شناسایی رونوشت های با افزایش تظاهر در رقم برنج (Oryza sativa L.) مقاوم به  تنش شوری با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP

فاطمه زارع; غلامعلی رنجبر; علیرضا ترنگ; حمید نجفی زرینی

شناسایی رونوشت های با افزایش تظاهر در رقم برنج (Oryza sativa L.) مقاوم به تنش شوری با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP

Publish place: Journal of Crop Breeding، Vol: 9، Issue: 23

Publish Year: 1396

نوع سند: مقاله ژورنالی

زبان: Persian

This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download

دریافت فایل کامل Paper

Certificate
من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

https://civilica.com/doc/1284771

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCB-9-23_014

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

Abstract:

تنش شوری یکی از مهمترین تنشهای غیرزیستی برای برنج است که بهطور منفی رشد و باروری آن را متاثر میسازد. در این پژوهش اثرات تنش شوری بر بیان افتراقی برخی از ژنهای مسئول در تنش شوری در دو ژنوتیپ برنج متحمل و حساس به شوری (FL۴۷۸ و IR۲۹) با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP مورد بررسی قرار گرفت. از میان TDFهای (Transcript Derived Fragments یا قطعات حاصل از رونوشتها) حاصل از ۲ آنزیم برشی و ۱۸ ترکیب آغازگری که در پاسخ به تنش شوری در رقم مقاوم در مقایسه با تیمار شاهد و حساس افزایش بیان نشان داده بودند ۲۸ TDF جدا شد که در نهایت ۲۱ عدد از آنها کلون، توالییابی و در بانک ژن ثبت گردیدند و سپس با استفاده از الگوریتم بلاست مورد آنالیز قرار گرفتند. TDFهای شناسایی شده در این مطالعه متعلق به گروههای متفاوتی از ژنها شامل متابولیسم، ترارسانی سیگنال، فاکتورهای رونویسی، سمیتزدایی، سیستم ترانسپورت و دیگر مکانیسمهای مرتبط با تنش شوری بودند که این امر بیانگر آن است که تعداد زیادی از فرآیندها در پاسخ به تنش شوری درگیر هستند. سپس تعدادی از این ژنها برای تائید الگوهای بیانی به دست آمده توسط cDNA-AFLP با استفاده از آنالیز Real time PCR انتخاب گردیدند که نتایج به دست آمده از این آزمایش الگوهای بیانی ردیابی شده با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP را تائید نمود. نتایج این تحقیق نشان داد که cDNA-AFLP تکنیک قدرتمندی برای بررسی الگوی بیان ژنهای برنج تحت تنش شوری میباشد. علاوه بر این یافتههای ما به روشن نمودن اساس مولکولی اثرات تنش شوری بر ژنوم برنج و شناسایی ژنهایی که میتوانند تحمل به شوری برنج را افزایش دهند کمک مینماید.

Keywords:

CDNA-AFLP , Gene expression , Oryza sativa , Salt stress , Transcript , تنش شوری , cDNA-AFLP , رونوشت , بیان ژن , برنج

Authors

فاطمه زارع

Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University

غلامعلی رنجبر

Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University

علیرضا ترنگ

Agricultural Biotechnology Research and Institute Iran, Gilan branch, Agricultural Research, Training and Promotion Organization, Rasht, Iran

