بررسی سه ویژگی جرم، آبگریزی و قطبیت در شناسایی مکان های اتصال RNA در دنباله پروتئین ها
Publish place: Twelfth National Conference on Computer Science and Engineering and Information Technology
Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 354
This Paper With 7 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CECCONF12_057
تاریخ نمایه سازی: 16 خرداد 1400
Abstract:
میان کنش بین RNA و پروتئین نقش اساسی در فرآیندهای مختلف بیولوژیکی نظیر فرآیندهای mRNA، ساخت پروتئین و عملکرد ریبوزوم ایفا می کنند. در این پژوهش به بررسی مکان های اتصال RNA در پروتئین ها بوسیله سه ویژگی جرم، قطبیت و آبگریزی پرداخته شده است. به منظور ارزیابی از اعتبارسنجی متقاطع ۵ تایی بر روی مجموعه داده های RBP۷۷ و RBP۱۰۷ استفاده شد و در مجموعه داده RBP۷۷ به نتایج قطبیت با بیشترین مقدار حساسیت برابر ۷۰.۴۵ و ضریب همبستگی برابر ۰.۶۵۵۵، آبگریزی با بیشترین مقدار اختصاصیت برابر ۹۴.۰۹ و جرم با بیشترین مقدار صحت برابر ۸۷.۹۴ و RBP۱۰۷ به نتایج قطبیت با بیشترین مقدار حساسیت برابر ۶۲.۷۰ و ضریب همبستگی برابر ۰.۴۲۴۶، آبگریزی با بیشترین مقدار اختصاصیت برابر ۸۷.۷۸ و صحت برابر ۸۴.۶۲ دست یافتیم. که این نتایج نشان دهنده تاثیر خوب این ویژگی ها در شناسایی مکان های اتصال RNA در دنباله پروتئین ها می باشد.
Keywords:
میان کنش پروتئین و RNA , شناسایی مکان های اتصال RNA , ماشین بردار پشتیبان , ماتریس امتیاز موقعیت خاص
Authors
مهدی وثیقی
دانشگاه تحصیلات تکمیلی زنجان
مرضیه بهرامی
دانشگاه تحصیلات تکمیلی زنجان