آنالیز بیان افتراقی ژن ها در پاسخ به عصاره لیپوپلی ساکاریدی ازباکتری اشیرشیاکولای در سلول های اپی تلیال اندومتریوم گاوی

Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 166

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_RAP-8-18_015

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

Abstract:

لیپو­پلی­ساکارید۱(LPS)، بخشی از ساختار غشای بیرونی باکتری­های گرم منفی است که در فرآیند­های پاتوژنی که منجر به ورم پستان و التهاب رحم در گاوهای شیری می­شود، دخالت دارد. هم­چنین LPS باعث التهاب اندومتریوم و شکست لانه­گزینی در بسیاری از گونه­های حیوانی می­شود. باتوجه به اهمیت اقتصادی این بیماری­ها در صنعت گاو شیری، آنالیز بیان افتراقی ژن­ها و شناسایی مسیرهای مرتبط در پاسخ به عصاره لیپوپلی­ساکاریدی از باکتری اشیرشیا­کولای با استفاده از  آنالیز ترانسکریپتوم برای فهم مکانیسم دقیق این فرآیند بسیار حیاتی و ضروری است. در این پژوهش، بعد از مراحل جداسازی و تیمار سلول­های اپی­تلیال اندومتریوم گاو با دوزهای مختلفی ازLPS  (صفر، ۲ و ۸ میلی­گرم بر میلی­لیتر) در محیط کشت، RNA کل استخراج و برای تهیه کتابخانه ترانسکریپتومی مورد استفاده قرار گرفت. در مجموع ۱۲ کتابخانه ترانسکریپتومی از سه گاو قرمز سوئدی (۴ نمونه به ازای هر راس گاو) توسط تکنولوژی با توان عملیاتی بالا تعیین توالی و آنالیز بیان افتراقی ژن­ها و هم­چنین مسیرهای بیولوژیکی مرتبط مورد شناسایی قرار گرفتند. نتایج این پژوهش نشان داد در مجموع ۲۰۳۵ ژن در بین گروه­های شاهد و تیمار شده با LPS دارای بیان متفاوت بوده که تعداد ۷۵۲ ژن در مسیر تکثیر و مرگ سلولی نقش داشتند. هم­چنین نتایج شمارش سلول­های اپی­تلیال نشان داد که عصاره لیپوپلی­ساکاریدی توانست به­طور معنی­داری باعث افزایش تکثیر سلولی شود. آنالیز مسیرهای بیولوژیکی نشان داد که این ژن­ها در تعدادی از مسیرهای سیگنالی  از جمله سیستم ایمنی  شامل مسیر سیگنالی Toll-Like Receptor، T Cell Receptor، MAPK، شیموکین­ها، سرطان اندومتریوم رحمی و هم­چنین مسیر سیگنالی مرگ و تکثیر سلولی دخالت دارند. طبق اطلاعات ما این مطالعه، نخستین تحقیقی است که روی سلول­های اپی­تلیال اندومتریوم گاوی انجام شده است که می­تواند درک ما را در ارتباط با مکانیسم­های مرتبط به التهاب­های ناشی از عفونت­های رحمی در گاو شیری افزایش دهد.

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Windig, J., M. Calus, B. Beerda and R. Veerkamp. ۲۰۰۶. ...
  • Sheldon, I.M., G.S. Lewis, S. LeBlanc and R.O. Gilbert. ۲۰۰۶. ...
  • Gilbert, R.O., S.T. Shin, C.L. Guard, H.N. Erb and M. ...
  • Maizon, D., P. Oltenacu, Y. Gröhn, R. Strawderman and U. ...
  • Földi, J., M. Kulcsar, A. Pecsi, B. Huyghe, C. DeSa, ...
  • Barbosa-Cesnik, C., K. Schwartz and B. Foxman. ۲۰۰۳. Lactation mastitis. ...
  • Hogeveen, H., K, Huijps and T. Lam. ۲۰۱۱. Economic aspects ...
  • Sordillo, L.M. and K.L. Streicher. ۲۰۰۲. Mammary gland immunity and ...
