بررسی ساختار ژنتیکی و تجزیه فیلوژنتیکی گوزن قرمز ایران بر اساس ناحیه D-Loop میتوکندری
عنوان مقاله: بررسی ساختار ژنتیکی و تجزیه فیلوژنتیکی گوزن قرمز ایران بر اساس ناحیه D-Loop میتوکندری
شناسه ملی مقاله: JR_ANIMAL-29-4_002
منتشر شده در در سال 1398
شناسه ملی مقاله: JR_ANIMAL-29-4_002
منتشر شده در در سال 1398
مشخصات نویسندگان مقاله:
لیلا آقازاده - گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
سعید نیک بین - گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
فرزاد میرزایی آقجه قشلاق - گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
نعمت هدایت ایوریق - گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
خلاصه مقاله:
لیلا آقازاده - گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
سعید نیک بین - گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
فرزاد میرزایی آقجه قشلاق - گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
نعمت هدایت ایوریق - گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
زمینه مطالعاتی: آنالیز ژنتیکی جمعیتهای وحشی برای حفظ تنوع زیستی و افزایش دانش در مورد بقای این گونهها و یافتن عوامل تهدید کننده و یا کمک کننده در حفظ این جمعیت مهم و ضروری میباشد. هدف: لذا مطالعه حاضر برای شناسایی توده ژنتیکی موجود، بررسی چگونگی روابط، شکلگیری و تنوع ژنتیکی مارالهای ایرانی با بهرهگیری از اطلاعات توالی ناحیه D-Loop از ژنوم میتوکندریایی انجام شد. روش کار: جهت انجام پژوهش حاضر نمونههای خون، مو یا بافت ۷۸ راس مارال اخذ و DNA آنها استخراج گردید. ناحیه D-Loop از ژنوم میتوکندریایی با استفاده آغازگرهای اختصاصی با روش PCR تکثیر شده و تمامی محصولات PCR توالییابی گردید. سپس توالیهای مورد نظر با استفاده از نرم افزارهای BioEdit جهت بررسی تنوع نوکلئوتیدی همتراز شد، با استفاده از نرم افزار Mega ، درخت فیلوژنتیکی رسم گردید. توالیهای مارال با استفاده از نرم افزار DnaSp آنالیزشد. نتایج: نتایج حاصل منجر به شناسایی جهشهایی گردید که به ایجاد ۵ هاپلوتیپ برای ناحیه D-Loop منتهی شد و تنوع هاپلوتیپی، تنوع نوکلئوتیدی و متوسط تفاوت نوکلئوتیدی برای ناحیه D-Loop به ترتیب ۲۱۸/۰ ، ۰۰۰۷/۰ و ۴۹۱/۰ بهدست آمد. شاخصهای تنوع ژنتیکی نشان داد که شش جمعیت مورد بررسی مارال احتمالا تجربه باتل نک را پشت سر گذاشته است. نتیجهگیری: در پرتو نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل جمعیتها از این هاپلوتیپها ، میتوان نتیجهگیری کرد که نوسانات اخیر در اندازه جمعیت و وقفه در جریان ژن به دلیل انتقال گوزنهای قرمز یک جمعیت به سایر زیستگاهها در گذشته باشد.
کلمات کلیدی: تنوع زیستی, فیلوژنی, مارال, D-Loop, mtDNA
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1212744/