بررسی تنوع آللی ژن های رمزکننده گلوتنین با وزن مولکولی پایین (LMW-GS) در بین برخی از ارقام گندم نان

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 181

This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCB-10-26_006

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

Abstract:

    تعداد ۱۵ رقم گندم نان با کیفیت نانوایی خوب، متوسط و ضعیف به منظور بررسی تنوع آللی زیر واحدهای گلوتنین با وزن مولکولی پایین (LMW-GS) با استفاده از چهار جفت آغازگر انتخاب شدند. آغازگرها با در نظر گرفتن ساختار زیر واحدهای گلوتنین با وزن مولکولی پایین و از دو سوی توالی ­های تکراری و حفاظت شده در این بخش طراحی و سنتز شدند تا بتوان افزایش یا کاهش طول واحدهای تکراری و نقش آنها را در صفت کیفیت نانوایی مورد بررسی قرار داد. در مورد تمامی آغازگرها الگوی باندی برای واحدهای قابل تکثیر مورد نظر به صورت صفر (عدم وجود نوار) و یک (وجود نوار) امتیازدهی شدند. آغازگر ۱۵ /۲A توانست ارقام دز، فلات و شیرودی را به­ عنوان ارقامی با کیفیت نانوایی ضعیف از دیگر ژنوتیپ­ ها تفکیک کند. آغازگر ۱۵ /۷A ارقام سیروان و گلستان، آغازگر ۲۲ /۷D رقم نیک­نژاد و آغازگر ۲۵ /۵B ارقام سیروان و مروارید را از نظر کیفیت نانوایی از دیگر ارقام متمایز کرد. همچنین با استفاده از نرم افزار PopGene ۱.۳۱ متوسط تعداد آلل مشاهده شده ومتوسط تعداد آلل های موثر بترتیب ۲ و ۲۳/۱ و شاخص تنوع ژنی نئی برابر با ۱۸/۰و شاخص اطلاعات شانون برابر با ۳۲/۰ محاسبه گردید. برای تعیین قدرت تمایز هر نشانگر، میزان اطلاعات چند شکلی (PIC) برای هر آغازگر محاسبه شد که نشان داد که در بین آغازگرهای طراحی شده آغازگر ۱۵ /۲A از بالاترین قدرت تمایز بین ژنویپ های مورد بررسی را دارا بود. آنالیز نتایج ژل های پلی آکریل آمید با استفاده از نرم ­افزار NTSYS-pc ۲.۲  و گروهبندی با استفاده از روش تجزیه خوشه ای بر اساس ضریب جاکارد و روش UPGMA نتایج ماتریس تشابه را تایید و ارقام را در پنج گروه قرار داد بطوریکه تا حدودی توانست ارقام مورد ارزیابی را از نظر صفت کیفیت نانوایی از یکدیگر تفکیک کند. پژوهش حاضر نشان داد که طول ناحیه تکراری در ساختار LMW-GSها در کنار فاکتورهایی نظیر تعداد اسید آمینه های سیستئین موجود در این پروتئین ها، عدد کیفی فارینوگراف و سایر شاخص­ های رئولوژیکی می­تواند دیدگاهی کلی را در مورد صفت کیفیت نانوایی فراهم کند.  

Keywords:

Wheat Bread , Quality Bakery , Specific primer and Glutenin , گندم , کیفیت نانوایی , آغازگر اختصاصی و گلوتنین

