در این تحقیق ابتدا از یک طرف دادههای دما، بارش، تبخیر و تعرق پتانسیل کوچک مقیاس شده و از طرف دیگر وضعیت هیدرولوژیکی حوضه شبیه سازی شده و در نهایت برای تولید سری های زمانی پیش بینی جریان رودخانه در آینده مورد استفاده قرار گرفته اند . به این منظور نتایج مدل اقلیمی HadCM۳ تحت دو سناریوی A۲ و B۲ با استفاده از نرم افزار SDSM کوچک مقیاس شده و سپس بوسیله مدل SWAT جریان رودخانه در سه دوره زمانی ۲۰۳۹-۲۰۱۰ (۲۰۲۰s)؛ ۲۰۶۹-۲۰۴۰ (۲۰۵۰s)؛ ۲۰۹۹-۲۰۷۰ (۲۰۸۰s) و دوره پایه ۱۹۹۰-۱۹۶۱ (Baseline)، تحت دو سناریوی A۲ و B۲ شبیه سازی شده و در نهایت اثرات تغییر اقلیم بر منابع آب این حوضه تا اواخر قرن حاضر ارزیابی شد . نتایج بدست آمده نشان دهنده کاهش متوسط دبی سالانه به مقدار ۶/۳، ۱۶/۹ و ۲۴/۱ در دوره های ۲۰۵۰s, ۲۰۲۰s و ۲۰۸۰s در سناریو A۲ و به ترتیب ۱۰/۹، ۸/۸ و ۱۳/۲ درصد تحت سناریو B۲ در آینده می باشد. این نتایج نشان میدهد که تغییر اقلیم میتواند بعنوان یکی از پدیدههایی که مقدار آب ورودی به حوضه سد ایلام را تحت تاثیر قرار دهد مورد نظر مدیران و برنامه ریزان قرار گیرد.