  • Sheldon, I.M., E.J. Williams, A.N. Miller., D.M. Nash and S. ...
  • Cronin, J.G., M.L. Turner, L. Goetze, C.E. Bryant and I.M. ...
  • Sheldon, I.M. and M.H. Roberts. ۲۰۱۰. Toll-like receptor ۴ mediates ...
  • Herath, S., E.J. Williams, S.T. Lilly, R.O. Gilbert, H. Dobson, ...
  • Sheldon, I., D. Noakes, A. Rycroft, D. Pfeiffer and H. ...
  • Williams, E.J., K. Sibley, A.N. Miller, E.A. Lane, J. Fishwick, ...
  • Lavon, Y., G. Leitner, E. Klipper, U. Moallem, R. Meidan ...
  • Selsted, M.E. and A.J. Ouellette. ۲۰۰۵. Mammalian defensins in the ...
  • Akira, S., S. Uematsu and O. Takeuchi. ۲۰۰۶. Pathogen recognition ...
  • Herath, S., D.P. Fischer, D. Werling, E.J. Williams, S.T. Lilly, ...
  • Goldammer, T., H. Zerbe, A. Molenaar, H.J. Schuberth, R. Brunner, ...
  • Schmitz, S., M. Pfaffl, H. Meyer and R. Bruckmaier. ۲۰۰۴. ...
  • Bannerman, D.D., M.J. Paape, J.W. Lee, X. Zhao, J.C. Hope ...
  • Esteve-Codina, A., R. Kofler, N. Palmieri, G. Bussotti, C. Notredame ...
  • Verspohl, E.J. and J. Podlogar. ۲۰۱۲. LPS-induced proliferation and chemokine ...
  • Ulmer, A.J., H.D. Flad, T. Rietschel and T. Mattern. ۲۰۰۰. ...
  • Zhang, L., M. Rees and R. Bicknell. ۱۹۹۵. The isolation ...
  • Andrews, S. ۲۰۱۰. FastQC: A quality control tool for high ...
  • Bolger, A.M., M. Lohse and B. Usadel. ۲۰۱۴. Trimmomatic: a ...
  • Dobin, A., C.A. Davis, F. Schlesinger, J. Drenkow, C. Zaleski, ...
  • Love, M.I., W. Huber and S. Anders. ۲۰۱۴. Moderated estimation ...
  • Wellnitz, O., E. Arnold and R. Bruckmaier. ۲۰۱۱. Lipopolysaccharide and ...
  • Krikun, G., J. Trezza, J. Shaw, M. Rahman, S. Guller, ...
  • Liu, L., Y. Lin, L. Liu, Y. Bian, L. Zhang, ...
  • Zhao, M., A. Zhou, L. Xu and X. Zhang. ۲۰۱۴. ...
  • Butchar, J.P., K.V. Parsa, C.B. Marsh and S. Tridandapani. ۲۰۰۶. ...
  • Goodier, M.R. and M. Londei. ۲۰۰۰. Lipopolysaccharide stimulates the proliferation ...
  • Tulic, M.K., J.J. Manoukian, D.H. Eidelman and Q. Hamid. ۲۰۰۲. ...
  • Wiktorowska-Owczarek, A., M. Namiecińska and J. Owczarek. ۲۰۱۵. The effect ...
  • Toda, K., N. Kumagai, K. Tsuchimoto, H. Inagaki, T. Suzuki, ...
  • Niranjan, R., R. Nagarajan, K. Hanif, C. Nath and R. ...
  • He, Z., Y. Gao, Y. Deng, W. Li, Y. Chen, ...
  • Español, A., M. Maddaleno, M. Lombardi, M. Cella, P. Martinez ...
  • Knapp, M., E. Severinson-Gronowicz, J. Schröder and S. Strober. ۱۹۷۹. ...
  • Marcia Delattre, A., B. Carabelli, M. Aurélio Mori, C. Pudell, ...
  • Yokota, S.I., T. Okabayashi, M. Rehli, N. Fujii and K.I. ...
