مقایسه دو روش بیزی بدون انتخاب متغیر( بیز A )و توام با انتخاب متغیر (بیز B )در ارزیابی ژنومیک با معماری متفاوت ژنتیکی

هدف از انجام تحقیق حاضر، مقایسهء دو روش آماری در پیش بینی ارزشهای اصلاحی ژنومیک برای صفاتی با معماری ژنتیکی متفاوت ازنظر توزیع تاثیرات ژنی و نیز تعداد متفاوت جایگاه های صفت کمی )QTL( با استفاده از شبیه سازی کامپیوتری است. بدین منظور، ژنومی متشکل از ۵ کروموزوم هر یک به طول یک مورگان شبیه سازی گردید که بر روی هر کروموزوم ۱۰۰۰ نشانگر تک نوکلئوتیدی (SNP) با فراوانی اولیه یکسان ۰/۵ در دو سناریوی ۱۰۰ و QTL ۳۰۰ بهطور یکنواخت پخش گردید. اثر جایگزینی QTLها با استفاده از توزیع نرمال استاندارد و یکنواخت (حداقل صفر و حداکثر یک) و در دو سطح از وراثت پذیری ۰/۱) و (۰/۵ مدلسازی شد. به منظور پیشبینی ارزش های اصلاحی افراد موجود در جمعیت های مرجع و تایید، از دو روش بیز A (بدون انتخاب متغیر) و بیز B (توام با انتخاب متغیر) استفاده گردید. با افزایش فاصله بین نسل مرجع و نسل تایید ناشی از برهم خوردن فاز لینکاژ، صحت ارزش های اصلاحی ژنومیک در هر دو روش نشان دهندهء کاهش معنیداری بود .(P<۰/۰۵) با افزایش وراثت پذیری هر دو روش افزایش صحت را به طور آشکاری نشان دادند. زمانی که وراثت پذیری صفت پایین (۰/۱) بود برتری بیز A مشهودتر بود. در توزیع اثرات ژنی به صورت یکنواخت، هر دو روش اندکی بهتر نسبت به توزیع نرمال عمل کردند که باز هم بیز A، صحت ارزش اصلاحی ژنومی بالاتری را ایجاد کرد. با افزایش تعداد QTL از ۱۰۰ به ۳۰۰ صحت ارزش اصلاحی ژنومیک در هر دو روش کاهش یافت.

Keywords:

ارزش اصلاحی , معماری ژنتیکی , روش بیزی , شبیه سازی , ژنوم