کاربرد گزینش متغیر گیبز (GVS) برای مطالعه کنترل ژنتیکی تحمل به تنش کم آبی در گندم

Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 145

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCB-11-30_017

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

Abstract:

خشکی مهم­ترین تنش غیرزیستی است که تولید و کیفیت محصول گندم را در ایران تحت­تاثیر قرار می ­دهد. اطلاعات درباره کنترل ژنتیکی توارث تحمل به تنش خشکی عملکرد دانه برای تعیین نوع برنامه اصلاحی و تولید ارقام متحمل ضروری است. این امر اصلاح­گران را قادر می­ سازد تا مناسب ­ترین راه­کار را برای اصلاح صفت انتخاب کنند. در این مطالعه، استنباط بیزی با به کارگیری روش گزینش متغیر گیبز (GVS) برای شناسایی مهم­ترین اثرات ژنتیکی مرتبط با تحمل به خشکی و شرایط عادی در چارچوب روش تجزیه میانگین نسل­ ها مورد استفاده قرار گرفت. به همین منظور آزمایش­هایی شامل دو جفت تلاقی با ارقام حساس و متحمل (هامون × دریا و سپاهان × مروارید) و نسل­های حاصل از تلاقی آنها برای دو سال به صورت کرت ­های خرد شده در دو شرایط آبیاری مطلوب و قطع آبیاری از زمان گرده افشانی بر پایه طرح بلوک­های کامل تصادفی با سه تکرار اجرا شدند. برای مطالعه توارث صفت در تجزیه میانگین نسل­ها از آزمون مقیاس مشترک استفاده می­شود. محدود بودن درجات آزادی به تعداد پارامترهای موجود در مدل و امکان برآورد بیش از حد یا کمتر از حد اثرات اصلی و اپیستازی از معایب این روش هستند. یک روش جایگزین برای رفع این محدودیت­ ها استفاده از استنباط بیزی و روش­های گزینش مدل مثل GVS است. GVS با برآورد احتمالات پسین در بر گرفتن پارامترهای مدل، شناسایی اثرات برخوردار از بیشترین قدرت تمایز در مدل را امکان­پذیر  می ­سازد. نتایج نشان­دهنده کنترل توارث عملکرد دانه در شرایط تنش و غیرتنش توسط عمل ژنی افزایشی، غالبیت و اپیستازی بودند. بنابراین استفاده از روش­هایی مانند گزینش دوره­ای و به دنبال آن روش شجره­ای که تمام اثرهای ژنی را در بردارند می­تواند روشی سودمند برای بهبود تحمل به تنش خشکی باشد. از آن­جایی که عمل ژنی افزایشی، غالبیت و اپیستازی در توارث عملکرد دانه موثر بودند، روش­هایی که از تمام اثرهای ژنی استفاده می­کنند مثل تولید بذر هیبرید ممکن است در بهبود عملکرد گندم در شرایط مختلف موثر باشد.    

Authors

پرویز صفری

Graduated Ph. D., Dept. of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran

سیده فاطمه دانیالی

Graduated Ph. D., Dept. of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran

مهدی رحیمی

Department of Biotechnology, Institute of Science and High Technology and Environmental Sciences, Graduate University of Advanced Technology, Kerman, Iran.