  • Lin, T.Y., C.W. Fan, M.C. Maa and T.H. Leu. ۲۰۱۵. ...
  • Park, J., G.J. Gores and T. Patel. ۱۹۹۹. Lipopolysaccharide induces ...
  • Chen, G.Y., J. Tang, P. Zheng and Y. Liu. ۲۰۰۹. ...
  • O'Hara, S.P., P.L. Splinter, C.E. Trussoni, G.B. Gajdos, P.N. Lineswala ...
  • Eslani, M., A. Movahedan, N. Afsharkhamseh, H. Sroussi and A.R. ...
  • Basso, F.G., D. Soares, T. Pansani, A. Turrioni, D. Scheffel, ...
  • Li, L., W. Shoji, H. Takano, N. Nishimura, Y. Aoki, ...
  • Klunker, L., S. Kahlert, P. Panther, A.K. Diesing, N. Reinhardt, ...
  • Daly, K.A., S.L. Mailer, M.R. Digby, C. Lefévre, P. Thomson, ...
  • Freitag, A., A. Reimann, I. Wessler and K. Racké. ۱۹۹۶. ...
  • Hei, Z., A. Zhang, J. Wei, X. Gan, Y. Wang, ...
  • Cohn, Z.J., A. Kim, L. Huang, J. Brand and H. ...
  • Calvinho, L.F., R.A. Almeida and S. Oliver. ۲۰۰۰. Influence of ...
  • Piotrowska-Tomala, K., M. Siemieniuch, A. Szóstek, A. Korzekwa, I. Woclawek-Potocka, ...
  • Windig, J., M. Calus, B. Beerda and R. Veerkamp. ۲۰۰۶. ...
  • Sheldon, I.M., G.S. Lewis, S. LeBlanc and R.O. Gilbert. ۲۰۰۶. ...
  • Gilbert, R.O., S.T. Shin, C.L. Guard, H.N. Erb and M. ...
  • Maizon, D., P. Oltenacu, Y. Gröhn, R. Strawderman and U. ...
  • Földi, J., M. Kulcsar, A. Pecsi, B. Huyghe, C. DeSa, ...
  • Barbosa-Cesnik, C., K. Schwartz and B. Foxman. ۲۰۰۳. Lactation mastitis. ...
  • Hogeveen, H., K, Huijps and T. Lam. ۲۰۱۱. Economic aspects ...
  • Sordillo, L.M. and K.L. Streicher. ۲۰۰۲. Mammary gland immunity and ...
  • Sheldon, I.M., E.J. Williams, A.N. Miller., D.M. Nash and S. ...
  • Cronin, J.G., M.L. Turner, L. Goetze, C.E. Bryant and I.M. ...
  • Sheldon, I.M. and M.H. Roberts. ۲۰۱۰. Toll-like receptor ۴ mediates ...
  • Herath, S., E.J. Williams, S.T. Lilly, R.O. Gilbert, H. Dobson, ...
  • Sheldon, I., D. Noakes, A. Rycroft, D. Pfeiffer and H. ...
  • Williams, E.J., K. Sibley, A.N. Miller, E.A. Lane, J. Fishwick, ...
  • Lavon, Y., G. Leitner, E. Klipper, U. Moallem, R. Meidan ...
  • Selsted, M.E. and A.J. Ouellette. ۲۰۰۵. Mammalian defensins in the ...
  • Akira, S., S. Uematsu and O. Takeuchi. ۲۰۰۶. Pathogen recognition ...
  • Herath, S., D.P. Fischer, D. Werling, E.J. Williams, S.T. Lilly, ...
  • Goldammer, T., H. Zerbe, A. Molenaar, H.J. Schuberth, R. Brunner, ...
  • Schmitz, S., M. Pfaffl, H. Meyer and R. Bruckmaier. ۲۰۰۴. ...
  • Bannerman, D.D., M.J. Paape, J.W. Lee, X. Zhao, J.C. Hope ...
  • Esteve-Codina, A., R. Kofler, N. Palmieri, G. Bussotti, C. Notredame ...
