ارزیابی راندمان تعدادی از ژن های مرجع در آلوروپوس تحت شرایط تنش شوری
Publish place: Journal of Crop Breeding، Vol: 10، Issue: 25
Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 225
This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCB-10-25_013
تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400
Abstract:
استفاده از گونه های وحشی گیاهان زراعی یا خویشاوندان هالوفیت آنها در برنامه های اصلاحی بهمنظور توسعه ارقام زراعی متحمل به شوری و خشکی می تواند نتایج مفیدی را به دنبال داشته باشد. اخیرا گیاه آلوروپوس بهعنوان یک مدل هالوفیت برای شناسایی و جداسازی ژن های جدید متحمل به شوری مورد توجه محققان قرار گرفته است. در میان روش های مورد استفاده برای مطالعات بیان ژن، واکنش زنجیره ای پلی مراز زمان واقعی یکی از روش های مناسب برای ارزیابی میزان بیان ژن است. در این روش کنترل خطا بین نمونه ها ضروری به نظر می رسد. روشی که به صورت گسترده برای کنترل خطا مورد استفاده قرار می گیرد، نرمال کردن سطوح RNA با یک ژن مرجع یا خانه دار می باشد. در این تحقیق بهمنظور بررسی پایداری بیان ژن ها در اندام های برگ و ریشه گیاه آلوروپوس، ۷ ژن مرجع تحت شرایط تنش شوری مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل داده ها با استفاده از نرمافزار geNorm نشان داد که ژن های ACT۱۱، Beta actin و Beta tubulin در برگ و ژن های Beta tubulin و Beta actin در ریشه دارای بیشترین میزان پایداری هستند. بر اساس آماره توصیفی ژن ACT۱۱ دارای بیشترین همبستگی (۸۳۶/۰ و ۷۲۲/۰ به ترتیب در ریشه و برگ) با شاخص BestKeeper بود. همچنین با توجه به نتایج این برنامه، ژن Beta tubulin در برگ و ریشه دارای بیشترین پایداری (کمترین ضریب تغییرات) بود. بنابراین می توان عنوان کرد که ژن های Beta tubulin، Beta actin و ACT۱۱ می توانند بهعنوان ژن های مرجع مناسب در گیاه آلوروپوس بهمنظور نرمال سازی داده های بیانی مورد استفاده قرار بگیرند.
Keywords:
Aeluropus littoralis , Real time PCR , salinity , Reference gene and BestKeeper , آلوروپوس , واکنش زنجیره ی پلی مراز زمان واقعی , تنش شوری , ژن مرجع , BestKeeperBestKeeperBestkeeper
Authors
امین ابراهیمی
Shahrood University of Technology
سجاد رشیدی منفرد
Tarbiat Modares University
امیر مرادی سرابشلی
Sari Agriculture science and Natural Resource University
پرویز حیدری
Shahrood University of Technology
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :