تجزیه ارتباطی صفات آگروموفولوژیک در لاین های ذرت با استفاده از نشانگرهای مبتنی بر رتروترنسپوزون IRAP و REMAP

Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 342

This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCB-13-38_002

تاریخ نمایه سازی: 4 مهر 1400

Abstract:

ذرت (Zea mays L.) یکی از مهم­ترین محصولات غذایی در سراسر جهان بوده و به عنوان گیاه مدل برای مطالعه ژنتیک صفات مختلف استفاده می ­شود. شناسایی مکان­های ژنی کنترل­ کننده صفات کمی از موضوع­های مهم حوزه ژنتیک و به ­نژادی است. در این مطالعه ۱۰۰ لاین خالص ذرت از لحاظ صفات آگرومورفولوژیک (ارتفاع بوته، ارتفاع بوته تا اولین بلال، طول و عرض برگ، سطح برگ، شاخص سطح برگ، تعداد بلال، میزان کلروفیل، وزن دانه در هر بوته، وزن چوب بلال، قطر ابتدای چوب بلال، قطر وسط چوب بلال، طول چوب بلال، وزن خشک بوته، تاریخ ظهور گل نر، تاریخ ظهور بلال اول و تاریخ ظهور بلال دوم) با طرح پایه کاملا تصادفی با شش تکرار ارزیابی شدند. در آزمایش مولکولی پروفیل مولکولی لاین ها با هشت آغازگر نشانگرهای مبتنی بر رتروترنسپوزون؛ IRAP و REMAP تهیه شد. هشت ترکیب آغازگر IRAP وREMAP  ۴۰ مکان ژنی را تکثیر کردند. از این ۴۰ مکان، ۳۸ مکان ژنی (۹۵ درصد) چندشکلی نشان دادند. دامنه PIC در لاین های مورد مطالعه از ۰/۰۸۴ برای نشانگر Ac/Ds تا ۰/۳۸۳ برای نشانگر Pangrangja متغیر بود. فاصله ژنتیکی نی بین لاین­های تهیه شده از مشهد و کرمانشاه ۰/۰۵۳، کرج و مشهد ۰/۰۳۶، کرمانشاه و کرج ۰/۰۳۲ برآورد شد. در تجزیه ساختار جمعیت بر اساس نشانگرهای مولکولی، ۱۰۰ لاین مورد مطالعه در دو زیر جمعیت (K=۲) گروه­بندی شدند. در تجزیه ارتباطی صفات اگرو-مورفولوژیک براساس دو روش GLM و MLM به ترتیب ۲۴ و ۱۲ ارتباط نشانگر-صفت شناسایی شد. در این تحقیق دو نشانگر مشترک Heartbraker (۴۸۰) در صفات قطر ابتدای چوب بلال و طول چوب بلال وUBC۸۷۸ × Ruda در صفات تعداد بلال و وزن دانه هم با مدل خطی عمومی و هم با مدل خطی مخلوط شناسایی شد. نتایج بدست آمده از این مطالعه، اطلاعات ارزشمندی در زمینه گزینش به کمک نشانگر و مبنای ژنتیکی صفات مورد مطالعه ارائه می­ دهد که می توان از این اطلاعات در گزینش افراد طی برنامه های به ­نژادی و تولید ارقام جدید با میزان عملکرد بالا بهره برد.

