CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

ارزیابی تنوع ژنتیکی پنج گونه جنس Fraxinus با نشانگرهای کلروپلاستی

عنوان مقاله: ارزیابی تنوع ژنتیکی پنج گونه جنس Fraxinus با نشانگرهای کلروپلاستی
شناسه ملی مقاله: NSBDIAE05_072
منتشر شده در پنجمین همایش ملی تنوع زیستی و تاثیر آن بر کشاورزی و محیط زیست در سال 1399
مشخصات نویسندگان مقاله:

یوسف محمدی - استادیار پژوهشی، دکترای تخصصی اصلاح نباتات، بخش تحقیقات زیست فناوری، موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
فرزاد بنائی اصل - استادیار پژوهشی، دکترای تخصصی اصلاح نباتات، بخش تحقیقات زیست فناوری، موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
شیوا قیطران پور سهریق - دانشجوی دکترای اصلاح نباتات، گروه بهنژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران

خلاصه مقاله:
شناسایی گونه های یک جنس از طریق مورفولوژی گیاه همواره با خطا همراه است. استفاده از نشانگرهای کلروپلاستی نقش مهمی در تمایز گونه ها دارد. بنابراین شناسایی گونه های مختلف جنس ون با استفاده از توالی های کلروپلاستی هدف گذاری شده است. توالی پنج گونه ون از داده پایگاه NCBI دانلود و پس از همردیفی چند گانه توالیها، تشکیل ماتریس فاصله انجام و ترسیم درخت فیلوژنتیکی با استفاده از کل توالی ژنومی و نواحی SSC LSC و IR با نرم افزار MEGA۷ صورت گرفت. درخت فیلوژنتیکی حاصل از آنالیز فیلوژنتیکی با روش های حداکثر درست نمایی و اتصال همسایه، سه کلاد کاملا مشخص را نشان داد که پنج گونه ون از همدیگر به طور واضح تمایز یافتند. نتایج نشان داد که کل طول ژنوم و ناحیه LSC و SSC توانایی لازم برای تمایز پنج گونه مختلف ون را دارند.

کلمات کلیدی:
آنالیز فیلوژنتیکی، ون، ژنوم کلروپلاستی، MEGA۷

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1226907/