بررسی تنوع ژنتیکی گیاه چمن شور ساحلی (Aeluropus littoralis) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره انتقال پذیر مبتنی بر EST
Publish place: Journal of Crop Breeding، Vol: 9، Issue: 22
Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 214
This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCB-9-22_003
تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400
Abstract:
گیاه چمنشور ساحلی یکی از موفقترین گراسهای تکلپه مطرح از نظر تحمل به شوریهای زیاد است که ارزش علوفهای داشته و دارای خصوصیات فیزیولوژیک ارزشمندی است. هدف از این مطالعه معرفی و دسترسی سریع به نشانگرهای مولکولی مبتنی بر DNA و بررسی تنوع ژنتیکی در گونه شورزی و ارزشمند چمنشور ساحلی (Aeluropus littoralis) میباشد. بدین منظور آزمون تکثیر ژنومی در این گیاه با استفاده از ۱۱۰ جفت نشانگر ریزماهواره EST بدست آمده از گونههای گندم، برنج و جو برای شناسایی نشانگرهای انتقالپذیر انجام گرفت. بر این اساس میزان کل انتقالپذیری نشانگرهای ریزماهواره EST با منشاء غلات در گیاه چمنشور ساحلی ۴۴ درصد بدست آمد. این نتیجه نشان میدهد که از مخزن نشانگرهای ریزماهواره غلات میتوان برای دستیابی و توسعه نشانگرهای مولکولی در سایر گونههای ارزشمند خویشاوند با صرف کمترین زمان و هزینه استفاده نمود. در ادامه بهمنظور بررسی میزان کارآمدی نشانگرهای انتقالپذیر شناساییشده در ارزیابی سطح تنوع و گروهبندی ژنتیکی، از ۱۲ جفت نشانگر انتقالپذیر استفاده گردید. در مجموع ۷۴ مکان ژنی با میانگین ۱/۶ آلل به ازای هر جفت آغازگر تکثیر شدند که بیش از۹۰ درصد آنها چندشکل بودند. شاخص PIC برای نشانگرهای مورد بررسی بین ۲۶/۰ و ۳۸/۰ با میانگین ۳۳/۰ محاسبه شد. در نهایت تجزیه خوشهای، اکوتیپهای آلوروپوس را در ۷ گروه دستهبندی کرد. بر این اساس اکوتیپ ها ازلحاظ فاصله جغرافیایی نسبتا از هم تفکیک شدند و میزان چند شکلی افراد و تفاوت گروهها با مشاهدات ظاهری و تنوع کیفی بین نمونه ها مطابقت بالایی داشت.
Keywords:
Aeluropus littoralis , EST-SSR , Genetic diversity , Transferability , انتقال پذیری , تنوع ژنتیکی , چمن شور ساحلی (Aeluropus littoralis) , ریزماهواره EST
Authors
مریم میدانسری
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
قربانعلی نعمت زاده
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
نجمه نصیری
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
احسان شکری
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :