بررسی تنوع ژنتیکی گیاه چمن شور ساحلی (Aeluropus littoralis) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره انتقال پذیر مبتنی بر EST
عنوان مقاله: بررسی تنوع ژنتیکی گیاه چمن شور ساحلی (Aeluropus littoralis) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره انتقال پذیر مبتنی بر EST
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-9-22_003
منتشر شده در در سال 1396
شناسه ملی مقاله: JR_JCB-9-22_003
منتشر شده در در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:
مریم میدانسری - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
قربانعلی نعمت زاده - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
نجمه نصیری - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
احسان شکری - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
خلاصه مقاله:
مریم میدانسری - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
قربانعلی نعمت زاده - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
نجمه نصیری - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
احسان شکری - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
گیاه چمنشور ساحلی یکی از موفقترین گراسهای تکلپه مطرح از نظر تحمل به شوریهای زیاد است که ارزش علوفهای داشته و دارای خصوصیات فیزیولوژیک ارزشمندی است. هدف از این مطالعه معرفی و دسترسی سریع به نشانگرهای مولکولی مبتنی بر DNA و بررسی تنوع ژنتیکی در گونه شورزی و ارزشمند چمنشور ساحلی (Aeluropus littoralis) میباشد. بدین منظور آزمون تکثیر ژنومی در این گیاه با استفاده از ۱۱۰ جفت نشانگر ریزماهواره EST بدست آمده از گونههای گندم، برنج و جو برای شناسایی نشانگرهای انتقالپذیر انجام گرفت. بر این اساس میزان کل انتقالپذیری نشانگرهای ریزماهواره EST با منشاء غلات در گیاه چمنشور ساحلی ۴۴ درصد بدست آمد. این نتیجه نشان میدهد که از مخزن نشانگرهای ریزماهواره غلات میتوان برای دستیابی و توسعه نشانگرهای مولکولی در سایر گونههای ارزشمند خویشاوند با صرف کمترین زمان و هزینه استفاده نمود. در ادامه بهمنظور بررسی میزان کارآمدی نشانگرهای انتقالپذیر شناساییشده در ارزیابی سطح تنوع و گروهبندی ژنتیکی، از ۱۲ جفت نشانگر انتقالپذیر استفاده گردید. در مجموع ۷۴ مکان ژنی با میانگین ۱/۶ آلل به ازای هر جفت آغازگر تکثیر شدند که بیش از۹۰ درصد آنها چندشکل بودند. شاخص PIC برای نشانگرهای مورد بررسی بین ۲۶/۰ و ۳۸/۰ با میانگین ۳۳/۰ محاسبه شد. در نهایت تجزیه خوشهای، اکوتیپهای آلوروپوس را در ۷ گروه دستهبندی کرد. بر این اساس اکوتیپ ها ازلحاظ فاصله جغرافیایی نسبتا از هم تفکیک شدند و میزان چند شکلی افراد و تفاوت گروهها با مشاهدات ظاهری و تنوع کیفی بین نمونه ها مطابقت بالایی داشت.
کلمات کلیدی: Aeluropus littoralis, EST-SSR, Genetic diversity, Transferability, انتقال پذیری, تنوع ژنتیکی, چمن شور ساحلی (Aeluropus littoralis), ریزماهواره EST
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1284780/