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Atienza, S.G., J.B. Alvarez, A.M. Villegas, M.J. Gimenez, M.C. Ramirez, ...
  • Blanco, A., P. Resta, R. Simeone, S. Parmar, P.R. Shewry, ...
  • Bozorgmehr, A., J. Ahmadi, F. Shahinnia, Kh. Razavi, G. Njafian ...
  • Cassidy, B.G., J. Dvorak and O.D. Anderson. ۱۹۹۸. The wheat ...
  • Colot, V., L.S. Robert, T.A. Kavanagh, M.W. Bevan and R.D. ...
  • D'ovidio, R. and S.M. Masci. ۲۰۰۴. The low-molecular-weight glutenin subunits ...
  • D'Ovidio, R., C. Marchitelli, L. Ercoli Cardelli and E. Porceddu. ...
  • Doyle, J.J. and J.L. Doyle. ۱۹۸۷. A rapid DNA isolation ...
  • Forde, B.G., A. Heyworth, J. Pywell, M. Kreis. ۱۹۸۵. Nucleotide ...
  • Ghomri, M., H. Peyghambardoost and K. Reshvekarim. ۲۰۰۹. Application of ...
  • Gupta, R.B. and K.W. Shephard. ۱۹۹۰. Two-step one-dimensional SDSPAGE analysis ...
  • Hai, L., Y. MW, Z. HY, B. Bernard, N. Eviatar ...
  • Halajian, M. and B. Naserian. ۲۰۰۷. Review and compare amino ...
  • Harberd, N.P., D. Bartels and R.D. Thompson. ۱۹۸۵. Analysis of ...
  • Jackson, E.A., L.M. Holt and P.I. Payne. ۱۹۸۳. Characterisation of ...
  • Johansson, E., G. Svensson and W.K. Heneen. ۱۹۹۸. Genotype and ...
  • Josephides, C.M., L.R. Joppa, V.L. Youngs. ۱۹۸۷. Effect of chromosome ...
  • Ladogina, M.P., A.A. Pomortsev, V.P. Netsvetaev, A.A. Sozinov. ۱۹۸۹. Identification ...
  • Lew, E.J.L., D.D. Kuzmicky and D.D. Kasarda. ۱۹۹۲. Characterization of ...
  • Li, W., Z. Gao, Y.M. Wei, Z.E. Pu, G.Y. Chen, ...
  • Martinek, P., M. Vinterova, I. Buresova and T. Vyhnanek. ۲۰۰۸. ...
  • Masci, S., D. Lafiandra, E. Porceddu, E.J.L. Lew, H.P. Tao ...
  • Masci, S., E.J. Lew, D. Lafiandra, E. Porceddu and D.D. ...
  • Masci, S., L. Rovelli, D.D. Kasarda, W.H. Vensel and D. ...
  • Nei, M. ۱۹۷۳. Analysis of gene diversity in subdivided populations ...
  • Obukhova, L.V., G.V. Generalova, A.V. Agafonov, V.P. Kumarev, N.A. Popova ...
  • Pahlevani, S., A. Izanloo, S. Parsa and M.GH. Ghaderi. ۲۰۱۶. ...
  • Payne, P.I., E.A. Jackson and L.M. Holt. ۱۹۸۴. The association ...
  • Payne, P.I and K.G. Corfield. ۱۹۷۹. Subunit composition of wheat ...
  • Payne, P.I., L.M. Holt, M.G Jarvis and E.A. Jackson. ۱۹۸۵. ...
  • Pena, R.J., J. Zarco-Hernandez, A. Amaya-Celis and A. Mujeeb-Kazi. ۱۹۹۴. ...
  • Sabelli, P. and P.R. Shewry. ۱۹۹۱. Characterization and organization of ...
  • Sadeghi, F. and H. Dehghani. ۲۰۱۶. Study of correlation coefficients ...
  • Sambrook, J. and D. Russell. ۲۰۰۱. Molecular Cloning: A Laboratory ...
  • Seed and Plant Improvement Institute. ۲۰۱۵. Introduced cultivars food security ...
  • Shewry, P.R., N.G. Halford and A.S. Tatham. ۱۹۸۹. The high ...
  • Sissons, M.J., B. Osborne and S. Sissons. ۲۰۰۶. Application of ...
  • Tao, H.P. and D.D. Kasarda. ۱۹۸۹. Two-dimensional gel mapping and ...
  • Wang L., X. Zhao, Z. He and X. Xia. ۲۰۰۸. ...
  • Wrigley, C.W. ۱۹۹۶. Giant proteins with flour power. Nature, ۳۸۱(۶۵۸۵): ...
  • Xu H., R.J. Wang, X. Shen, Y.L. Zhao, G.L. Sun, ...
