ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings
Login |Register |Help |عضویت کتابخانه ها
Paper
Title

اثر اندازه جمعیت مرجع و روش های استنباط ژنوتیپ بر صحت استنباط در جمعیت های خالص و آمیخته

Year: 1399
COI: JR_RAP-11-30_013
Language: PersianView: 10
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download

Buy and Download

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این Paper را که دارای 6 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

Authors

یحیی محمدی - گروه علوم دامی دانشگاه ایلام
جواد احمدپناه - بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی کرمانشاه، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرمانشاه، ایران

Abstract:

استنباط ژنوتیپ به­ عنوان یک روش تبدیل تراشه­ های با تراکم پایین به تراشه­ های با تراکم بالا به­ منظور افزایش صحت انتخاب ژنومی در حیوانات است. در پژوهش حاضر به­ منظور بررسی صحت استنباط ژنوتیپ سه جمعیت آمیخته (سناریو ۱)، خالص (سناریو ۲) و آمیخته + خالص (سناریو ۳) به کمک نرم­افزار QMSim شبیه­ سازی شد. از دو روش استنباط ژنوتیپ Beagle و Flmpute برای دو نوع تراشه با تراکم کم و زیاد استفاده شد. اندازه جمعیت مرجع برای هر سناریو ۲۵۰، ۵۰۰ و ۱۰۰۰ حیوان انتخاب شد. نتایج پژوهش حاضر نشان داد که برای تمام سناریوها با افزایش اندازه جمعیت مرجع از ۲۵۰ به ۵۰۰ حیوان، افزایش صحت استنباط ژنوتیپ بیشتر و از ۵۰۰ به ۱۰۰۰ حیوان این افزایش، کندتر شد. صحت استنباط ژنوتیپ به­ کمک روش Flmpute نسبت به Beagle برای اندازه جمعیت مرجع کوچک (۲۵۰ حیوان) بیشتر نمایان شد. در اندازه­ های جمعیت مرجع ۵۰۰ و ۱۰۰۰ حیوان در تمام سناریوها افزایش صحت Flmpute نسبت به ­روش Beagle معنی­ دار نبود. برای سناریو ۱ میزان صحت استنباط ژنوتیپ نسبت به سناریو ۲ بیشتر برآورد شد. افزایش صحت استنباط ژنوتیپ در سناریو ۳ در مقایسه با سناریو ۱بی­ معنی شد. به­ طور کلی نتایج پژوهش حاضر نشان داد که در کشورهای در حال توسعه که جمعیت حیوانی تعیین ژنوتیپ شده کوچک در دسترس هست، برای افزایش صحت انتخاب ژنومی استفاده از روش استنباط ژنوتیپ Flmpute به کمک جمعیت آمیخته با افزایش ارتباط خویشاوندی بین جمعیت مرجع و هدف می ­توان به ­عنوان یک راهکار مناسب استفاده شود.

Keywords:

Paper COI Code

This Paper COI Code is JR_RAP-11-30_013. Also You can use the following address to link to this article. This link is permanent and is used as an article registration confirmation in the Civilica reference:

https://civilica.com/doc/1274507/

How to Cite to This Paper:

If you want to refer to this Paper in your research work, you can simply use the following phrase in the resources section:
محمدی، یحیی و احمدپناه، جواد،1399،اثر اندازه جمعیت مرجع و روش های استنباط ژنوتیپ بر صحت استنباط در جمعیت های خالص و آمیخته،https://civilica.com/doc/1274507

