استفاده از نشانگرهای اینترون-اگزون برای ارزیابی تنوع ژنتیکی در دو زیرگونه آویشن دنایی (Thymus daenensis)
Publish place: Taxonomy and biosystematics، Vol: 5، Issue: 16
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 194
This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_TBJ-5-16_004
تاریخ نمایه سازی: 23 اردیبهشت 1400
Abstract:
مطالعه تنوع ژنتیکی در گیاهان دارویی از اهداف مهم اصلاحی و تکاملی است. در بررسی حاضر، تنوع ژنتیکی دو زیرگونه آویشن دنایی با استفاده از آغازگرهای نیمه تصادفی اینترون-اگزون مطالعه شد. از ۳۰ آغازگر استفاده شده، ۹۸ درصد چندشکلی از ۶۳۳ نوار تکثیر شده، ایجاد شد. بیشترین محتوای اطلاعات چندشکلی را آغازگرهای ISJ۵ و ISJ۹ و کمترین مقدار را IT۱۵-۳۲ به خود اختصاص داد. بیشترین شاخص نشانگر را آغازگر IT۱۰-۶ ایجاد کرد. تجزیه واریانس مولکولی بیانگر تنوع در خور توجه درون دو زیرگونه آویشن دنایی نسبت به تنوع بین آنها بود. دندروگرام حاصل از تجزیه خوشه ای با روش UPGMA و ضریب تشابه دایس با نرم افزار NTSYS توده ها را به چهار گروه تقسیم کرد. بیشترین دامنه تشابه ژنتیکی بین دو توده از زیرگونه آویشن دنایی مشاهده شد. دو توده مربوط به استان های فارس و سمنان نیز هر کدام یک گروه جداگانه را تشکیل دادند. نتایج گروه بندی حاصل از داده های مولکولی با گروه بندی تجزیه مختصات اصلی مطابقت داشت. همچنین، گروه بندی تجزیه خوشه ای توانست تا حدودی دو زیرگونه آویشن دنایی را از یکدیگر تفکیک نماید. نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که نشانگرهای اینترون-اگزون ابزار موثری در بررسی روابط خویشاوندی دو زیرگونه آویشن دنایی بوده است.
Keywords:
Authors
احمد اسماعیلی
گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران
فرزانه مجیری
گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران
سیده زهرا حسینی
گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه صنعتی خاتم الانبیاء بهبهان، بهبهان، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :