CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

تحلیل فیلوژنتیکی پروتئین HC-Pro جدایههای ایرانی ویروس موزاییک زرد لوبیا

عنوان مقاله: تحلیل فیلوژنتیکی پروتئین HC-Pro جدایههای ایرانی ویروس موزاییک زرد لوبیا
شناسه ملی مقاله: JR_BJM-9-34_004
منتشر شده در در سال 1399
مشخصات نویسندگان مقاله:

علی برادر - گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ولی عصر رفسنجان، ایران
احمد حسینی - گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ولی عصر رفسنجان، ایران
ثمین حسینی - گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ولی عصر رفسنجان، ایران
سمیه عبدانی بابکی - گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ولی عصر رفسنجان، ایران

خلاصه مقاله:
مقدمه: ویروس موزاییک زرد لوبیا (Bean yellow mosaic virus)به جنس Potyvirus و خانواده Potyviridaeتعلقدارد و دارای پراکندگی جهانی گسترده و دامنه میزبانی وسیع است. در پژوهش حاضر، روابط فیلوژنتیکی ۸ جدایه این ویروس که در سالهای زراعی ۹۶ و ۹۷ از مناطق جغرافیایی مختلف ایران (آذربایجان شرقی، اردبیل، قزوین، زنجان، همدان، خوزستان، فارس و کرمان) از روی باقلا جدا شده بودند، در مقایسه با سایر جدایههای موجود در بانک ژن بررسی شدند. مواد و روشها: برگهای گیاهان دارای نشانههای ویروسی از مزارع باقلای نواحی مختلف ایران نمونهبرداری و به آزمایشگاه منتقل شدند. بهمنظور تشخیص نمونههای آلوده به ویروس موزاییک زرد لوبیا، ابتدا از آزمون داس الیزا و آنتیبادی اختصاصی ویروس استفاده شد؛ سپس RNA کل نمونههای آلوده استخراج و ناحیه HC-Proجدایههای انتخابی تکثیر و توالییابی شد. ارزیابی توالی، بررسی روابط فیلوژنتیکی، بررسی ساختار پروتئینی و همچنین شناسایی وقوع نوترکیبی در ناحیه HC جدایههای BYMV انتخابی با نرمافزارهای مختلف انجام شد. نتایج: در درخت فیلوژنتیکی رسمشده، جدایههای ایرانی در دو گروه مونوفیلتیک مجزا قرار گرفتند؛ بهطوریکه پنج جدایه آذربایجان شرقی، قزوین، زنجان، فارس و کرمان در کنار دو جدایه از استرالیا و ژاپن که همگی از روی باقلا جدا شده بودند، در یک گروه جای گرفتند و جدایههای اردبیل، همدان و خوزستان به همراه دو جدایه دیگر ایرانی موجود در بانک ژن، دو جدایه از هند و دو جدایه از ژاپن در گروه دیگر قرار گرفتند. بر اساس نتایج آزمون نوترکیبی، هیچکدام از جدایههای ایرانی جمعآوریشده در پژوهش حاضر، جدایه نوترکیب تشخیص داده نشدند. بحث و نتیجهگیری: درک تغییرات ژنتیکی و نوترکیبی جمعیت ویروسی پیشنیاز مهمی برای تشخیص کارآمد، مدیریت موثر و کنترل بیماری در درازمدت است. قطعا نتایج در توسعه راهکارهایی کاربرد دارند که به مقاومت در برابر BYMV منتج میشوند و چنانچه این بیماری در آینده همهگیر شود، میتوانند در راستای اتخاذ راهبردهای مدیریتی اثربخش باشند.

کلمات کلیدی:
تحلیل فیلوژنتیکی, آرایهبندی, HC-Pro, BYMV

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1198714/