ارزیابی تنوع ژنتیکی و روابط فیلوژنتیکی مرغان بومی ایران بر مبنای توالی ناحیه D- loop از DNA میتوکندریایی
عنوان مقاله: ارزیابی تنوع ژنتیکی و روابط فیلوژنتیکی مرغان بومی ایران بر مبنای توالی ناحیه D- loop از DNA میتوکندریایی
شناسه ملی مقاله: JR_RAP-8-17_018
منتشر شده در در سال 1396
شناسه ملی مقاله: JR_RAP-8-17_018
منتشر شده در در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:
کسری احمدیان
قدرت رحیمی میانجی
هادی سیاح زاده
حمید دلدار
خلاصه مقاله:
کسری احمدیان
قدرت رحیمی میانجی
هادی سیاح زاده
حمید دلدار
در مطالعه حاضر به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی و روابط فیلوژنی مرغان بومی ایران، ۳۹ نمونه خون از مرغان بومی مراکز اصلاح نژاد مرغ بومی کشور (اصفهان، مازندران، یزد، فارس، آذربایجان غربی و خراسان) جمعآوری گردید. به منظور مقایسه نتایج حاصل با دیگر نژادهای آسیایی، آفریقایی و اروپایی توالی ناحیه D-loop میتوکندری موجود در بانک جهانی ژن دریافت شد. DNA با استفاده از روش نمکی بهینه یافته استخراج و به عنوان الگو برای تکثیر و تعیین توالی ناحیه D-Loop ژنوم میتوکندری به کار برده شدند. با مطالعه توالی ۲- ۱۲۳۱ جفت بازی ناحیه D-Loop در نمونههای فوق، ۱۶ هاپلوتایپ به همراه ۱۴ جایگاه متغیر تشخیص داده شد. آنالیز واریانس مولکولی با استفاده از روش کیمورا انجام گرفت. مقادیر شاخص تثبیت با استفاده از روش کیمورا در دامنهای بین ۱۵۷۰/۰- ۳۷۷۶۳/۰ قرار گرفت. میزان واریانس در داخل و بین جمعیت های مورد مطالعه به ترتیب برابر با ۰۵/۸۱ و ۹۵/۱۸ درصد برآورد شد. این آزمون نشان داد که در جمعیتهای مورد مطالعه، جمعیتهای آذربایجان غربی و اصفهان، اصفهان و فارس، اصفهان و خراسان، اصفهان و مازندران، اصفهان و یزد، فارس و خراسان و همچنین فارس و یزد با یکدیگر از نظر ژنتیکی متفاوت بودند (۰۵/۰>P). از بین جمعیتهای مورد مطالعه جمعیت اصفهان با تمامی جمعیتهای دیگر از نظر ژنتیکی تفاوت معنیدار داشته است (۰۵/۰>P). به طور کلی نتایج بدست آمده نشان داد که مرغ بومی ایران دارای تنوع ژنتیکی قابل قبول بوده و درخت فیلوژنی ترسیم شده برمبنای هاپلوتایپهای حاصله مرغان بومی ایران در دسته هاپلو گروه A (مرغان بومی ژاپن، لکهورن سفید، ردآیلندرد)، هاپلوگروه E (مرغان بومی خاورمیانه و اروپا) و هاپلوگروه C (مرغان بومی آفریقا) قرار گرفتند. همچنین نتایج فیلوژنی مشخص کرد که مرغ بومی ایران همانند مرغ بومی ژاپن، چین، خاورمیانه، اروپا و آفریقا از آسیای جنوب شرقی و هندوستان منشا گرفته و احتمالا از طریق مسیرهای باستانی، از آسیای جنوب شرقی و هندوستان به ایران و از ایران به سمت غرب امتداد یافته و به دنیای غرب معرفی شده است.
کلمات کلیدی: Genetic diversity, Genetic distance, Iranian native chickens, mtDNA, Phylogenic, مرغ بومی ایران, DNA میتوکندری, فیلوژنی, تنوع ژنتیکی
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1285153/