برآورد صحت انتخاب ژنومی در جوامع کوچک ژنتیکی- مطالعه شبیه سازی

ددر پژوهش حاضر برای ارزیابی تاثیر منابع مختلف اطلاعات جوامع خارجی بر صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی حیوانات جوان در جمعیت کوچک، دو جمعیت کوچک و بزرگ گاو شیری شبیه سازی گردید. یک جمعیت بزرگ متشکل از ۲۰۰ هزار حیوان طی ۱۵ نسل و سپس یک جمعیت کوچک متشکل از ۵ هزار حیوان طی۳ نسل به کمک نرم­افزار QMSim به گونه ای ایجاد شدند که دو جمعیت از لحاظ ژنتیکی مرتبط بودند. براساس منابع مختلف اطلاعات در دسترس سه راهبرد برآورد صحت ارزیابی های ژنومی تعریف گردید. در راهبرد اول، صحت های ارزش های اصلاحی ژنومی براساس ارزش های ژنومی دام ها در جمعیت کوچک برآورد گردیدند. در راهبرد دوم، صحت های ارزش های اصلاحی حیوانات به کمک اطلاعات دام ها در جمعیت کوچک و نیز ارزش های اصلاحی ژنومی دام های نر جمعیت بزرگ برآورد شدند. در راهبرد سوم، اطلاعات فنوتیپی، ژنوتیپی و شجره دام ها جمعیت بزرگ برای برآورد صحت ها یا ارزش های اصلاحی ژنومی دام ها جمعیت کوچک استفاده شد. میانگین های صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی در راهبردهای اول، دوم و سوم به ترتیب ۳۴/۰، ۴۰/۰ و ۵۰/۰ به دست آمد. همچنین میانگین های ضریب پیش بینی رگرسیونی در راهبردهای اول، دوم و سوم به ترتیب ۷۴/۰، ۸۳/۰ و ۹۳/۰ برآورد گردید. نتایج حاصل از این پژوهش نشان دادند که استفاده همزمان از اطلاعات فنوتیپی، شجره ای و ژنوتیپی دو جمعیت برای برآورد صحت ارزش های اصلاحی ژنومی کاندیداهای انتخاب در جوامع کوچک در راهبرد سوم، علاوه بر افزایش صحت پیش بینی، تفاوت معنی داری در صحت پیش بینی را نسبت به دو راهبرد دیگر به همراه دارد.    

Keywords:

Dairy cattle , Genomic breeding value , Prediction accuracy , Small population , Simulation , گاو شیری , ارزش اصلاحی ژنومی , صحت پیش بینی , جامعه کوچک , شبیه سازی