  • Atienza, S.G., J.B. Alvarez, A.M. Villegas, M.J. Gimenez, M.C. Ramirez, ...
  • Blanco, A., P. Resta, R. Simeone, S. Parmar, P.R. Shewry, ...
  • Bozorgmehr, A., J. Ahmadi, F. Shahinnia, Kh. Razavi, G. Njafian ...
  • Cassidy, B.G., J. Dvorak and O.D. Anderson. ۱۹۹۸. The wheat ...
  • Colot, V., L.S. Robert, T.A. Kavanagh, M.W. Bevan and R.D. ...
  • D'ovidio, R. and S.M. Masci. ۲۰۰۴. The low-molecular-weight glutenin subunits ...
  • D'Ovidio, R., C. Marchitelli, L. Ercoli Cardelli and E. Porceddu. ...
  • Doyle, J.J. and J.L. Doyle. ۱۹۸۷. A rapid DNA isolation ...
  • Forde, B.G., A. Heyworth, J. Pywell, M. Kreis. ۱۹۸۵. Nucleotide ...
  • Ghomri, M., H. Peyghambardoost and K. Reshvekarim. ۲۰۰۹. Application of ...
  • Gupta, R.B. and K.W. Shephard. ۱۹۹۰. Two-step one-dimensional SDSPAGE analysis ...
  • Hai, L., Y. MW, Z. HY, B. Bernard, N. Eviatar ...
  • Halajian, M. and B. Naserian. ۲۰۰۷. Review and compare amino ...
  • Harberd, N.P., D. Bartels and R.D. Thompson. ۱۹۸۵. Analysis of ...
  • Jackson, E.A., L.M. Holt and P.I. Payne. ۱۹۸۳. Characterisation of ...
  • Johansson, E., G. Svensson and W.K. Heneen. ۱۹۹۸. Genotype and ...
  • Josephides, C.M., L.R. Joppa, V.L. Youngs. ۱۹۸۷. Effect of chromosome ...
  • Ladogina, M.P., A.A. Pomortsev, V.P. Netsvetaev, A.A. Sozinov. ۱۹۸۹. Identification ...
  • Lew, E.J.L., D.D. Kuzmicky and D.D. Kasarda. ۱۹۹۲. Characterization of ...
  • Li, W., Z. Gao, Y.M. Wei, Z.E. Pu, G.Y. Chen, ...
  • Martinek, P., M. Vinterova, I. Buresova and T. Vyhnanek. ۲۰۰۸. ...
  • Masci, S., D. Lafiandra, E. Porceddu, E.J.L. Lew, H.P. Tao ...
  • Masci, S., E.J. Lew, D. Lafiandra, E. Porceddu and D.D. ...
  • Masci, S., L. Rovelli, D.D. Kasarda, W.H. Vensel and D. ...
  • Nei, M. ۱۹۷۳. Analysis of gene diversity in subdivided populations ...
  • Obukhova, L.V., G.V. Generalova, A.V. Agafonov, V.P. Kumarev, N.A. Popova ...
  • Pahlevani, S., A. Izanloo, S. Parsa and M.GH. Ghaderi. ۲۰۱۶. ...
  • Payne, P.I., E.A. Jackson and L.M. Holt. ۱۹۸۴. The association ...
  • Payne, P.I and K.G. Corfield. ۱۹۷۹. Subunit composition of wheat ...
  • Payne, P.I., L.M. Holt, M.G Jarvis and E.A. Jackson. ۱۹۸۵. ...
  • Pena, R.J., J. Zarco-Hernandez, A. Amaya-Celis and A. Mujeeb-Kazi. ۱۹۹۴. ...
  • Sabelli, P. and P.R. Shewry. ۱۹۹۱. Characterization and organization of ...
  • Sadeghi, F. and H. Dehghani. ۲۰۱۶. Study of correlation coefficients ...
  • Sambrook, J. and D. Russell. ۲۰۰۱. Molecular Cloning: A Laboratory ...
  • Seed and Plant Improvement Institute. ۲۰۱۵. Introduced cultivars food security ...
  • Shewry, P.R., N.G. Halford and A.S. Tatham. ۱۹۸۹. The high ...
  • Sissons, M.J., B. Osborne and S. Sissons. ۲۰۰۶. Application of ...
  • Tao, H.P. and D.D. Kasarda. ۱۹۸۹. Two-dimensional gel mapping and ...
  • Wang L., X. Zhao, Z. He and X. Xia. ۲۰۰۸. ...
  • Wrigley, C.W. ۱۹۹۶. Giant proteins with flour power. Nature, ۳۸۱(۶۵۸۵): ...
  • Xu H., R.J. Wang, X. Shen, Y.L. Zhao, G.L. Sun, ...
  • نمایش کامل مراجع