تجزیه ترانسکریپتوم نخود بومی ایرانی در واکنش به تنش خشکی
عنوان مقاله: تجزیه ترانسکریپتوم نخود بومی ایرانی در واکنش به تنش خشکی
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-9-24_001
منتشر شده در در سال 1396
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-9-24_001
منتشر شده در در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:
کیوان مهدوی ماشکی - Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
علی اصغر نصراله نژاد قمی - Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
ماهاندر تودی - International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Hyderabad, India
خلیل زینلی نژاد - Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
احمد یامچی - Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
حسن سلطانلو - Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
راجیو کومار وارشنی - International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Hyderabad, India
خلاصه مقاله:
کیوان مهدوی ماشکی - Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
علی اصغر نصراله نژاد قمی - Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
ماهاندر تودی - International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Hyderabad, India
خلیل زینلی نژاد - Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
احمد یامچی - Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
حسن سلطانلو - Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
راجیو کومار وارشنی - International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Hyderabad, India
نخود (Cicer arietinum L.) علاوه بر اینکه یکی از مهمترین حبوبات از نظر تامین پروتئین برای تغذیه انسان می باشد، نقش مهمی در حاصلخیزی خاک دارد. این گیاه در نواحی خشک و نیمه خشک همچون ایران، در معرض تنش خشکی انتهای فصل قرار دارد. شناسایی ژن های القا شده در شرایط تنش خشکی نه تنها برای درک مکانیسم های مولکولی تحمل بهخشکی ضروری است، بلکه در توسعه گیاهان متحمل اهمیت دارد. در تحقیق حاضر، الگوی ترانسکریپتوم نخود کابلی بومی ایرانی (رقم بیونیج) تحت شرایط خشکی در مرحله اوایل گلدهی در مرکز بین المللی تحقیقات گیاهان زراعی برای نواحی گرمسیری نیمهخشک (ICRISAT) بررسی شد. بهمنظور توالی یابی ترانسکریپتوم نمونه های ریشه و اندام هوایی در شرایط شاهد و تنش از Illumina HiSeq۲۵۰۰ استفاده شد. در مجموع تعداد ۸۹۱ و ۵۰۷ ژن با بیان افتراقی در پاسخ بهتنش خشکی بهترتیب در ریشه و اندام هوایی شناسایی شدند. همچنین تعداد ۷۶۰، ۳۷۶ و ۱۳۱ ژن بهترتیب بهصورت اختصاصی در ریشه، اندام هوایی و مشترک در هر دو اندام بیان شدند. تجزیه ژن آنتولوژی (GO)، چندین گروه GO مربوط بهتنش، شامل واکنش بهمحرک ها و پیام رسانی را در ژن های بیان شده افتراقی در پاسخ بهتنش خشکی شناسایی کرد. علاوه بر این، مسیرهای متابولیکی مهم، نظیر بیوسنتز اسید آبسزیک و پرولین، بیوسنتز متابولیت های ثانویه مثل فلاوونوئیدها و فنیل پروپانوئیدها و متابولیسم های انرژی و کربوهیدارت ها از طریق تجزیه مسیر KEGG شناسایی شدند. یافته های این تحقیق نشان داد که ژن ها و مسیرهای بیشتری در ریشه نسبت به اندام هوایی درگیر بودند. چندین ژن بیان شده افتراقی بویژه آن هایی که بهعنوان عوامل رونویسی در ارتباط با ژن های واکنشدهنده بهخشکی عمل کردند را می توان در تحقیقات آتی و برای بهبود ارقام متحمل به خشکی استفاده کرد.
کلمات کلیدی: Chickpea, Drought, Metabolic pathways, RNA-Seq, Transcription factors, نخود, خشکی, RNA-Seq, مسیرهای متابولیکی, عوامل رونویسی
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1284737/