Authors

ساناز خلیفانی

Urmia University

علی غفاری آذر

Urmia University

دانیال کهریزی

Razi University, Kermanshah

هادی علیپور

Urmia University

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Anderson, J.A., G.A. Churchill, J.E. Autrique and S.D. Tanksley. ۱۹۹۳. ...
  • Ataei, R., M. Gholamhoseini and V. Mohammadi. ۲۰۱۷. Association mapping ...
  • Agrama, H.A., G.C. Eizenga and W. Yan. ۲۰۰۷. Association mapping ...
  • Buckler, E.S., B.S. Gaut and M.D. McMullen. ۲۰۰۶. Molecular and ...
  • Buckler, E. and M. Gore. ۲۰۰۷. An Arabidopsis haplotype map ...
  • Borba, T.C., R.P. Brondani, F. Breseghello, A.S. Coelho, J.A. Mendonça, ...
  • Betrán, F.J., J.M. Ribaut, D. Beck and D.G. De Leon. ...
  • Cai, D., Y. Xiao, W. Yang, W. Ye, B. Wang, ...
  • Ching, A., K.S. Caldwe, M. Jung, M. Dolan, O.S. Smith, ...
  • Caldwell, K.S., J. Russell, P. Langridge and W. Powell. ۲۰۰۶. ...
  • Döring, H.P. and P. Starlinger. ۱۹۸۴. Barbara McClintock's controlling elements: ...
  • Diez, C.M., E. Meca, M.I. Tenaillon and B.S. Gaut. ۲۰۱۴. ...
  • Estep, M.C., J.D. DeBarry and J.L. Bennetzen. ۲۰۱۳. The dynamics ...
  • Ersoz, E.S., J. Yu and E.S. Buckler. ۲۰۰۹ Applications of ...
  • Forestan, C., S. Farinati, R.A. Cigliano, A. Lunardon, W. Sanseverino ...
  • Ghaffari Azar, A., R. Darvishzadeh, H. Hatami Maleki, D. Kahrizi, ...
  • Ghonaim, M., R. Kalendar, H. Barakat, N. Elsherif, N. Ashry ...
  • Gore, M.A., J.M. Chia, R.J. Elshire, Q. Sun, E.S. Ersoz, ...
  • Hu, Z., D. Zhang, G. Zhang, G. Kan, D. Hong ...
  • Hamblin, M.T., M.G. Salas Fernandez, A.M. Casa, S.E. Mitchell, A.H. ...
  • Jannatdoust, M., R. Darvishzadeh, R. Ziaeifard, H. Azizi and E. ...
  • Karık, Ü., M.A. Nadeem, E. Habyarimana, S. Ercişli, M. Yildiz, ...
  • Kalendar, R. and A. Schulman. ۲۰۰۶. IRAP and REMAP for ...
  • Kwon, S., A.F. Brown, J. Hu, R. McGee, C. Watt, ...
  • Kuhn, B.C., I. López Ribera, M.D.F. da Silva Machado and ...
  • Legesse, B.W., A.A. Myburg, K.V. Pixley and A.M. Botha. ۲۰۰۷. ...
  • Lorenz, A.J., J.G. Coors, C.N. Hansey, S.M. Kaeppler and N. ...
  • Liu, N., Y. Xue, Z. Guo, W. Li and J. ...
  • Li, K., H. Wang, X. Hu, Z. Liu, Y. Wu ...
  • Li, X., Z. Zhou, J. Ding, Y. Wu, B. Zhou, ...
  • Leiboff, S., X. Li, H. Hu, N. Todt, J. Yang, ...
  • Lu, H. and R. Bernardo. ۲۰۰۱. Molecular marker diversity among ...
  • Mezmouk, S., P.L. Dubreuil, M. Bosio, L. Décousset, A. Charcosset, ...
  • Murray, M.G. and W.F. Thompson. ۱۹۸۰. Rapid isolation of high ...
  • Mokrani, L., L. Gentzbittel, F. Azanza, L. Fitamant, G. Al-Chaarani ...
  • Maccaferri, M., M.C. Sanguineti, E. Noli and R. Tuberosa. ۲۰۰۵. ...
  • Murray, M.G. and W.F. Thompson. ۱۹۸۰. Rapid isolation of high ...
  • Mir Mohammadi Maibody, S.A.M and P. Golkar. ۲۰۱۹. Application of ...
  • Messing, J., A.K. Bharti, W.M. Karlowski, H. Gundlach, H.R. Kim, ...
  • Melchinger, A.E. ۱۹۹۹. Genetic diversity and heterosis. Genetics and exploitation ...
  • Mazaheri, M., M. Heckwolf, B. Vaillancourt, J.L. Gage, B. Burdo, ...
  • Nordborg, M., J.O. Borevitz, J. Bergelson, C.C. Berry, J. Chory, ...
  • Nordborg, M., T.T. Hu, Y. Ishino, J. Jhaveri, C. Toomajian, ...
  • Park, J.Y., R.V. Ramekar, K.J. Sa and J.K. Lee. ۲۰۱۵. ...
  • Peakall, R. and P.E. Smouse. ۲۰۰۶. GENALEX ۶: Genetic Analysis ...
  • Pritchard, J.K., M. Stephens, N.A. Rosenberg and P. Donnelly. ۲۰۰۰. ...
  • Palaisa, K.A., M. Morgante, M. Williams and A. Rafalski. ۲۰۰۳. ...
  • Prasanna, B.M., K. Pixley, M.L. Warburton and C.X. Xie. ۲۰۱۰. ...
  • Rafalski, A. and E. Ananiev. ۲۰۰۹. Genetic Diversity, Linkage Disequilibrium ...
  • Revilla, P., V.M. Rodríguez, A. Ordás, R. Rincent, A. Charcosset, ...
  • Reif, J.C., X.C. Xia, A.E. Melchinger, M.L. Warburton, D.A. Hoisington, ...
  • Sa, K.J., J.Y. Park, S.H. Choi, B.W. Kim, K.J. Park ...
  • SanMiguel, P., A. Tikhonov, Y.K. Jin, N. Motchoulskaia, D. Zakharov, ...
  • Tenaillon, M.I., M.C. Sawkins, A.D. Long, R.L. Gaut, J.F. Doebley ...
  • Van Inghelandt, D., A.E. Melchinger, C. Lebreton and B. Stich. ...
  • Wang, X., H. Wang, S. Liu, A. Ferjani, J. Li, ...
  • Wu, X., Y. Li, Y. Shi, Y. Song, D. Zhang, ...
  • Wallace, J.G., P.J. Bradbury, N. Zhang, Y. Gibon, M. Stitt ...
  • Warburton, M.L., X. Xianchun, J. Crossa, J. Franco, A.E. Melchinger, ...
  • Warburton, M.L., J.C. Reif, M. Frisch, M. Bohn, C. Bedoya, ...
  • Xia, X.C., J.C. Reif, D.A. Hoisington, A.E. Melchinger, M. Frisch ...
  • Xia, X. C., J.C. Reif, A.E. Melchinger, M. Frisch, D.A. ...
  • Xu, Y. ۲۰۱۰. Molecular plant breeding. Cabi. ...
  • Xue, Y., M.L. Warburton, M. Sawkins, X. Zhang, T. Setter, ...
  • Yan, J., M. Warburton and J. Crouch. ۲۰۱۱. Association mapping ...
  • Yu, J. and E.S. Buckler. ۲۰۰۶. Genetic association mapping and ...
  • Zhang, M., Y. Cao, Z. Wang, Z.Q. Wang, J. Shi, ...
  • Zhu, C., M. Gore, E.S. Buckler and J. Yu. ۲۰۰۸. ...
  • نمایش کامل مراجع