Designing novel molecule (V-NNC) based on Voxelotor (GBT-۴۴۰) against sickle cell disease (SCD) via binding to carbonmonoxy hemoglobin S

Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: English
View: 174

This Paper With 17 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJNC-8-4_009

تاریخ نمایه سازی: 26 مهر 1400

Abstract:

Sticking cell disease is a defect in hemoglobin structure that leads to deficiency in oxygen transferring to tissues. Voxelotor is a new compound that achieved FDA approve to treat SCD, recently. In this study, we aimed to introduce novel structure based on the voxelotor to cure the mentioned condition more effectively. At the beginning, various properties of Voxelotor including electronic properties, reactivity and stability were assessed via B۳LYP/۶-۳۱۱++G(d,p) method and Global Reactivity in said method that revealed Voxelotor is a stable compound with low reactivity. In addition, docking potential of Voxelotor into active site of hemoglobin S was investigated. Then, several molecules were designed and optimized based on the Voxelotor structure. Docking and physicochemical properties of investigated molecules were analyzed. Results of presented study revealed that between four molecules (V-NNC, V-NNN, V-CNC and V-CNN) with higher potential to interact with Hemoglobin S in comparison with Voxelotor, only V-NNC has the optimum physicochemical features. So, molecular structure screening and evaluating of Voxelotor and designing novel compounds based on it leads to introducing an optimized molecule with suitable potential to treat SCD.

Keywords:

Stricking cell disease (SCD) , Drug design , Molecular Docking , Hemuglobin S , Voxelotor

Authors

Mehdi Nabati

Research and Development Department, Nanogostar-e-Mihan Pharmaceutical Company, Tehran, Iran

Farzaneh Malekian

Research and Development Department, Shari Pharmaceutical Company, Tehran, Iran

Akbar Forghani

Research and Development Department, Nanogostar-e-Mihan Pharmaceutical Company, Tehran, Iran

Elham Pournamdari

Department of Science, Islamshahr Branch, Islamic Azad University, Islamshahr, Iran

Vida Bodaghi-Namileh

Department of Toxicology and Pharmacology, Faculty of Pharmacy, Tehran University of Medical Sciences,

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • I. Rehman, S. Botelho, Secondary Protein Structure in Biochemistry, StatPearls ...
  • Y. Morita, T. Yamada, M. Kureishi, K. Kihira, T. Komatsu, ...
  • R. Macdonald, M. Phillips, D. Cascio, M. Collazo, R. T. ...
  • J.-K. Hong, E. H. Jho, H. S. Choi, G. Kang, ...
  • M. Khoshouei, R. Danev, J. M. Plitzko, W. Baumeister, J. ...
  • E. Duscio, F. Vasques, F. Romitti, F. Cipulli, L. Gattinoni, ...
  • M. Bellizzi and M. Bonello, J. Emerg. Med. Intens. Care ...
  • E. I. Kvasyuk, T. I. Kulak, O. V. Tkachenko, I. ...
  • J. J. Yan, T. Kroll, M. L. Baker, S. A. ...
  • R. Ramachandran, C. Zhao, D. Luo, K. Wang, F. Wang, ...
  • S. Sakurai, D. Sawada, T. Yonetani, A. Tsuneshige, Biophys. J. ...
  • M. Rossetti, S. Ranallo, A. Idili, G. Palleschi, A. Porchetta, ...
  • B. Jensen, A. Fago, J. Inorg. Biochem. ۱۸۲, ۱۳۳ (۲۰۱۸) ...
  • W. A. Eaton, E. R. Henry, J. Hofrichter, S. Bettati, ...
  • A. Bellelli, M. Brunori, Biochim. Biophys. Acta ۱۸۰۷, ۱۲۶۲ (۲۰۱۱) ...
  • a) W. Yan, Y. Xie, X. Wang, F. Jia, X. ...
  • I. Benenson, S. Porter, Orthop. Nurs. ۳۷, ۲۲۱ (۲۰۱۸) ...
  • S. K. Tossea, E. G. Adji, B. Coulibaly, B. A. ...
  • B. J. Kumar, A. B. Kumar, L. L. Reddy, World ...
  • M. Bender, GeneReviews, ۲۰۱۷, ۱۹۹۳ (۲۰۱۷) ...
  • R. E. Ware, M. de Montalembert, L. Tshilolo, M. R. ...
  • A. Habara, M. H. Steinberg, Exp. Biol. Med. ۲۴۱, ۶۸۹ ...
  • a) E. Depetris‐Chauvin, D. N. Weil, Econ. J. ۱۲۸, ۱۲۰۷ ...
  • B. Metcalf, C. Chuang, K. Dufu, M. P. Patel, A. ...
  • N. M. Elmaki, I. A. Al Sadawi, A. M. Gbaj, ...
  • M. El-Naggar, H. A. Sallam, S. S. Shaban, S. S. ...
  • M. Nabati, V. Bodaghi-Namileh, Int. J. New. Chem. ۶, ۲۵۴ ...
  • M. Nabati, J. Med. Chem. Sci. ۳, ۲۲ (۲۰۲۰) ...
  • M. Nabati, Chem. Methodol. ۲, ۲۲۳ (۲۰۱۸) ...
  • M. Nabati, Iran. Chem. Commun. ۷, ۳۲۴ (۲۰۱۹) ...
  • M. Nabati, H. Sabahnoo, J. Med. Chem. Sci. ۲, ۱۱۸ ...
  • B. Metcalf, C. Chuang, K. Dufu, M. P. Patel, A. ...
  • M. Nabati, Asian J. Green Chem. ۳, ۲۵۸ (۲۰۱۹) ...
  • M. Nabati, V. Bodaghi-Namileh, J. Phys. Theor. Chem. IAU Iran ...
  • M. D. Esrafili, ChemistrySelect ۳, ۱۲۰۷۲ (۲۰۱۸) ...
  • H. Nazemi, M. Mirzaei, E. Jafari, Adv. J. Chem. B ...
  • Z. S. Alidoosti, M. Mirzaei, Adv. J. Chem. B ۱, ...
  • M. Nabati, V. Bodaghi-Namileh, Eurasian Chem. Commun. ۲, ۲۳۴ (۲۰۲۰) ...
  • A. De, H. P. Ray, P. Jain, H. Kaur, N. ...
  • M. Nabati, V. Bodaghi-Namileh, J. Phys. Theor. Chem. IAU Iran ...
  • M. Nabati, H. Sabahnoo, E. Lohrasbi, M. Mazidi, Chem. Methodol. ...
  • M. Nabati, V. Bodaghi-Namileh, Adv. J. Chem. A ۳, ۵۸ ...
  • S. Samadi, R. Ahmadi, M. Kohi, Int. J. New. Chem. ...
  • E. Hegin, J. Shalini, A. Subramaniyan, Int. J. New. Chem. ...
  • M. Mozafarjalali, M. Hajiani, A. Haji, Int. J. New. Chem. ...
  • M. S. Nagar, Int. J. New. Chem. ۷, ۱۵۰ (۲۰۲۰) ...
  • Z. Sarikhani, M. Manoochehri, Int. J. New. Chem. ۷, ۳۰ ...
  • F. Z. Benhachem, T. Attar, F. Bouabdallah, Chem. Rev. Let. ...
  • M. Nabati, E. Pournamdari, V. Bodaghi-Namileh, Y. Dashti-Rahmatabadi, S. Sarshar, ...
  • F. Krika, A. Krika, A. Azizi, Chem. Rev. Let. ۲, ...
  • نمایش کامل مراجع