوان سویه استاندارد انجام شد. سپس ۱۶ جدایه استرپتوکوکوس پیوژنز با استفاده از پروتکل بهینه ژنوتایپ شدند. تایپپذیری، تکرارپذیری و قدرت افتراق پروتکل بهینه تعیین شد.نتایج: از سه روش استخراج DNA، روش ست بافر تغییر یافته و از هفت پرایمر، پرایمر P۱۴ انتخاب شدند. غلظتهای بهینه ترکیبات PCR، ۳ mM MgCl۲، ۱۵۰ pmol primer P۱۴، ۰.۲ mM dNTPs، ۱۰ ng template DNA و ۲ U Taq DNA polymerase بودند. برنامه بهینه PCR از دناتوراسیون اولیه min ۴ در C°۹۴ و ۴۵ چرخه شامل min ۱ در C°۹۴، min ۲ در ۳۱، min ۲ در C°۷۲ و min ۱۰ در C°۷۲ برای تکثیر پایانی تشکیل شد. استرپتوکوکوس پیوژنز ATCC ۱۹۶۱۵ و همه جدایههای استرپتوکوکوس پیوژنز با استفاده از پروتکل بهینه تایپپذیر بودند و نتایج RAP-PCR آنها تکرارپذیر بود. قدرت افتراق محاسبه شده بسیار مطلوب بود (DI = ۱). ۱۶ جدایه استرپتوکوکوس پیوژنز متعلق به ۱۶ سویه بودند که در سه کلاستر اصلی با سطح تشابه ۱۴ درصد طبقهبندی شدند.بحث و نتیجهگیری: با بهینهسازی صحیح شرایط RAPD-PCR، یک پروتکل مناسب و تکرارپذیر برای ژنوتایپینگ جدایههای استرپتوکوکوس پیوژنز به دست آمد. پروتکل بهینه به دست آمده در این پژوهش را میتوان برای انجام RAPD-PCR در مطالعات اپیدمیولوژی جدایههای استرپتوکوکوس پیوژنز استفاده نمود.

Keywords:

Paper COI Code

This Paper COI Code is JR_BJM-8-32_012. Also You can use the following address to link to this article. This link is permanent and is used as an article registration confirmation in the Civilica reference:

https://civilica.com/doc/1198678/

How to Cite to This Paper:

If you want to refer to this Paper in your research work, you can simply use the following phrase in the resources section:
رحیمی مقدم، اکرم و سلمانزاده-اهرابی، سیاوش و فلسفی، طاهره و سیفعلی، مهوش و پور رمضان، زهرا،1398،ژنوتایپینگ جدایه های استرپتوکوکوس پیوژنز با استفاده از پروتکل بهینه RAPD-PCR،https://civilica.com/doc/1198678

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

  • References(1) Carapetis JR., Steer AC., Mulholland EK., Weber M. The ...
  • (2) Mori N., Hosoo S., Oyamada Y., Sera Y., Yamada ...
  • (3) Ray D., Saha S., Sinha S., Pal NK., Bhattacharya ...
  • (4) Kalgo HM., Jasni AS., Abdul Hadi SR., Umar NH., ...
  • (5) Imperi M., Pittiglio V., D'Avenio G., Gherardi G., Ciammaruconi ...
  • (6) Le Hello S., Doloy A., Baumann F., Roques N., ...
  • (7) RAI AR., Meshram SU., Dongre AB. Optimization of RAPD-PCR ...
  • (8) Sabat AJ., Budimir A., Nashev D., Sá-Leão R., van ...
  • (9) Nanvazadeh F., Khosravi AD., Zolfaghari MR., Parhizgari N. Genotyping ...
  • (10) Yoon JM., Kim GW. Randomly amplified polymorphic DNA-polymerase chain ...
  • (11) Kumari N., Thakur SK. Randomly amplified polymorphic DNA-a brief ...
  • (12) Yu K., Pauls KP. Optimization of the PCR program ...
  • (13) Singh S., Goswami P., Singh R., Heller KJ. Application ...
  • (14) Skorić M., Šiler B., Banjanak T., Živković J., Dmitrović ...
  • (15) Parvizi E., Nateghian A., Ahmadi A., Mirsaeedi K., Irajian ...
  • (16) Rahmani S., Forozandeh M., Mosavi M., Rezaee A. Detection ...
  • (17) Moazemian E., Kargar M., Asgharzadeh A., Hoseini Mazinani SM. ...
  • (18) Sambrook J., Russel D. Molecular cloning. 3rd ed. New ...
  • (19) González-Rey C., Belin AM., Jörbeck H., Norman M., Krovacek ...
  • (20) Dey N., McMillan DJ., Yarwood PJ., Joshi RM., Kumar ...
  • (21) Brandt CM., Allerberger F., Spellerberg B., Holland R., Lütticken ...
  • (22) Erfanmanesh A., Soltani M., Pirali E., Mohammadian S., Taherimirghaed ...
  • (23) Nur-Nazifah M., Sabri MY., Zamri-Saad M., Siti-Zahrah Firdaus-Nawi AM. ...
  • (24) AL-Ameri GA., AL-Kolaibe AM. Identification and genotypic analysis of ...
  • (25) Seppälä H., He Q., Osterblad M., Huovinen P. Typing ...
  • (26) Ashayeri-Panah M., Eftekhar F., Feizabadi MM. Development of an ...
  • (27) Atienzar FA., Jha AN. The random amplified polymorphic DNA ...
  • (28) Jain SK., Neekhra B., Pandey D., Jain K. RAPD ...
  • (29) Perry AL., Worthington T., Hilton AC., Lambert PA., Stirling ...
  • (30) Sijapati J., Rana N., Rana P., Shrestha S. Optimization ...
  • (31) Saiki R. The Design and Optimization of the PCR. ...
  • (32) Peng Y., Jin J., Wu C., Yang J., Li ...
  • (33) Padmalatha K., Prasad MNV. Optimization of DNA isolation and ...
  • (34) Harini SS., Leelambika M., Shiva Karmeswari MN., Sathyanarayana N. ...
  • (35) Markoulatos P., Siafakas N., Moncany M. Multiplex polymerase chain ...
  • (36) Nodarse JF., Rodríguez J., Fuentes O., Castex LM., Fernández-Calienes ...
  • (37) Sairkar P., Chouhan S., Batav N., Sharma R. Optimization ...

Research Info Management

Certificate | Report | من نویسنده این مقاله هستم

اطلاعات استنادی این Paper را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

Scientometrics

The specifications of the publisher center of this Paper are as follows:
Type of center: دانشگاه دولتی
Paper count: 7,940
In the scientometrics section of CIVILICA, you can see the scientific ranking of the Iranian academic and research centers based on the statistics of indexed articles.

Share this page

More information about COI

COI stands for "CIVILICA Object Identifier". COI is the unique code assigned to articles of Iranian conferences and journals when indexing on the CIVILICA citation database.

The COI is the national code of documents indexed in CIVILICA and is a unique and permanent code. it can always be cited and tracked and assumed as registration confirmation ID.

Support