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

  • Aliloo, H., R. Mrode, A.M. Okeyo, G. Ni, M.E. Goddard ...
  • Boichard, D., H. Chung, R. Dassonneville, X. David, A. Eggen, ...
  • Bolormaa, S., K. Gore, J.H.J. van der Werf, B.J. Hayes ...
  • Bouwman, A.C. and R.F. Veerkamp. ۲۰۱۴. Consequences of splitting whole ...
  • Browning, B., Zhou, Y. and S. Browning. ۲۰۱۸. A one-penny ...
  • Browning, B.L. and S.R. Browning. ۲۰۱۶. Genotype imputation with millions ...
  • de Roos, A.P.W., B.J. Hayes, R.J. Spelman and M.E. Goddard. ...
  • Habier, D., R.L. Fernando and J.C.M. Dekkers. ۲۰۰۹. Genomic selection ...
  • Hozé, C., M.N. Fouilloux, E. Venot, F. Guillaume, R. Dassonneville, ...
  • Ghoreishifar S.M., H. Moradi-Shahrbabak, M. Moradi-Shahrbabak, E.L. Nicolazzi, J.L. Williams, ...
  • Korkuc, P., D. Arneds and G.A. Brockmann. ۲۰۱۹. Finding the ...
  • Ma, P., R.F. Brøndum, Q. Zhang, M.S. Lund and G. ...
  • Ma, P., R.F. Brondum, Q. Zhang, M.S. Lund and G. ...
  • Meuwissen, T., B. Hayes and M. Goddard. ۲۰۱۶. Genomic selection: ...
  • Milanesi, M., D. Vicario, A. Stella, A. Valentini, P. Ajmone‐Marsan, ...
  • Mohammadi, Y. and M. Mokhtari. ۲۰۱۷. Genomic selection accuracy parametric ...
  • Mulder H., M. Calus, T. Druet and C. Schrooten. ۲۰۱۲. ...
  • Ogawa, S., H. Matsuda, Y. Taniguchi, T. Watanabe, A. Takasuga, ...
  • Pausch, H., I.M. MacLeod, R. Fries, R. Emmerling, P.J. Bowman ...
  • Pausch, H., B. Aigner, R. Emmerling, C. Edel, K.U. Götz ...
  • Nicolazzi, E., S. Biffani and G. Jansen. ۲۰۱۳. Short communica ...
  • Sargolzaei, M., J.P. Chesnais and F.S. Schenkel. ۲۰۱۴. A new ...
  • Sargolzaei M. and F.S. Schenkel. ۲۰۰۹. QMSim: a large-scale genome ...
  • Van Binsbergen, R., M.C. Bink, M.P. Calus, F.A. van Eeuwijk, ...
  • VanRaden P., C. Sun and J. O’Connell. ۲۰۱۵. Fast imputation ...
  • Ventura, R.V., D. Lu, F.S. Schenkel, Z. Wang, C. Li ...
  • Wang, Z. and N. Chatterjee. ۲۰۱۷. Increasing mapping precision of ...
  • Aliloo, H., R. Mrode, A.M. Okeyo, G. Ni, M.E. Goddard ...
  • Boichard, D., H. Chung, R. Dassonneville, X. David, A. Eggen, ...
  • Bolormaa, S., K. Gore, J.H.J. van der Werf, B.J. Hayes ...
  • Bouwman, A.C. and R.F. Veerkamp. ۲۰۱۴. Consequences of splitting whole ...
  • Browning, B., Zhou, Y. and S. Browning. ۲۰۱۸. A one-penny ...
  • Browning, B.L. and S.R. Browning. ۲۰۱۶. Genotype imputation with millions ...
  • de Roos, A.P.W., B.J. Hayes, R.J. Spelman and M.E. Goddard. ...
  • Habier, D., R.L. Fernando and J.C.M. Dekkers. ۲۰۰۹. Genomic selection ...
  • Hozé, C., M.N. Fouilloux, E. Venot, F. Guillaume, R. Dassonneville, ...
  • Ghoreishifar S.M., H. Moradi-Shahrbabak, M. Moradi-Shahrbabak, E.L. Nicolazzi, J.L. Williams, ...
  • Korkuc, P., D. Arneds and G.A. Brockmann. ۲۰۱۹. Finding the ...
  • Ma, P., R.F. Brøndum, Q. Zhang, M.S. Lund and G. ...
  • Ma, P., R.F. Brondum, Q. Zhang, M.S. Lund and G. ...
  • Meuwissen, T., B. Hayes and M. Goddard. ۲۰۱۶. Genomic selection: ...
  • Milanesi, M., D. Vicario, A. Stella, A. Valentini, P. Ajmone‐Marsan, ...
  • Mohammadi, Y. and M. Mokhtari. ۲۰۱۷. Genomic selection accuracy parametric ...
  • Mulder H., M. Calus, T. Druet and C. Schrooten. ۲۰۱۲. ...
  • Ogawa, S., H. Matsuda, Y. Taniguchi, T. Watanabe, A. Takasuga, ...
  • Pausch, H., I.M. MacLeod, R. Fries, R. Emmerling, P.J. Bowman ...
  • Pausch, H., B. Aigner, R. Emmerling, C. Edel, K.U. Götz ...
  • Nicolazzi, E., S. Biffani and G. Jansen. ۲۰۱۳. Short communica ...
  • Sargolzaei, M., J.P. Chesnais and F.S. Schenkel. ۲۰۱۴. A new ...
  • Sargolzaei M. and F.S. Schenkel. ۲۰۰۹. QMSim: a large-scale genome ...
  • Van Binsbergen, R., M.C. Bink, M.P. Calus, F.A. van Eeuwijk, ...
  • VanRaden P., C. Sun and J. O'Connell. ۲۰۱۵. Fast imputation ...
  • Ventura, R.V., D. Lu, F.S. Schenkel, Z. Wang, C. Li ...
  • Wang, Z. and N. Chatterjee. ۲۰۱۷. Increasing mapping precision of ...
  • Research Info Management

    Certificate | Report | من نویسنده این مقاله هستم

    اطلاعات استنادی این Paper را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    Scientometrics

    The specifications of the publisher center of this Paper are as follows:
    Type of center: دانشگاه دولتی
    Paper count: 4,008
    In the scientometrics section of CIVILICA, you can see the scientific ranking of the Iranian academic and research centers based on the statistics of indexed articles.

    Share this page

    More information about COI

    COI stands for "CIVILICA Object Identifier". COI is the unique code assigned to articles of Iranian conferences and journals when indexing on the CIVILICA citation database.

    The COI is the national code of documents indexed in CIVILICA and is a unique and permanent code. it can always be cited and tracked and assumed as registration confirmation ID.

    Support