CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

آنالیز ژنتیکی ژنهای پپتید سنتتاز (NRPSs) در بیوسنتز محصولات طبیعی سیانوباکتری های دریاچه لواسان

عنوان مقاله: آنالیز ژنتیکی ژنهای پپتید سنتتاز (NRPSs) در بیوسنتز محصولات طبیعی سیانوباکتری های دریاچه لواسان
شناسه ملی مقاله: JR_BJM-8-30_003
منتشر شده در در سال 1398
مشخصات نویسندگان مقاله:

بهاره نوروزی - گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران
عباس اخوان - گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران
غزاله سلطانی - گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران

خلاصه مقاله:
  مقدمه‎:‎ سیانوباکتری ها، کاندیدای خوبی برای کشف محصولات طبیعی با کاربرد در صنایع داروسازی هستند. امروزه، عمده متابولیتهای بیواکتیو جدا شده از سیانوباکتری ها به صورت پلی کتیدی ، پپتیدهای غیر ریبوزومی و یا هیبریدی از این دو هستند. به رغم مطالعات بسیار در زمینه پراکنش ژنهای NRPS، هیچکدام از آنها در زمینه سویه های سیانوباکتریایی دریاچه لواسان نبوده است. بنابراین، هدف از این مطالعه بررسی همبستگی بین حضور این ژنها با سنتز ترکیبات طبیعی است.مواد و روش ها: در این مطالعه، ده سیانوباکتری آب شیرین از دریاچه لواسان بر اساس توالی ژن ‎۱۶SrRNA‎ شناسایی شدند. PCR ژن NRPS با استفاده از تکنیکهای مولکولی به منظور آنالیز فیلوژنتیک ژنهای مسئول برای تولید متابولیتهای ثانویه انجام شد. به منظور پیشگویی ترکیب پپتیدی، اسید آمینه فعال شده و توالی های امضای مودول آدنیلیشن NRPS از نرم افزارهای بیوانفورماتیک استفاده گردید. آزمایشات غربال گری آنتی بیوگرام با استفاده از روش دیسک انجام گردید. نتایج: نتایج نشان داد که ژنهای NRPS در همه سویه های مطالعه شده موجودند. به علاوه، نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل های بیوانفورماتیک، نوع ترکیب طبیعی، توالی های امضا و پیشگویی اسید آمینه فعال شده را نشان داد. خوشه بندی توالی های پروتئینی NRPS نشان داد که هیچ همبستگی فیلوژنتیکی مشخصی بین دمین های آدنیلیشن و نوع اسید آمینه فعال شده وجود ندارد و این نشان از تنوع بالا درون دمین های آدنیلیشن است. علاوه بر آن، نتایج حاصل از آزمایشات آنتی بیوگرام، همبستگی مثبتی بین حضور این ژنها و فعالیت آنتی میکروبی را نشان داد. بحث‎ ‎و‎ ‎نتیجه‎ ‎گیری‎:‎ آنالیز توالی ها نشان داد که آنزیم های رمزگزاری کننده این ژن ها احتمالا مسئول تولید متالبولیتهای ثانویه جدید مانند آنتی بیوتیکها هستند. نتایج حاصل از مطالعه حاضر نشان می دهد که سیانوباکتری های آب شیرین ایران، منبع قابل قبولی برای تولید ترکیبات دارویی هستند.

کلمات کلیدی:
ژنهای پپتید سنتتاز (NRPSs), سیانوباکتری های آب شیرین, آنالیز ژنتیکی, دریاچه لواسان, محصولات طبیعی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1198701/