ارزیابی تنوع ژنتیکی زعفران (Crocus sativus L.) با استفاده از نشانگرهای مولکولی iPBS و SSR
عنوان مقاله: ارزیابی تنوع ژنتیکی زعفران (Crocus sativus L.) با استفاده از نشانگرهای مولکولی iPBS و SSR
شناسه ملی مقاله: JR_JSRB-4-1_008
منتشر شده در در سال 1395
شناسه ملی مقاله: JR_JSRB-4-1_008
منتشر شده در در سال 1395
مشخصات نویسندگان مقاله:
مهدی بیات - دانش آموخته دکتری زراعت، گرایش اکولوژی گیاهان زراعی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه
رضا امیرنیا - دانشیار دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه
مهدی تاجبخش - ۳- استاد دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه
بهاتین تانیولاچ - استاد دانشکده بیومهندسی، دانشگاه اگه، ازمیر، ترکیه.
خلاصه مقاله:
مهدی بیات - دانش آموخته دکتری زراعت، گرایش اکولوژی گیاهان زراعی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه
رضا امیرنیا - دانشیار دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه
مهدی تاجبخش - ۳- استاد دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه
بهاتین تانیولاچ - استاد دانشکده بیومهندسی، دانشگاه اگه، ازمیر، ترکیه.
به منظور مطالعه تنوع ژنتیکی زعفران، شش اکوتیپ زراعی از نقاط مختلف استان خراسان رضوی (مشهد، تربتجام، گناباد و تربتحیدریه) و استان خراسان جنوبی (قاین و بیرجند) تهیه و با استفاده از نشانگرهای مولکولی iPBS و SSR مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج تجزیههای مولکولی نشان داد که ۲۸ نشانگر iPBS و ۲۲ نشانگر SSR به ترتیب ۱۷۹ و ۴۴ آلل چندشکلی را شناسایی نمودند و تعداد باندهای تکثیر یافته برای هر نشانگر به ترتیب ۱۰-۳ (میانگین ۴/۶) و ۳-۱ (میانگین ۲) بود. همچنین میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی نشانگرهای iPBS و SSR به ترتیب ۷۹/۰ و ۴۰/۰ تخمین زده شد. از طرفی، نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که بر اساس نشانگر iPBS واریانس درون اکوتیپها نسبت به واریانس بین اکوتیپها بیشتر میباشد، در حالیکه بر اساس نشانگر SSR واریانس بین اکوتیپها بیشتر از واریانس داخل اکوتیپها بود. همچنین تجزیه خوشه، اکوتیپهای مورد مطالعه را در سه گروه قرار داد و این گروهبندی توسط تجزیه به مولفههای اصلی مورد تایید قرار گرفت. با اینحال، اکوتیپهای بیرجند و گناباد و همچنین اکوتیپهای تربتحیدریه و قاین از لحاظ هر دو تجزیه خوشهای اختلاف معنیداری با یکدیگر نداشتند. با اینحال، شباهت ژنتیکی بالایی بین کلیه اکوتیپهای زعفران گزارش شد. نتایج این تحقیق نشان داد اگر چه هر دو نشانگر در ارزیابی تنوع ژنتیکی اکوتیپهای زعفران کارآمد بودند، ولی نشانگر iPBS در مقایسه با نشانگر SSR کارایی بالاتری در تعیین تنوع ژنتیکی اکوتیپهای مورد مطالعه زعفران داشت.
کلمات کلیدی: اکوتیپ, تجزیه به مولفه های اصلی, تجزیه خوشه ای, محتوای اطلاعات چندشکلی
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1203743/