  • Verspohl, E.J. and J. Podlogar. ۲۰۱۲. LPS-induced proliferation and chemokine ...
  • Ulmer, A.J., H.D. Flad, T. Rietschel and T. Mattern. ۲۰۰۰. ...
  • Zhang, L., M. Rees and R. Bicknell. ۱۹۹۵. The isolation ...
  • Andrews, S. ۲۰۱۰. FastQC: A quality control tool for high ...
  • Bolger, A.M., M. Lohse and B. Usadel. ۲۰۱۴. Trimmomatic: a ...
  • Dobin, A., C.A. Davis, F. Schlesinger, J. Drenkow, C. Zaleski, ...
  • Love, M.I., W. Huber and S. Anders. ۲۰۱۴. Moderated estimation ...
  • Wellnitz, O., E. Arnold and R. Bruckmaier. ۲۰۱۱. Lipopolysaccharide and ...
  • Krikun, G., J. Trezza, J. Shaw, M. Rahman, S. Guller, ...
  • Liu, L., Y. Lin, L. Liu, Y. Bian, L. Zhang, ...
  • Zhao, M., A. Zhou, L. Xu and X. Zhang. ۲۰۱۴. ...
  • Butchar, J.P., K.V. Parsa, C.B. Marsh and S. Tridandapani. ۲۰۰۶. ...
  • Goodier, M.R. and M. Londei. ۲۰۰۰. Lipopolysaccharide stimulates the proliferation ...
  • Tulic, M.K., J.J. Manoukian, D.H. Eidelman and Q. Hamid. ۲۰۰۲. ...
  • Wiktorowska-Owczarek, A., M. Namiecińska and J. Owczarek. ۲۰۱۵. The effect ...
  • Toda, K., N. Kumagai, K. Tsuchimoto, H. Inagaki, T. Suzuki, ...
  • Niranjan, R., R. Nagarajan, K. Hanif, C. Nath and R. ...
  • He, Z., Y. Gao, Y. Deng, W. Li, Y. Chen, ...
  • Español, A., M. Maddaleno, M. Lombardi, M. Cella, P. Martinez ...
  • Knapp, M., E. Severinson-Gronowicz, J. Schröder and S. Strober. ۱۹۷۹. ...
  • Marcia Delattre, A., B. Carabelli, M. Aurélio Mori, C. Pudell, ...
  • Yokota, S.I., T. Okabayashi, M. Rehli, N. Fujii and K.I. ...
  • Lin, T.Y., C.W. Fan, M.C. Maa and T.H. Leu. ۲۰۱۵. ...
  • Park, J., G.J. Gores and T. Patel. ۱۹۹۹. Lipopolysaccharide induces ...
  • Chen, G.Y., J. Tang, P. Zheng and Y. Liu. ۲۰۰۹. ...
  • O'Hara, S.P., P.L. Splinter, C.E. Trussoni, G.B. Gajdos, P.N. Lineswala ...
  • Eslani, M., A. Movahedan, N. Afsharkhamseh, H. Sroussi and A.R. ...
  • Basso, F.G., D. Soares, T. Pansani, A. Turrioni, D. Scheffel, ...
  • Li, L., W. Shoji, H. Takano, N. Nishimura, Y. Aoki, ...
  • Klunker, L., S. Kahlert, P. Panther, A.K. Diesing, N. Reinhardt, ...
  • Daly, K.A., S.L. Mailer, M.R. Digby, C. Lefévre, P. Thomson, ...
  • Freitag, A., A. Reimann, I. Wessler and K. Racké. ۱۹۹۶. ...
  • Hei, Z., A. Zhang, J. Wei, X. Gan, Y. Wang, ...
  • Cohn, Z.J., A. Kim, L. Huang, J. Brand and H. ...
  • Calvinho, L.F., R.A. Almeida and S. Oliver. ۲۰۰۰. Influence of ...
  • Piotrowska-Tomala, K., M. Siemieniuch, A. Szóstek, A. Korzekwa, I. Woclawek-Potocka, ...
  • نمایش کامل مراجع