احمد مهدوی میقان

PhD student of plant breeding, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agricultural Science, University of Guilan, Rasht, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Ahmadian, S., S.M. Mortazavian, M. Ebrahimi, F. Amini, M. Ghorbani ...
  • Balestre, M., R.G. Von Pinho and A.H. Brito. ۲۰۱۲. Bayesian ...
  • Barbieri, M.M. and J.O. Berger. ۲۰۰۴. Optimal predictive model selection. ...
  • Carlin, B.P. and S. Chib. ۱۹۹۵. Bayesian model choice via ...
  • Chowdhry, M.A., M. Rafiq and K. Alam. ۱۹۹۲. Genetic architecture ...
  • Clyde, M., H. Desimone and G. Parmigiani. ۱۹۹۶. Prediction via ...
  • Dellaportas, P., J.J. Forster and I. Ntzoufras. ۲۰۰۰. Bayesian Variable ...
  • Dellaportas, P., J.J. Forster and I. Ntzoufras. ۲۰۰۲. On Bayesian ...
  • Eftekhari, A., A. Baghizadeh, R. Abdoshahi and M.M. Yaghoubi. ۲۰۱۷. ...
  • Fotokian, M.H., J. Ahmadi, and S.F. Orang. ۲۰۰۸. Genetic assay ...
  • Gelman, A., J.B. Carlin, H.S. Stern and D.B. Rubin. ۲۰۰۴. ...
  • Geman, S. and D. Geman. ۱۹۸۴. Stochastic relaxation, Gibbs distributions, ...
  • George, E.I. and R.E. McCulloch. ۱۹۹۳. Variable selection via Gibbs ...
  • Gomez, K.A. and A.A. Gomez. ۱۹۸۴. Statistical Procedures for Agricultural ...
  • Green, P.J. ۱۹۹۵. Reversible jump Markov chain Monte Carlo computation ...
  • Hallauer, A.R., M.J. Carena and J.B. Miranda Filho. ۲۰۱۰. Quantitative ...
  • Hayman, B.I. ۱۹۶۰. The separation of epistatic from additive and ...
  • Ijaz, U.S. and M. Kashif. ۲۰۱۳. Genetic study of quantitative ...
  • Khattab, S.A.M., R.M. Esmail and A.M.F. Al-Ansary. ۲۰۱۰. Genetical analysis ...
  • Kuo, L. and B. Mallick. ۱۹۹۸. Variable selection for regression ...
  • Mather, K. and J.L. Jinks. ۱۹۷۱. Biometrical Genetics. Cornell University ...
  • Munir, M., M.A. Chowdhry and M. Ahsan. ۲۰۰۷. Generation means ...
  • Nezhadahmadi, A., Z.H. Prodhan and G. Faruq. ۲۰۱۳. Drought tolerance ...
  • Novoselovic, D., M. Baric, G. Drezner, J. Gunjaca and A. ...
  • Ntzoufras, I. ۲۰۰۲. Gibbs variable selection using BUGS. Journal of ...
  • Ntzoufras, I. ۲۰۱۱. Bayesian modeling using WinBUGS. John Wiley & ...
  • Raftery, A.E., D. Madigan and J.A. Hoeting. ۱۹۹۷. Bayesian model ...
  • SAS Institute. ۲۰۰۲. SAS user's guide: Statistics version ۹ for ...
  • Siani, H.S. and D. Aspinall. ۱۹۸۱. Effects of water deficit ...
  • Spiegelhalter, D.J., A. Thomas, N.G. Best and D. Lunn. ۲۰۰۳. ...
  • Viana, J. and M. Soriano. ۲۰۰۰. Generation mean analysis in ...
  • Xu, S. ۲۰۰۳. Estimating polygenic effects using markers of the ...
  • Yi, N., B.S. Yandell, G.A. Churchill, D.B. Allison, E.J. Eisen ...
  • Yi, N., D. Shriner, S. Banerjee, T. Mehta, D. Pomp ...
  • Ahmadian, S., S.M. Mortazavian, M. Ebrahimi, F. Amini, M. Ghorbani ...
  • Balestre, M., R.G. Von Pinho and A.H. Brito. ۲۰۱۲. Bayesian ...
  • Barbieri, M.M. and J.O. Berger. ۲۰۰۴. Optimal predictive model selection. ...
  • Carlin, B.P. and S. Chib. ۱۹۹۵. Bayesian model choice via ...
  • Chowdhry, M.A., M. Rafiq and K. Alam. ۱۹۹۲. Genetic architecture ...
  • Clyde, M., H. Desimone and G. Parmigiani. ۱۹۹۶. Prediction via ...
  • Dellaportas, P., J.J. Forster and I. Ntzoufras. ۲۰۰۰. Bayesian Variable ...
  • Dellaportas, P., J.J. Forster and I. Ntzoufras. ۲۰۰۲. On Bayesian ...
  • Eftekhari, A., A. Baghizadeh, R. Abdoshahi and M.M. Yaghoubi. ۲۰۱۷. ...
  • Fotokian, M.H., J. Ahmadi, and S.F. Orang. ۲۰۰۸. Genetic assay ...
  • Gelman, A., J.B. Carlin, H.S. Stern and D.B. Rubin. ۲۰۰۴. ...
  • Geman, S. and D. Geman. ۱۹۸۴. Stochastic relaxation, Gibbs distributions, ...
  • George, E.I. and R.E. McCulloch. ۱۹۹۳. Variable selection via Gibbs ...
  • Gomez, K.A. and A.A. Gomez. ۱۹۸۴. Statistical Procedures for Agricultural ...
  • Green, P.J. ۱۹۹۵. Reversible jump Markov chain Monte Carlo computation ...
  • Hallauer, A.R., M.J. Carena and J.B. Miranda Filho. ۲۰۱۰. Quantitative ...
  • Hayman, B.I. ۱۹۶۰. The separation of epistatic from additive and ...
  • Ijaz, U.S. and M. Kashif. ۲۰۱۳. Genetic study of quantitative ...
  • Khattab, S.A.M., R.M. Esmail and A.M.F. Al-Ansary. ۲۰۱۰. Genetical analysis ...
  • Kuo, L. and B. Mallick. ۱۹۹۸. Variable selection for regression ...
  • Mather, K. and J.L. Jinks. ۱۹۷۱. Biometrical Genetics. Cornell University ...
  • Munir, M., M.A. Chowdhry and M. Ahsan. ۲۰۰۷. Generation means ...
  • Nezhadahmadi, A., Z.H. Prodhan and G. Faruq. ۲۰۱۳. Drought tolerance ...
  • Novoselovic, D., M. Baric, G. Drezner, J. Gunjaca and A. ...
  • Ntzoufras, I. ۲۰۰۲. Gibbs variable selection using BUGS. Journal of ...
  • Ntzoufras, I. ۲۰۱۱. Bayesian modeling using WinBUGS. John Wiley & ...
  • Raftery, A.E., D. Madigan and J.A. Hoeting. ۱۹۹۷. Bayesian model ...
  • SAS Institute. ۲۰۰۲. SAS user's guide: Statistics version ۹ for ...
  • Siani, H.S. and D. Aspinall. ۱۹۸۱. Effects of water deficit ...
  • Spiegelhalter, D.J., A. Thomas, N.G. Best and D. Lunn. ۲۰۰۳. ...
  • Viana, J. and M. Soriano. ۲۰۰۰. Generation mean analysis in ...
  • Xu, S. ۲۰۰۳. Estimating polygenic effects using markers of the ...
  • Yi, N., B.S. Yandell, G.A. Churchill, D.B. Allison, E.J. Eisen ...
  • Yi, N., D. Shriner, S. Banerjee, T. Mehta, D. Pomp ...
  • نمایش کامل مراجع