بررسی الگوی عدم تعادل لینکاژی و مطالعه ارتباط ژنومی هاپلوتیپی جهت شناسایی مناطق ژنومی موثر بر دو قلوزایی در گوسفندان نژاد بلوچی

  دوقلوزایی از صفات مهم اقتصادی در پرورش گوسفند می­باشند. صفات تولید­مثلی نه تنها در بین نژادهای مختلف گوسفند بلکه در بین گوسفندان یک نژاد نیز دارای تفاوت­های عمده می­باشند. در این تحقیق مطالعه الگوی عدم­تعادل لینکاژی و ارتباط ژنومی هاپلوتیپی با استفاده از ۴۲۴۱۶ نشانگر تک­نوکلئوتیدی برای شناسایی نواحی ژنومی موثر بر نرخ دو­قلوزایی در گوسفند بلوچی انجام شد. نمونه­های خون از ۹۶ راس گوسفند بلوچی همراه با داده­های فنوتیپی مرتبط به صفات زایش و رشد متعلق به دو گله از ایستگاه تحقیقاتی عباس­آباد تهیه شد. نمونه­ها با استفاده از ریز­آرایه­های نانویی گوسفندی ( ۵۰K ) تعیین ژنوتیپ شدند. با استفاده از نرم­افزار PLINK ماتریس خویشاوندی IBS و هاپلوتیپ­ها برای افراد محاسبه و مطالعه ارتباط هاپلوتیپ­ها برای نرخ دو­قلوزایی برای ۴ شکم زایش با در نظر گرفتن بعد اول آزمون MDS و اثر گله به­عنوان متغیر کمکی انجام شد. برای کنترل نرخ اشتباه در سطح خانواده، از تصحیح بنفرونی استفاده شد. ارتباط معنی­دار پیشنهادی برای هاپلوتیپ­ها روی کروموزوم­های ۱، ۱۰ و ۱۵ شناسایی شد. مقدار عدم تعادل لینکاژی با استفاده از آماره r۲ بین تمام جفت لوکوس ها محاسبه شد.. در فاصله کمتر از ۱۰ Kb میانگین r۲ برابر ۳۳/۰ بوده و برای نشانگرهای با فاصله ۲۰۰ تا ۵۰۰ کیلو باز میانگین r۲ ۰۸۶/۰ بود. مقدار عدم نعادل لینکاژی در گوسفند بلوچی نسبت به آنچه در گاو شیری گزارش شده کمتر بوده و مشابه دیگر جمعیت­های کوسفند می باشد. مطالعه بیشتر این نواحی در شناسایی ژن­های کاندید دوقلوزایی در گوسفند کمک شایانی خواهد نمود.

Keywords:

Twining , Sheep , LD , Haplotype , Genomic wide association , دو قلوزایی , گوسفند , LD , هایپلوتیپ , پویش ژنومی