شناسایی، تعیین توالی و ارزیابی پایداری بیان هشت ژن مرجع گیاه زعفران (.Crocus sativus L)

زعفران (.LCrocus sativus ) ارزشمندترین و گران ترین ادویه در سطح جهان است. کلاله های این گیاه منبع آپوکاروتنوئیدهای با ارزشی مانند کروسین، پیکروکروسین و سافرانال هستند. مطالعات ترنسکریپتومی و بیانی ژن ها یکی از مهم ترین مراحل در بررسی تولید متابولیت های ثانویه در گیاهان هستند. یکی از پیش نیازهای مهم در این گونه مطالعات، شناسایی ژن های مرجع قابل اعتماد و پایدار به منظور نرمال سازی بیان سایر ژن ها است. در پژوهش حاضر، با استفاده از ترنسکریپتوم گیاه زعفران هشت ژن مرجع شناسایی و تعیین توالی شد، سپس میزان پایداری بیان آن ها با استفاده از روش های غیرپارامتریک مورد بررسی قرار گرفت. نتایج تکثیر و توالی یابی، جداسازی صحیح هشت ژن مرجع Actin، EF۱، GAPDH، H۳، MDH، TBP، UBC و UBQ را از گیاه زعفران نشان داد. بررسی میزان پایداری بیان ژن های مرجع نشان داد که ژن های MDH و UBQ به ترتیب بیشترین میزان پایداری را بین بافت های مختلف گیاه زعفران داشته و کمترین میزان پایداری مربوط به ژن TBP بود. در این پژوهش توالی هشت ژن مرجع در زعفران جداسازی و پایداری بیان آن ها برای اولین بار در بافت های مختلف این گیاه سنجیده شد. ژن های مرجع شناسایی شده در این پژوهش می توانند به عنوان ژن های پایدار برای نرمال سازی بیان ژن ها در مطالعات ترنسکریپتومی گیاه زعفران به کار برده شوند.

Keywords:

Non-parametric statistics , Gene expression stability , Transcriptome , Saffron , Reference genes , آماره های غیرپارامتریک , پایداری بیان ژن , ترنسکریپتوم , زعفران , ژن های مرجع