شناسایی، جداسازی و تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی پیشبر اختصاصی غده گیاهان
عنوان مقاله: شناسایی، جداسازی و تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی پیشبر اختصاصی غده گیاهان
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-11-32_001
منتشر شده در در سال 1398
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-11-32_001
منتشر شده در در سال 1398
مشخصات نویسندگان مقاله:
راحله قنبری محب سراج - University of Mohaghegh Ardabili
مسعود توحیدفر - shahid beheshti university
خلاصه مقاله:
راحله قنبری محب سراج - University of Mohaghegh Ardabili
مسعود توحیدفر - shahid beheshti university
بررسی حاضر با هدف شناسایی پیشبر مناسب برای اندام غده گیاهی در سال ۱۳۹۷ در دانشگاه شهید بهشتی انجام شد. بدین منظور ابتدا توالی های مربوط به پیشبر گیاهان غده ای مختلف در سایت NCBI جستجو شد. توالی ها هم ردیف شدند و آغازگرهای هدف از نقاط محافظت شده طراحی شدند. تجزیه و تحلیل نتایج PCR، حضور پیشبر موردنظر را در گیاهان سیب زمینی شیرین و تارو تایید کرد. در ادامه، به منظور تایید بیشتر، تجزیه و تحلیل های بیوانفورماتیکی شامل تعیین عناصر سیس، فاکتورهای رونویسی و عملکرد آن ها، فاکتورهای رونویسی با بیان بالا و پایین صورت گرفت. در نهایت پیشبر پیشبینی شده با پیشبر کلاس یک پاتاتین از لحاظ عناصر سیس و عملکرد مقایسه شد. نتایج تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی نشان داد پیشبر موردنظر دارای عناصر سیس عمومی و اختصاصی می باشد. عناصر سیس عمومی در اغلب پیشبرها وجود دارد و در فعال سازی و تنظیم پیشبر، فرآیندهای سلولی، فرآیندهای نموی و تحمل تنش های زیستی و غیرزیستی نقش دارند. عناصر سیس اختصاصی غده، در بیان پروتئین های ذخیره ای و نشاسته فعال می باشد. مقایسه بین پیشبر مورد مطالعه و پیشبر اختصاصی غده پاتاتین، تاییدی بر فعالیت پیشبر مورد مطالعه در غده بود. پیشبر غده، در آینده میتواند برای بیان پروتئین های مختلف در غده گیاهان استفاده شود.
کلمات کلیدی: Cis Elements, Patatin, Sweet Potato, Taro, Transcription Factor, پاتاتین, تارو, سیب زمینی شیرین, عناصر سیس و فاکتورهای رونویسی.
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1284577/