مقایسه الگوی PCR-RFLP با توالی یابی مستقیم ناحیه ITS نمدارهای هیرکانی
Publish place: Taxonomy and biosystematics، Vol: 5، Issue: 17
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 233
This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_TBJ-5-17_007
تاریخ نمایه سازی: 23 اردیبهشت 1400
Abstract:
یکی از نشانگرهایی که امروزه به عنوان DNA بارکد برای گونه های گیاهی پیشنهاد می شود، تعیین توالی ناحیه هسته ای ITS است. از آنجا که توالی یابی روشی پر هزینه و نیازمند زمان طولانی است، این مطالعه با به کارگیری روش PCR-RFLP قصد دارد تا ضمن مطالعه الگوی چند شکلی ناحیه ITS نمدارهای هیرکانی، نتایج این دو روش (توالی یابی و PCR-RFLP) را با یکدیگر مقایسه نماید. به این منظور با استفاده از هشت آنزیم برشی، الگوی الکتروفورزی ۹ گونه نمدار جمع آوری شده از جنگل های هیرکانی شمال ایران بررسی شد. نتایج نشان داد که علاوه بر آنزیم EcoRI که فاقد جایگاه برش در گیاهان گل دار است، آنزیم BsrBI نیز در تمام توالی های نمدار مطالعه شده، بدون جایگاه برش است. هر دو روش گونه های مورد بررسی را در ۹ گروه مجزا قرار داد و تنها تفاوت در گروه بندی گونه Tilia begonifolia Steven است که یکی از پایه های آن در روش RFLP با گونه T. hyrcana Tabari and Colagar و در روش توالی یابی مستقیم با گونه T. rubra Rupr. در گروهی مجزا قرار گرفته است. همچنین، میزان همسویی نسبتا بالای این دو روش با استفاده از آزمون منتل نیز تایید شد (۵۷/۰r=). تحلیل PCoA نیز گویای تمایز گونه های T. dasystyla، T. hyrcana و T. rubra و با منشا هیرکانی از یکدیگر است و تنها گونه T. begonifoila را نتوانسته است از این گونه ها جدا نماید. بنابراین، با توجه به نیاز به صرف زمان و هزینه کمتر برای روش PCR-RFLP ناحیه ITS و نیز همسویی نسبتا بالای نتایج آن با روش توالی یابی مستقیم، این روش به عنوان روشی مناسب، ساده و کم هزینه برای تبارشناسی گونه های گیاهی پیشنهاد می شود.
Keywords:
Authors
حامد یوسف زاده
گروه جنگل داری، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تربیت مدرس، نور، ایران
حمید بینا
گروه جنگل داری، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تربیت مدرس، نور، ایران
اباصلت حسین زاده کلاگر
گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه مازندران، بابلسر، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :