شناسایی چند شکلی های ژن HSP۷۰A۱A در گوسفندان نژاد مهربان و رومانف با تکنیک PCR-SSCP
عنوان مقاله: شناسایی چند شکلی های ژن HSP۷۰A۱A در گوسفندان نژاد مهربان و رومانف با تکنیک PCR-SSCP
شناسه ملی مقاله: JR_RAP-12-31_018
منتشر شده در در سال 1400
شناسه ملی مقاله: JR_RAP-12-31_018
منتشر شده در در سال 1400
مشخصات نویسندگان مقاله:
احمد احمدی - Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
محیا محمدزاده - Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
پویا زمانی - Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
عباس فرح آور - Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
رضا طالبی - Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
خلاصه مقاله:
احمد احمدی - Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
محیا محمدزاده - Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
پویا زمانی - Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
عباس فرح آور - Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
رضا طالبی - Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
در اقلیم های مختلف، نقش مقاومت سلولی به استرسهای ناشی از تغییر دما از طریق خانوادهای از پروتئینها که اصطلاحا، پروتئینهای شوک گرمایی (HSP) نامیده میشوند، کنترل می شود. در پژوهش حاضر، شناسایی چند شکلیهای تک نوکلئوتیدی موجود در مناطقی از ژن HSP۷۰A۱A در گوسفند بومی نژاد مهربان و گوسفند وارداتی نژاد رومانف به جهت ویژگی این نژادها به سازگاری در اقلیم های سردسیری، بررسی شدند. در مجموع، تعداد ۱۴۱ حیوان شامل گوسفند نژاد مهربان (۱۰۰ راس) و گوسفند نژاد رومانف (۴۱ راس)، به طور تصادفی انتخاب و مراحل خونگیری و استخراج DNA طبق دستورالعملهای متداول انجام شد. سپس، واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) جهت تکثیر اگزون ژن HSP۷۰A۱A (Oar_v۴.۰; Chr۲۰, NC_۰۱۹۴۷۷.۲) به اندازه ۲۴۷ و ۲۹۸ جفت باز انجام شد. همچنین، جهت تعیین چند شکلی نمونه ها از تکنیک PCR-SSCP و متعاقب آن، توالی یابی مبتنی بر سانگر استفاده شد. بر اساس نتایج SSCP، به طور مشابه در هر دو نژاد مهربان و رومانف تعداد ۵ الگوی باندی مشاهده شد که قطعات تکثیر شده ۲۴۷ و ۲۹۸ جفت بازی به ترتیب دو و سه الگوی الکتروفوزی را دارا بودند. علاوه بر این، هیچ تفاوتی در فراوانی الگوهای مشاهده شده بین این دو نژاد گوسفند یافت نشد. همچنین، در این نژادها نتایج توالی یابی وجود تعداد ۵ چند شکلی تک نوکلئوتیدی (SNP) شامل g.۲۶۵۶۲۲۵۲C>A، g.۲۶۵۶۲۲۶۱G>C، g.۲۶۵۶۲۲۷۰T>C، g.۲۶۵۶۲۲۷۳C>T و g.۲۶۵۶۲۲۷۹C>T در قطعه ۲۴۷ جفت بازی و تعداد سه چند شکلی تک نوکلئوتیدی شامل g.۲۶۵۶۱۷۴۵T>C، g.۲۶۵۶۱۷۸۴C>T و g.۲۶۵۶۱۸۷۷G>A در قطعه ۲۹۸ جفت بازی شناسایی نمود. در مجموع، نتایج نشان داد که، همه چند شکلیها به غیر ازg.۲۶۵۶۱۷۴۵T>C و g.۲۶۵۶۱۸۷۷G>A به طور معنیداری خارج از تعادل هاردی واینبرگ هستند (۰۵/۰p<). به عنوان نتیجهگیری نهایی، با توجه به نقش پروتئینهای شوک دمایی در مقاومت به استرسهای محیطی، شناسایی این چند شکلیها می تواند تاثیر بسزایی در درک مکانیسم سازگاری به تحمل دمایی در نژادهای گوسفندان بومی ایرانی داشته باشد.
کلمات کلیدی: Cold tolerance, HSP۷۰A۱A gene, Mehraban sheep, Polymorphism, Romanov sheep, تحمل سرمایی, چندشکلی نوکلئوتیدی, ژن HSP۷۰A۱A, گوسفند رومانف, گوسفند مهربان
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1274478/