حمید نجفی زرینی

Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

Akihiro, T., T. Umezawa, C. Ueki, B.M. Lobna., K. Mizuno, ...
Anderson, J.V. and D.G. Davis. ۲۰۰۴. Abiotic stress alters transcript ...
Bachem, C.W.B., R.S. Hoeven, S.M. Bruijn, D. Vreugdenhil, M. Zabeau ...
Bianchi, M.W., C. Roux and N. Vartanian. ۲۰۰۲. Drought regulation ...
Chen, J.H., H.W. Jiang, E.J. Hsieh, H.Y. Chen, C.T. Chien, ...
Chen, W., N.J. Provart, J. Glazebrook, F. Katagiri, H.S. Chang, ...
Chi, W., J.H. Yang, N.H. Wu and F. Zhang. ۲۰۰۴. ...
Ciuzan, O., J. Hancock, D. Pamfil, I. Wilson and M. ...
Cordin, O., J. Banroques, N.K. Tanner and P. Linder. ۲۰۰۶. ...
Das, S., R. Basu and B. Ghosh. ۱۹۸۷. Heat stress ...
Davies, D.D. ۱۹۸۶. The fine control of cytosolic pH. Physiology ...
Dinari, A., A. Niazi, A.R. Afsharifar and A. Ramezani. ۲۰۱۳. ...
Dreyfuss, G., V.N. Kim and N. Kataoka. ۲۰۰۲. Messenger-RNA-binding proteins ...
Dubouzet, J.G., Y. Sakuma, Y. Ito, M. Kasuga, E.G. Dubouzet, ...
Felle, H.H. ۲۰۰۱. PH: signal and messenger in plant cells. ...
Fushimi, T., M. Umeda, T. Shimazaki, A. Kato, K. Toriyama ...
Gong, X., M. Liu, L. Zhang, Y. Ruan, R. Ding, ...
Ibraheem, O., G. Dealtry, S. Roux and G. Bradley. ۲۰۱۱. ...
Jha, B., A. Sharma and A. Mishra. ۲۰۱۱. Expression of ...
Ji, W., Y. Zhu, Y. Li, L. Yang, X. Zhao, ...
Kawasaki, S., C. Borchert, M. Deyholos, H. Wang, S. Brazilles, ...
Kawousi. ۲۰۰۱. Effect of different nitrogen and potassium levels on ...
Kreps, J.A., Y. Wu, H.S. Chang, T. Zhu, X. Wang ...
Krishna, R. and K.A. Bhagwat. ۱۹۸۹. Polyamines as modulators of ...
Kumar, V., V. Shriram, T.D. Nikam, N. Jawali and M.G. ...
Li, T., E. Evdokimov, R.F. Shen, C.C. Chao, E. Tekle, ...
Liu, S., Y. Cheng, X. Zhang, Q. Guan, S. Nishiuchi, ...
Livak, K.J. and T.D. Schmittgen. ۲۰۰۱. Analysis of relative gene ...
Mannas, K.C., S. Gupta, D.N. Sengupta and B. Ghosh. ۱۹۹۷. ...
Munnik, T., W. Ligterink, I. Meskiene, O. Calderini, J. Beyerly, ...
Marrs, K.A. ۱۹۹۶. The functions and regulation of glutathione s-transferases ...
Martinoia, E. and D. Rentsch. ۱۹۹۴. Malate compartmentation: responses to ...
McNeil, S.D., M.L. Nuccio, M.J. Ziemak and A.D. Hanson. ۲۰۰۱. ...
Moller, I.M. ۲۰۰۱. Plant mitochondria and oxidative stress: electron transport, ...
Moller, I.M. and A.G. Rasmusson. ۱۹۹۸. The role of NADP ...
Mou, Z., X. Wang, Z. Fu, Y. Dai, C. Han, ...
Munns, R. ۲۰۰۲. Comparative physiology of salt and water stress. ...
Munnik, T., W. Ligterink, I. Meskiene, O. Calderini, J. Beyerly, ...
Owttrim, G.W. ۲۰۰۶. RNA helicases and abiotic stress. Nucleic Acids ...
Pessarakli, M and I. Szabolcs. ۱۹۹۹. Soil salinity and sodicity ...
Pham, X.H., M.K. Reddy, N.Z. Ehtesham, B. Matta and N. ...
Priebe, A. and H.I. Jagar. ۱۹۷۸. Effect of NaCl on ...
Rodríguez, M., M.C. González, E. Cristo, O. Oliva, M. Pujol ...
Shavrukov, Y. ۲۰۱۳. Salt stress or salt shock: which genes ...
Sinah, A.K., M. Jaggi, B. Raghuram and N. Tuteja. ۲۰۱۱. ...
Smith, T.A. ۱۹۷۳. Amine levels in mineral deficient Hordeum vulgare ...
Song, Y., Z. Wang, W. Bo, Y. Ren, Z. Zhang ...
Summers, P. and E.A. Weretilnyk. ۱۹۹۳. Choline synthesis in spinach ...
Tabor, C.W. and H. Tabor. ۱۹۸۴. Polyamines. Annual Review of ...
Turner, L.B. and G.R. Stewart. ۱۹۸۶. The effect of water ...
Verslues, P.E., M.A. Garwal, S. Katiyar-Agarwal, J. Zhu and J.K. ...
Vos, P., R. Hogers, M. Bleeker, M. Reijans, T. Lee, ...
Wang, X., W. Liu, X. Chen, C. Tang, Y. Dong, ...
Weretilnyk, E.A., D.D. Smith, G.A. Wilch and P.S. Summers. ۱۹۹۵. ...
Xu, D., X. Duan, B. Wang, B. Hong, T. Ho ...
Zheng, L., M.C. Shannon and S.M. Lesch. ۲۰۰۱. Timing of ...
