شناسایی رونوشت های با افزایش تظاهر در رقم برنج (Oryza sativa L.) مقاوم به تنش شوری با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP
عنوان مقاله: شناسایی رونوشت های با افزایش تظاهر در رقم برنج (Oryza sativa L.) مقاوم به تنش شوری با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-9-23_014
منتشر شده در در سال 1396
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-9-23_014
منتشر شده در در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:
فاطمه زارع - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
غلامعلی رنجبر - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
علیرضا ترنگ - Agricultural Biotechnology Research and Institute Iran, Gilan branch, Agricultural Research, Training and Promotion Organization, Rasht, Iran
حمید نجفی زرینی - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
خلاصه مقاله:
فاطمه زارع - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
غلامعلی رنجبر - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
علیرضا ترنگ - Agricultural Biotechnology Research and Institute Iran, Gilan branch, Agricultural Research, Training and Promotion Organization, Rasht, Iran
حمید نجفی زرینی - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
تنش شوری یکی از مهمترین تنشهای غیرزیستی برای برنج است که بهطور منفی رشد و باروری آن را متاثر میسازد. در این پژوهش اثرات تنش شوری بر بیان افتراقی برخی از ژنهای مسئول در تنش شوری در دو ژنوتیپ برنج متحمل و حساس به شوری (FL۴۷۸ و IR۲۹) با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP مورد بررسی قرار گرفت. از میان TDFهای (Transcript Derived Fragments یا قطعات حاصل از رونوشتها) حاصل از ۲ آنزیم برشی و ۱۸ ترکیب آغازگری که در پاسخ به تنش شوری در رقم مقاوم در مقایسه با تیمار شاهد و حساس افزایش بیان نشان داده بودند ۲۸ TDF جدا شد که در نهایت ۲۱ عدد از آنها کلون، توالییابی و در بانک ژن ثبت گردیدند و سپس با استفاده از الگوریتم بلاست مورد آنالیز قرار گرفتند. TDFهای شناسایی شده در این مطالعه متعلق به گروههای متفاوتی از ژنها شامل متابولیسم، ترارسانی سیگنال، فاکتورهای رونویسی، سمیتزدایی، سیستم ترانسپورت و دیگر مکانیسمهای مرتبط با تنش شوری بودند که این امر بیانگر آن است که تعداد زیادی از فرآیندها در پاسخ به تنش شوری درگیر هستند. سپس تعدادی از این ژنها برای تائید الگوهای بیانی به دست آمده توسط cDNA-AFLP با استفاده از آنالیز Real time PCR انتخاب گردیدند که نتایج به دست آمده از این آزمایش الگوهای بیانی ردیابی شده با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP را تائید نمود. نتایج این تحقیق نشان داد که cDNA-AFLP تکنیک قدرتمندی برای بررسی الگوی بیان ژنهای برنج تحت تنش شوری میباشد. علاوه بر این یافتههای ما به روشن نمودن اساس مولکولی اثرات تنش شوری بر ژنوم برنج و شناسایی ژنهایی که میتوانند تحمل به شوری برنج را افزایش دهند کمک مینماید.
کلمات کلیدی: CDNA-AFLP, Gene expression, Oryza sativa, Salt stress, Transcript, تنش شوری, cDNA-AFLP, رونوشت, بیان ژن, برنج
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1284771/