Akihiro, T., T. Umezawa, C. Ueki, B.M. Lobna., K. Mizuno, ...
Anderson, J.V. and D.G. Davis. ۲۰۰۴. Abiotic stress alters transcript ...
Bachem, C.W.B., R.S. Hoeven, S.M. Bruijn, D. Vreugdenhil, M. Zabeau ...
Bianchi, M.W., C. Roux and N. Vartanian. ۲۰۰۲. Drought regulation ...
Chen, J.H., H.W. Jiang, E.J. Hsieh, H.Y. Chen, C.T. Chien, ...
Chen, W., N.J. Provart, J. Glazebrook, F. Katagiri, H.S. Chang, ...
Chi, W., J.H. Yang, N.H. Wu and F. Zhang. ۲۰۰۴. ...
Ciuzan, O., J. Hancock, D. Pamfil, I. Wilson and M. ...
Cordin, O., J. Banroques, N.K. Tanner and P. Linder. ۲۰۰۶. ...
Das, S., R. Basu and B. Ghosh. ۱۹۸۷. Heat stress ...
Davies, D.D. ۱۹۸۶. The fine control of cytosolic pH. Physiology ...
Dinari, A., A. Niazi, A.R. Afsharifar and A. Ramezani. ۲۰۱۳. ...
Dreyfuss, G., V.N. Kim and N. Kataoka. ۲۰۰۲. Messenger-RNA-binding proteins ...
Dubouzet, J.G., Y. Sakuma, Y. Ito, M. Kasuga, E.G. Dubouzet, ...
Felle, H.H. ۲۰۰۱. PH: signal and messenger in plant cells. ...
Fushimi, T., M. Umeda, T. Shimazaki, A. Kato, K. Toriyama ...
Gong, X., M. Liu, L. Zhang, Y. Ruan, R. Ding, ...
Ibraheem, O., G. Dealtry, S. Roux and G. Bradley. ۲۰۱۱. ...
Jha, B., A. Sharma and A. Mishra. ۲۰۱۱. Expression of ...
Ji, W., Y. Zhu, Y. Li, L. Yang, X. Zhao, ...
Kawasaki, S., C. Borchert, M. Deyholos, H. Wang, S. Brazilles, ...
Kawousi. ۲۰۰۱. Effect of different nitrogen and potassium levels on ...
Kreps, J.A., Y. Wu, H.S. Chang, T. Zhu, X. Wang ...
Krishna, R. and K.A. Bhagwat. ۱۹۸۹. Polyamines as modulators of ...
Kumar, V., V. Shriram, T.D. Nikam, N. Jawali and M.G. ...
Li, T., E. Evdokimov, R.F. Shen, C.C. Chao, E. Tekle, ...
Liu, S., Y. Cheng, X. Zhang, Q. Guan, S. Nishiuchi, ...
Livak, K.J. and T.D. Schmittgen. ۲۰۰۱. Analysis of relative gene ...
Mannas, K.C., S. Gupta, D.N. Sengupta and B. Ghosh. ۱۹۹۷. ...
Munnik, T., W. Ligterink, I. Meskiene, O. Calderini, J. Beyerly, ...
Marrs, K.A. ۱۹۹۶. The functions and regulation of glutathione s-transferases ...
Martinoia, E. and D. Rentsch. ۱۹۹۴. Malate compartmentation: responses to ...
McNeil, S.D., M.L. Nuccio, M.J. Ziemak and A.D. Hanson. ۲۰۰۱. ...
Moller, I.M. ۲۰۰۱. Plant mitochondria and oxidative stress: electron transport, ...
Moller, I.M. and A.G. Rasmusson. ۱۹۹۸. The role of NADP ...
Mou, Z., X. Wang, Z. Fu, Y. Dai, C. Han, ...
Munns, R. ۲۰۰۲. Comparative physiology of salt and water stress. ...
Munnik, T., W. Ligterink, I. Meskiene, O. Calderini, J. Beyerly, ...
Owttrim, G.W. ۲۰۰۶. RNA helicases and abiotic stress. Nucleic Acids ...
Pessarakli, M and I. Szabolcs. ۱۹۹۹. Soil salinity and sodicity ...
Pham, X.H., M.K. Reddy, N.Z. Ehtesham, B. Matta and N. ...
Priebe, A. and H.I. Jagar. ۱۹۷۸. Effect of NaCl on ...
Rodríguez, M., M.C. González, E. Cristo, O. Oliva, M. Pujol ...
Shavrukov, Y. ۲۰۱۳. Salt stress or salt shock: which genes ...
Sinah, A.K., M. Jaggi, B. Raghuram and N. Tuteja. ۲۰۱۱. ...
Smith, T.A. ۱۹۷۳. Amine levels in mineral deficient Hordeum vulgare ...
Song, Y., Z. Wang, W. Bo, Y. Ren, Z. Zhang ...
Summers, P. and E.A. Weretilnyk. ۱۹۹۳. Choline synthesis in spinach ...
Tabor, C.W. and H. Tabor. ۱۹۸۴. Polyamines. Annual Review of ...
Turner, L.B. and G.R. Stewart. ۱۹۸۶. The effect of water ...
Verslues, P.E., M.A. Garwal, S. Katiyar-Agarwal, J. Zhu and J.K. ...
Vos, P., R. Hogers, M. Bleeker, M. Reijans, T. Lee, ...
Wang, X., W. Liu, X. Chen, C. Tang, Y. Dong, ...
Weretilnyk, E.A., D.D. Smith, G.A. Wilch and P.S. Summers. ۱۹۹۵. ...
Xu, D., X. Duan, B. Wang, B. Hong, T. Ho ...
Zheng, L., M.C. Shannon and S.M. Lesch. ۲۰۰۱. Timing of ...

نمایش کامل مراجع